Mitochondriální onemocnění – postihuje 1 z 5 000 lidí a je způsobeno mutacemi v mitochondriálním nebo jaderném genomu; sekvenování celého genomu je jediným testem, který umožňuje současně vyhodnotit oba genomy.
Sekvenování celého genomu zachycuje kompletní mitochondriální genom (37 genů) i všech více než 300 jaderných genů kódujících mitochondriální proteiny – čímž řeší diagnostický problém spojený s těmito dvěma genomy, kvůli kterému patří mitochondriální onemocnění k nejobtížnějším molekulárním diagnózám v medicíně.
Mitochondriální onemocnění
Mitochondriální onemocnění představují heterogenní skupinu poruch způsobených narušením oxidativní fosforylace (OXPHOS) – mitochondriálního energetického cyklu, který produkuje přibližně 90 % buněčného ATP. Tyto poruchy jsou geneticky jedinečné, protože funkce mitochondrií závisí na dvou genomech: mitochondriálním genomu (mtDNA, 37 genů kódujících 13 podjednotek OXPHOS, 22 tRNA a 2 rRNA) a jaderném genomu (kódujícím ~1 500 proteinů zaměřených na mitochondrie, včetně faktorů sestavujících OXPHOS, enzymů udržujících mtDNA a metabolických enzymů). Kombinovaná prevalence je přibližně 1 z 5 000, což řadí mitochondriální onemocnění mezi nejčastější dědičné metabolické poruchy.
Klinický obraz odráží energetické nároky tkání: postiženy jsou především orgány s vysokou metabolickou aktivitou. Mezi časté příznaky patří progresivní vnější oftalmoplegie (CPEO), ptóza, myopatie, kardiomyopatie, senzorineurální ztráta sluchu, diabetes mellitus, záchvaty, cévně mozkové příhody, ataxie, periferní neuropatie, degenerace sítnice a laktátová acidóza. Mezi jasně definované mitochondriální syndromy patří MELAS (mitochondriální encefalopatie, laktátová acidóza, epizody podobné cévní mozkové příhodě — typicky m.3243A>G v MT-TL1), MERRF (myoklonická epilepsie s ragged-red vlákny — m.8344A>G v MT-TK), Kearns-Sayreův syndrom (CPEO, pigmentová retinopatie, poruchy srdečního vedení – rozsáhlé delece mtDNA) a Leighův syndrom (progresivní neurodegenerace mozkového kmene a bazálních ganglií – více genetických příčin).
Genetická komplexnost mitochondriálních onemocnění představuje jedinečné diagnostické výzvy. Varianty mtDNA se dědí po matce a vyznačují se variabilní heteroplazmií (poměr mutované a divoké mtDNA v jednotlivých tkáních, který určuje klinickou závažnost onemocnění). Varianty jaderných genů se dědí standardním mendelovským způsobem. Stejný klinický syndrom může být způsoben buď variantami mtDNA, nebo jadernými variantami (např. Leighův syndrom má >90 genetických příčin). Postupné testování pouze mtDNA a poté jaderných panelů zpožďuje diagnózu o měsíce až roky. WGS vyhodnocuje oba genomy současně – je to jediný klinicky dostupný test, který tak činí.
Heteroplazmie mtDNA – poměr mutovaných a divokých typů mitochondriálních genomů – určuje klinickou závažnost onemocnění. Celogenomové sekvenování (WGS) kvantifikuje míru heteroplazmie a poskytuje prognostické informace, které by cílené testování mtDNA mohlo při nízké míře heteroplazmie opomenout.
Mitochondriální onemocnění je způsobeno mutacemi ve dvou odlišných genomech. Testování každého genomu zvlášť prodlužuje stanovení diagnózy o celé měsíce. Metoda WGS analyzuje mtDNA i jadernou DNA současně – je to jediný test, který to dokáže.
Vyhodnocení dvou genomů v jediném testu – WGS sekvenuje současně jak mtDNA, tak všech více než 300 jaderných mitochondriálních genů
Tradiční diagnostika mitochondriálních onemocnění zahrnuje postupné testování: nejprve sekvenování mtDNA, poté (v případě negativního výsledku) testy panelů jaderných genů a následně (pokud je výsledek stále negativní) sekvenování celého exomu jaderné DNA. Každý krok trvá týdny až měsíce a mnoho pacientů tak musí snášet roky diagnostické odysey. WGS vyhodnocuje kompletní mitochondriální genom (včetně kvantifikace heteroplazmie) a všechny jaderně kódované mitochondriální geny v jediném testu z jediného vzorku krve. Toto paralelní vyhodnocení identifikuje současně jak varianty mtDNA, tak jaderné varianty, čímž eliminuje zpoždění způsobená postupným testováním.
Rozsáhlé delece mtDNA způsobují Kearns-Sayreův syndrom a CPEO – tyto poruchy nejsou zachyceny panely pro bodové mutace mtDNA
Jednotlivé rozsáhlé delece mtDNA (typicky „běžná delece“ o délce 4 977 bp nebo jiné specifické delece v rozmezí 1–10 kb) způsobují Kearns-Sayreův syndrom, chronickou progresivní vnější oftalmoplegii a Pearsonův syndrom. Standardní panely bodových mutací mtDNA (které testují specifické pozice nukleotidů) tyto delece nezjistí – vyžadují Southernův blot, PCR s dlouhým dosahem nebo sekvenování celého mitochondriálního genomu. WGS čte napříč celým mitochondriálním genomem a detekuje jak bodové varianty, tak strukturální přestavby, včetně delecí, duplikací a přestaveb.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o mitochondriální onemocnění nebo jiné nemoci, ať už vzácné či běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
