Spinální svalová atrofie – jeden z padesáti lidí je nositelem varianty genu SMN1. Identifikace nosičů před plánováním rodiny a včasná diagnostika u novorozenců umožňuje přístup k genovým terapiím, které mohou zásadně změnit průběh onemocnění.
Sekvenování celého genomu umožňuje identifikovat delece genu SMN1 a počet kopií genu SMN2, což umožňuje zahájit léčbu ještě před nástupem příznaků pomocí genové terapie nebo léků ovlivňujících průběh onemocnění.
Spinální svalová atrofie (SMA)
Spinal muscular atrophy (SMA) is an autosomal recessive motor neuron disease caused by loss of function of SMN1 (survival motor neuron 1) gene, resulting in degeneration of anterior horn motor neurons. Incidence is approximately 1 in 6,000–10,000 live births; carrier frequency is approximately 1 in 50 across populations. SMA is characterized by progressive weakness, starting proximally and advancing distally, with respiratory and bulbar involvement in severe forms. The disease is classified into types based on age of onset and maximum motor function achieved: Type I (severe, onset <6 months, never able to sit independently, often fatal by age 2 without treatment), Type II (intermediate, onset 6–18 months, able to sit but never walk), Type III (mild, onset >18 months, able to walk), and Type IV (adult-onset). Approximately 95–98% of SMA cases are caused by homozygous deletion of SMN1 exons 7–8; the remaining cases result from homozygous or compound heterozygous point mutations. Disease severity is dramatically modulated by SMN2 copy number: SMN2 encodes an almost identical protein but with a critical splicing difference that produces mostly non-functional truncated protein; however, approximately 15% of SMN2 transcripts include exon 7, producing functional SMN protein.
SMN1 a SMN2 jsou téměř identické geny (99,9% sekvenční homologie), které se nacházejí v tandemu na chromozomu 5q13 – v oblasti s vysokou sekvenční homologií a častými variacemi v počtu kopií. Gen SMN kóduje protein survival motor neuron, který je klíčový pro biogenezi snRNP a sestřih mRNA v neuronech; ztráta proteinu SMN způsobuje degeneraci motorických neuronů. SMN2 je u většiny jedinců přítomen v několika kopiích (1–4 kopie, medián 2) v důsledku duplikace. Ačkoli SMN2 nemůže plně kompenzovat ztrátu SMN1 v důsledku deficitu sestřihu exonu 7, počet kopií SMN2 kriticky určuje závažnost onemocnění: 1–2 kopie obvykle vedou k typu I (závažný); 3 kopie vedou k typu II (střední); 3–4 kopie odpovídají typu III (mírný). Pacienti s presymptomatickou SMA, u nichž bylo při novorozeneckém screeningu zjištěno 2–3 kopie SMN2, jsou ohroženi typem I nebo II; u těch s ≥4 kopiemi je bezprostřední riziko nižší, i když včasná léčba může v každém případě zabránit projevu fenotypu.
Genotypizace genů SMN1/SMN2 je klíčová pro diagnostiku SMA a volbu léčby. K dispozici jsou tři schválené léčebné postupy: nusinersen (Spinraza), antisense oligonukleotid podávaný intratekálně, který moduluje sestřih genu SMN2 s cílem zvýšit začlenění exonu 7 a produkci plnohodnotného proteinu SMN2; onasemnogene abeparvovec (Zolgensma), genová terapie využívající AAV9 k intravenóznímu podání funkční cDNA SMN1 formou jednorázové infuze – jednorázový léčebný přístup, který je nyní preferován u presymptomatických pacientů; a risdiplam (Evrysdi), perorální modifikátor sestřihu umožňující domácí léčbu. Presymptomatická léčba (u novorozenců s diagnostikovanou SMA) přináší dramaticky lepší výsledky – u většiny léčených presymptomatických kojenců se nikdy nevyvinou pozorovatelné příznaky SMA a dosáhnou normálních nebo téměř normálních motorických milníků. Počet kopií SMN2 pomáhá předpovědět přirozenou závažnost onemocnění a slouží jako vodítko pro prognózu, ačkoli včasná léčba může zabránit expresi fenotypu i u pacientů, u nichž je předurčen typ I.
Standardní sekvenování nedokáže spolehlivě rozlišit gen SMN1 od genu SMN2 kvůli vysoké sekvenční homologii. Je nutná specializovaná analýza počtu kopií.
Stanovení počtu kopií genů SMN1 a SMN2 vyžaduje specializovanou analýzu
SMA je nyní ve většině amerických států zahrnuta do RUSP (doporučeného jednotného panelu novorozeneckého screeningu) a screening nosičství se stává stále běžnějším. Standardní sekvenování nedokáže spolehlivě rozlišit kopie genů SMN1 a SMN2 kvůli jejich 99,9% sekvenční homologii; jsou proto zapotřebí specializované techniky analýzy počtu kopií (komparativní genomová hybridizace, MLPA nebo cílené NGS se specializovaným mapováním sekvencí). Panely pro screening nosičů obvykle detekují deleci SMN1, ale nemusí přesně určit počet kopií SMN2. Sekvenování celého genomu se specializovanými algoritmy pro detekci počtu kopií může poskytnout přesné vyhodnocení počtu kopií SMN1/SMN2, což umožňuje komplexní screening nosičů a predikci závažnosti onemocnění.
Počet kopií genu SMN2 určuje závažnost onemocnění a slouží jako vodítko pro presymptomatickou léčbu
Počet kopií genu SMN2 je hlavním faktorem ovlivňujícím závažnost onemocnění: 1–2 kopie předurčují typ I (závažný, s nástupem v kojeneckém věku); 3 kopie předurčují typ II (středně závažný, nástup ve věku 6–18 měsíců); 3–4 kopie odpovídají typu III (mírný, schopnost chůze). Pacienti s presymptomatickou SMA, u nichž byly při novorozeneckém screeningu zjištěny 2–3 kopie SMN2, jsou vystaveni riziku rychlého progrese onemocnění a vyžadují okamžité zahájení léčby. Pacienti s ≥4 kopiemi mají nižší bezprostřední riziko, ale z časné léčby mají prospěch. Tři schválené terapie nabízejí transformativní výsledky: genová terapie (Zolgensma) je jednorázová léčba; antisense terapie (Spinraza) vyžaduje opakované intratekální infuze; perorální terapie (Evrysdi) umožňuje domácí léčbu. SMN genotyp zaznamenaný v lékařské dokumentaci umožňuje presymptomatickou diagnózu a rychlé zahájení terapie – čímž se zabrání rozvoji onemocnění a umožní normální motorický vývoj.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o spinální svalovou atrofii (SMA) či jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Pokud chcete kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů