Farmakogenomika – varianty genů CYP450 a dalších genů podílejících se na metabolismu léčiv určují, jakým způsobem vaše tělo léky zpracovává. Znalost vašeho farmakogenomického profilu pomáhá lékaři vybrat od samého začátku ten správný lék a správnou dávku.
Sekvenování celého genomu určí váš fenotyp metabolizátora CYP450, což lékařům umožní vybrat a dávkovat léky, které budou u vás, s ohledem na vaši jedinečnou genetickou výbavu, působit bezpečně a účinně.
Farmakogenomika – reakce na léčiva
Skupina enzymů cytochromu P450, které se podílejí na metabolismu léčiv, je zodpovědná za metabolizaci více než 75 % všech schválených léků. Zvláště důležité jsou tři geny – CYP3A4, CYP2D6 a CYP2C19: CYP3A4 metabolizuje přibližně 50 % všech léků na trhu, zatímco CYP2D6 a CYP2C19 společně metabolizují dalších ~40 %. Tyto enzymy katalyzují oxidační reakce, které aktivují nebo deaktivují léky pro vylučování. Genetická variabilita těchto genů vytváří čtyři fenotypy metabolizátorů: špatní metabolizátoři (PM) s velmi nízkou enzymovou aktivitou, střední metabolizátoři (IM) se sníženou aktivitou, normální/intenzivní metabolizátoři (NM/EM, divoký typ) a ultrarychlí metabolizátoři (UM) se zvýšenou enzymovou aktivitou v důsledku duplikace genů nebo jiných strukturálních variant.
U genu CYP2D6 bylo v databázi PharmGKB identifikováno 962 variant, které zahrnují komplexní strukturální variace, včetně genových delecí (vedoucích k fenotypu PM), duplikací a vícenásobných duplikací (vedoucích k fenotypu UM) a hybridních genů (vedoucích k variabilní funkci). U genu CYP2C19 bylo identifikováno 753 variant, které ovlivňují převážně sestřih, translaci a substituce aminokyselin. CYP3A4 má 609 známých variant. Varianty se ztrátou funkce vyvolávají fenotypy s nízkou aktivitou; duplikace genů vyvolávají fenotypy ultrarychlých metabolizátorů. Fenotypy metabolizátorů mají závažné klinické důsledky: u pomalých metabolizátorů může při standardních dávkách docházet k hromadění toxických hladin léčiva, zatímco u ultrarychlých metabolizátorů může docházet k dosažení subterapeutických koncentrací.
Fenotyp metabolismu určuje bezpečné a účinné dávkování léků v desítkách různých tříd léčiv. Kodein, proléčivo aktivované enzymem CYP2D6, nemá u osob se špatným metabolismem žádný analgetický účinek – tito pacienti nedokážou kodein přeměnit na jeho aktivní metabolit morfin. Tricyklická antidepresiva a antipsychotika se u osob se špatným metabolismem CYP2D6 hromadí v krvi až do toxických hladin. Pacienti se špatnou metabolizací CYP2C19 nedokážou adekvátně aktivovat klopidogrel (Plavix), což snižuje jeho antiagregační účinek a zvyšuje riziko trombózy stentu. Konsorcium pro implementaci klinické farmakogenetiky (CPIC) vydává recenzovaná doporučení pro dávkování u více než 300 párů léků a genů, která pomáhají zdravotnickým pracovníkům optimalizovat výběr a dávkování léků.
Standardní testy zkoumají 10–30 „hvězdicových alel“ na jeden gen. Přehlížejí přitom nové a vzácné varianty, zejména u nedostatečně zastoupených populací.
Standardní panely nezachycují vzácné varianty a strukturální variace
Standardní farmakogenomické panely testují pouze 10–30 „hvězdicových alel“ (haplotypů) na jeden gen – předem definované kombinace běžných variant. Tento přístup zachycuje nejčastější varianty ve většině populací, ale opomíjí nové nebo vzácné varianty, zejména u nedostatečně zastoupených populací. CYP2D6 představuje zvláštní výzvu: variace počtu kopií (CNV – delece a duplikace) nelze spolehlivě detekovat pouze standardním sekvenováním; jsou zapotřebí specializované metody detekce počtu kopií. Pacient může být nositelem vzácných nových variant, které nejsou zastoupeny ve standardním panelu, což vede k nesprávné predikci fenotypu metabolizátora. Sekvenování celého genomu s analýzou počtu kopií poskytuje komplexní detekci variant, což umožňuje výpočet fenotypu na základě všech detekovaných variant, nikoli pouze předem definovaných haplotypů.
Dávky léků musí odpovídat vašemu genetickému metabolickému profilu
Fenotyp pomalého metabolizátora CYP2D6: kodein neposkytuje úlevu od bolesti; tramadol je neúčinný; některé antipsychotika a antidepresiva se hromadí do toxických hladin, což vyžaduje snížení dávky. Pacienti s pomalým metabolismem CYP2C19: aktivace klopidogrelu (Plavix) je narušena, což snižuje protidestičkový účinek a zvyšuje riziko trombózy stentu po PCI; upřednostňují se alternativní inhibitory P2Y12 (prasugrel, tikagrelor). U ultra-rychlých metabolizátorů CYP3A4 mohou být nutné vyšší dávky mnoha substrátů. Výsledky fenotypizace zaznamenané v lékařské dokumentaci a integrované do elektronických zdravotních záznamů (EHR) slouží jako vodítko pro budoucí předepisování a zabraňují chybám v dávkování, které způsobují selhání léčby nebo život ohrožující toxicitu.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – v oblasti farmakogenomiky – reakce na léky a dalších onemocnění, ať už vzácných, nebo běžných. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Pokud chcete kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
