Peutz-Jeghersův syndrom – dědičný hamartomový syndrom, který s sebou nese kumulativní riziko vzniku rakoviny přesahující 85 % v šesti orgánových systémech a u něhož je nutné zahájit sledování již v dětství.
Gen STK11 je uveden na seznamu sekundárních nálezů ACMG SF v3.2. Sekvenování celého genomu umožňuje kompletní charakterizaci genu STK11, včetně rozsáhlých genomových delecí, které představují přibližně 30 % případů PJS a které standardní sekvenační panely nedokážou spolehlivě detekovat.
Peutz-Jeghersův syndrom
Peutz-Jeghersův syndrom (PJS) je autozomálně dominantní dědičný syndrom charakterizovaný gastrointestinální polypózou a predispozicí k rakovině, který je způsoben patogenními variantami v genu STK11 (serin/threonin kináza 11, známá také jako LKB1) na chromozomu 19p13.3. Gen STK11 kóduje tumor supresorovou kinázu, která aktivuje AMPK a reguluje buněčnou polaritu a energetický metabolismus. PJS se vyznačuje vývojem charakteristických hamartomatózních polypů v celém gastrointestinálním traktu (zejména v tenkém střevě), výraznou mukokutánní pigmentací (melaninové skvrny na rtech, ústní sliznici, prstech a v perianální oblasti) a dramaticky zvýšeným rizikem vzniku rakoviny v mnoha orgánech. Prevalence PJS je přibližně 1 z 50 000–200 000.
Celkové celoživotní riziko vzniku rakoviny u PJS je mimořádně vysoké – odhaduje se na více než 85 % do věku 70 let u jakéhokoli druhu rakoviny. Mezi jednotlivá celoživotní rizika vzniku rakoviny patří: nádory trávicího traktu (tenké střevo ~13 %, tlusté střevo a konečník ~40 %, žaludek ~29 %), rakovinu slinivky břišní (~36 %), rakovinu prsu (~54 % u žen), gynekologické nádory (adenokarcinom děložního čípku ~10 %, dělohy ~9 %, nádor vaječníků s prstencovitými tubuly ~21 %) a rakovinu plic (~15 %). Sledování musí začít již v dětství a musí zahrnovat více orgánových systémů současně. Polypy tenkého střeva způsobují v dětství opakované intususcepce, které často vyžadují urgentní chirurgický zákrok — tomu lze předejít pravidelným sledováním tenkého střeva a profylaktickou polypektomií v případě zjištění velkých polypů.
Přibližně 94–96 % případů PJS splňujících diagnostická kritéria syndromu vykazuje identifikovatelnou patogenní variantu genu STK11. Velké delece nebo duplikace detekovatelné metodou MLPA nebo analýzou variací počtu kopií tvoří přibližně 30 % patogenních variant genu STK11 – tyto varianty standardní panely zaměřené pouze na sekvenování exonů nezachytí. Zbývajících ~4–6 % klinických případů PJS bez detekovatelných variant STK11 může představovat somatický mozaicismus, hluboké intronové varianty nebo genetickou heterogenitu. STK11 je zahrnut do seznamu sekundárních nálezů ACMG SF v3.2, což odráží dostupnost účinných preventivních opatření, která podstatně snižují úmrtnost na rakovinu u potvrzených nositelů.
30 % patogenních variant genu STK11 tvoří rozsáhlé delece, které standardní sekvenační panely nezachytí. U syndromu, u něhož je nutné zahájit onkologické sledování již v dětství, má opomenutá diagnóza celoživotní následky.
Každá třetí varianta genu STK11 způsobující PJS je delecí – standardní sekvenační panely je nezachycují
Přibližně 30 % potvrzených patogenních variant genu STK11 tvoří rozsáhlé genomové delece zasahující jeden nebo více exonů. Standardní sekvenační panely nové generace, které sekvenují kódující exony genu STK11, nedokážou spolehlivě detekovat rozsáhlé delece bez specializované analýzy variant počtu kopií. U několika publikovaných rodin s PJS s kompletním klinickým fenotypem – mukokutánní pigmentace, mnohočetné hamartomatózní polypy a charakteristická rodinná anamnéza – bylo zjištěno, že měly delece STK11, které předcházely negativním výsledkům panelu o měsíce až roky. U syndromu, u kterého začíná pediatrické sledování tenkého střeva ve věku 8 let (doporučení NCCN) a sledování slinivky břišní ve věku 35 let, má diagnostické zpoždění tohoto rozsahu přímé důsledky pro prevenci rakoviny.
Sledování v rámci programu PJS zahrnuje současně šest různých typů rakoviny – k zahájení celého protokolu stačí jediná definitivní diagnóza
Potvrzení molekulární diagnózy STK11 spouští protokol sledování více orgánů, který se podstatně liší od standardních doporučení pro screening rakoviny. Pokyny NCCN PJS doporučují: horní endoskopii a kolonoskopii od 8 do 10 let; endoskopii tenkého střeva/kapslovou endoskopii od 8 do 10 let; každoroční MRI prsu od 25 let a mamografii od 30 let; každoroční ultrazvukové vyšetření pánve nebo vyšetření endometria od 18 let; sledování slinivky břišní od 35 let (endoskopický ultrazvuk/MRI); a vyšetření varlat u mužů od narození (riziko SCTAT). Žádný standardní program screeningu rakoviny nezahrnuje všechny tyto položky – potvrzená molekulární diagnóza PJS je předpokladem pro zahájení komplexního protokolu, díky kterému má sledování smysl.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o Peutz-Jeghersův syndrom či jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
