Srpkovitá anémie – změna jediného nukleotidu v genu HBB, která mění strukturu červených krvinek, narušuje mikrocirkulaci a určuje celoživotní klinickou péči.
Sekvenování celého genomu umožňuje charakterizovat kompletní genotyp HBB – včetně kombinací složených heterozygot, lokusů ovlivňujících závažnost onemocnění a společně zděděných variant alfa-thalassémie, které standardní screening nosičství systematicky opomíjí.
Srpkovitá anémie
Srpkovitá anémie (SCD) je autozomálně recesivní hemoglobinopatie způsobená substitucí kyseliny glutamové za valin v kodonu 6 genu pro beta-globin (HBB p.Glu7Val; rs334). Tato varianta jednoho nukleotidu způsobuje polymerizaci hemoglobinu S (HbS) v podmínkách bez kyslíku, což deformuje erytrocyty do tuhého srpovitého tvaru. Tyto deformované buňky ucpávají malé krevní cévy, což vyvolává vazo-okluzivní krize, hemolytickou anémii a progresivní poškození orgánů téměř ve všech systémech – včetně sleziny, ledvin, plic, mozku a kostry. Srpkovitou anémií trpí každoročně přibližně 300 000 novorozenců po celém světě, přičemž nejvyšší prevalence je v subsaharské Africe, Indii a na Blízkém východě, ačkoli se vyskytuje ve všech populacích.
Genotypová struktura SCD je složitější než klasický obraz HbSS. Onemocnění HbSC (HBB Glu7Val/Glu6Lys) a HbS-beta-thalassémie (HbS/beta⁰ nebo HbS/beta⁺) vedou k odlišným klinickým fenotypům s různými profily závažnosti a důsledky pro léčbu. Závažnost je dále modulována hladinami fetálního hemoglobinu (HbF) — ovlivněnými variantami v BCL11A, HBS1L-MYB a samotném lokusu HBB — a společně zděděnou alfa-thalassemií (delecemi HBA1/HBA2), která snižuje polymerizaci HbS a je spojena s mírnějším průběhem onemocnění. Standardní testování nosičství dvou alel identifikuje základní variantu Glu7Val, ale není navrženo tak, aby zachytilo plnou genotypovou komplexitu, která určuje průběh onemocnění u jednotlivce.
Zjištění nosičství před těhotenstvím nebo v jeho průběhu představuje hlavní důvod pro genetické testování v rodinách, v nichž dosud nebyl zaznamenán žádný postižený člen. Standardními klinickými indikacemi jsou kaskádové testování v rodinách, u nichž je nosičství známo, a potvrzující genotypizace u novorozenců s pozitivním výsledkem screeningového vyšetření. U postižených pacientů se kompletní genotypizace – včetně lokusů modifikujících HbF a souběžně zděděné alfa-talasemie – stále častěji uznává jako relevantní pro předpověď reakce na hydroxyureu a pro stanovení kritérií vhodnosti pro transplantaci kostní dřeně.
HbSS, HbSC, talasemie HbS-beta⁰ a talasemie HbS-beta⁺ mají každá odlišnou klinickou prognózu. Genotyp HBB sám o sobě nedokáže předpovědět závažnost onemocnění; do celkového obrazu se promítají také modifikující lokusy a souběžně zděděné varianty.
Standardní screening nosičů odhalí variantu Glu7Val. Nezjišťuje však kompletní genotyp, modifikující lokusy ani souběžně zděděné varianty, které určují klinický průběh.
Heterozygotní stav je stejně důležitý jako status nosiče
Osoba, která zdědí jednu alelu HbS a jednu alelu beta-thalassemie, trpí srpkovitou anémií – nejedná se pouze o srpkovitý genotyp. Standardní testy na nosičství dvou variant jsou navrženy tak, aby identifikovaly substituci rs334 Glu7Val, nejsou však optimalizovány pro souběžnou charakterizaci alel beta-thalassemie v rámci celého genu HBB. Sekvenování celého genomu načte kompletní kódující a regulační sekvenci HBB a identifikuje jakoukoli společně zděděnou variantu beta-thalassémie vedle alely Glu7Val – čímž určí, zda riziko páru nositelů spočívá v HbSS, HbSC, HbS-beta thalassémii nebo HbS znaku.
Lokusy modifikátoru HbF a společné dědičnost alfa-talasemie nejsou standardními testy detekovatelné
Hladina fetálního hemoglobinu je nejvýznamnějším známým faktorem ovlivňujícím závažnost srpkovité anémie. Vysoká hladina HbF potlačuje polymerizaci HbS, čímž snižuje výskyt vazo-okluzivních příhod a poškození koncových orgánů. Hladiny HbF jsou regulovány běžnými variantami v genu BCL11A (rs1427407), v intergenové oblasti HBS1L-MYB (rs28384513) a v lokusu HBB na místě Xmn1. Závažnost onemocnění dále moduluje souběžně zděděná alfa-thalassémie (delece genů HBA1/HBA2). Žádný z těchto modifikátorových lokusů není zahrnut do standardních screeningů nosičů dvou alel ani do panelů hemoglobinopatií. Sekvenování celého genomu zachycuje všechny tyto lokusy současně s primárním genotypem HBB.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o srpkovitou anémii či jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
