Retinoblastom – nejčastější intraokulární nádorové onemocnění v dětském věku, u něhož stav genu RB1 v zárodečné linii určuje nutnost sledování výskytu sekundárních nádorů po celý zbytek života přeživšího pacienta.
Sekvenování celého genomu identifikuje všechny typy variant genu RB1 – včetně mozaikových mutací, které mohou standardní krevní testy přehlédnout – a vyřeší otázku rozlišení mezi germinálními a somatickými mutacemi, která určuje potřebu celoživotního onkologického sledování.
Retinoblastom
Retinoblastom (Rb) je nejčastějším zhoubným nádorem oka u dětí; postihuje přibližně 1 z 15 000–20 000 živě narozených dětí a každoročně je po celém světě diagnostikováno přibližně 8 000 nových případů. Vzniká z retinoblastů, nezralých prekurzorových buněk sítnice, v důsledku biallelické inaktivace tumor supresorového genu RB1 na chromozomu 13q14.2 – prvního tumor supresorového genu charakterizovaného na molekulární úrovni. Retinoblastom se projevuje leukokorií (bílým zornicovým reflexem), strabismem a ztrátou zraku, obvykle u dětí do 5 let. Při současné léčbě přesahuje celkové přežití v zemích s vysokými příjmy 95 %, i když výsledky se podstatně liší podle stadia onemocnění a dostupnosti zdrojů.
Přibližně 40 % případů retinoblastomu je dědičných – způsobených patogenní variantou v genu RB1 v zárodečné linii (konstituční). Dědičný retinoblastom je obvykle bilaterální (75–80 %) nebo multifokální, přičemž medián věku při stanovení diagnózy je nižší než u sporadických případů. Zbývajících ~60 % případů je sporadických (nehereditárních), způsobených dvěma somatickými mutacemi v genu RB1 v jedné sítnicové buňce. Unilaterální retinoblastom může být hereditární nebo sporadický – přibližně 15 % unilaterálních případů má germinální varianty genu RB1, přičemž tento podíl stoupá na téměř 100 % u bilaterálních případů. Přibližně 10–15 % jednostranných retinoblastomů bez detekovatelné germinální varianty nese somatické mozaikové mutace RB1, které jsou detekovatelné pouze v nádoru nebo při hlubokém sekvenování krve.
Zásadní rozdíl mezi dědičným a nedědičným retinoblastomem nespočívá v prognóze očního nádoru, ale v celoživotním riziku vzniku druhého nádorového onemocnění. U nositelů dědičné mutace genu RB1 se odhaduje 50% kumulativní riziko vzniku druhého primárního nádoru do věku 50 let, a to převážně osteosarkomů v oblasti ozáření, sarkomů měkkých tkání a melanomu. Toto riziko se výrazně zvyšuje v důsledku radiační terapie, které se u nositelů germinální mutace genu RB1 pokud možno vyhýbá. Přežití dědičného retinoblastomu vyžaduje celoživotní sledování: pravidelné zobrazovací vyšetření na nádory měkkých tkání a kostí, vyhýbání se UV záření a kaskádové genetické testování potomků s očním vyšetřením v kojeneckém věku. V současné době se zkoumají možnosti genové terapie a cílených přístupů k RB1 signální dráze.
Mosaické mutace RB1 – kdy se varianta v zárodečné linii vyskytuje pouze v části buněk – se vyskytují přibližně u 10–12 % případů dědičného retinoblastomu a při standardním sekvenování krve mohou být přehlédnuty. Detekci zlepšuje hloubkové sekvenování a analýza nádorové tkáně.
K určení, zda se u RB1 jedná o mozaikovou mutaci v zárodečné linii, či v somatické linii, je zapotřebí analýza jak krve, tak nádorové tkáně s hloubkou sekvenování, které standardní panely nemusí dosáhnout. Mozaikové varianty v krvi s alelovou frakcí 5–20 % konvenční testy nezachytí.
Varianty typu RB1 s mozaikovou expresí nejsou standardními testy zárodečné linie zachyceny – a mají klinické důsledky pro celou rodinu
Somatický mozaicismus u retinoblastomu – kdy se patogenní varianta genu RB1 objevila až po zygotickém stadiu a je přítomna pouze v části buněk – postihuje přibližně 10–12 % dědičných případů. Rodiče indexového pacienta s mozaikovým RB1 mohou sami trpět mozaikovým mozaicismem s velmi nízkým podílem variantních alel. Standardní sekvenování exomu a panelové sekvenování je kalibrováno pro heterozygotní varianty v zárodečné linii s podílem alel ~50 %; mozaikové varianty přítomné v podílu 10–20 % mohou klesnout pod prahovou hodnotu pro identifikaci variant. Hluboké sekvenování celého genomu s vylepšenou citlivostí na varianty s nízkým podílem alel zlepšuje detekci mozaiky. Přehlédnutí mozaikové varianty RB1 v zárodečné linii u rodiče by vedlo k nesprávnému poradenství ohledně rizika recidivy – další těhotenství by bylo prezentováno jako bezrizikové, zatímco ve skutečnosti může rodič variantu přenést.
Stav genu RB1 v zárodečné linii určuje volbu radiační terapie při léčbě nádorů
Externí radiační terapie retinoblastomu výrazně zvyšuje riziko vzniku sekundárního primárního nádoru u nositelů germinálních mutací genu RB1 v ozařované oblasti – zejména osteosarkomu v oblasti očnice. Z tohoto důvodu se při současné léčbě hereditárního retinoblastomu upřednostňují, je-li to možné, přístupy bez použití záření (intraarteriální chemoterapie, intravitreální podání melfalanu, fokální léčba), a to zejména s cílem předejít riziku sekundárního nádoru spojeného s ozářením. Rozhodnutí o této léčbě vyžaduje znalost stavu genového RB1 v době zahájení léčby – nikoli až o několik let později, kdy se objeví sekundární nádor. Sekvenování celého genomu poskytuje kompletní genotyp RB1, včetně detekce mozaiky, což umožňuje informované plánování léčby od prvního dne.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o retinoblastom či jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
