Li-Fraumeniho syndrom – varianta genu TP53 v zárodečné linii, která výrazně zvyšuje celoživotní riziko vzniku rakoviny v celé řadě orgánových systémů. Včasná diagnostika umožňuje zavedení komplexních protokolů sledování.
Sekvenování celého genomu umožňuje identifikovat varianty genu TP53 – a tím podporuje program sledování podle Torontského protokolu, který odhaluje nádorová onemocnění v jejich nejranějších, nejlépe léčitelných stádiích.
Li-Fraumeniho syndrom
Li-Fraumeniho syndrom je způsoben patogenními variantami v genu TP53, který kóduje protein p53 – „strážce genomu“. Gen TP53 za normálních okolností reaguje na poškození DNA zastavením buněčného dělení, aktivací opravných mechanismů nebo spuštěním apoptózy, pokud je poškození neopravitelné. Při dědičnosti v podobě patogenní varianty dochází ke ztrátě jedné kopie. To odpovídá Knudsonovu modelu nádorového supresoru s dvojím zásahem: jediná somatická mutace ve zbývající kopii odstraní veškerou funkci p53, čímž se eliminuje kritická brzda proliferace poškozených buněk. Výsledkem je syndrom s nápadně časným nástupem a výskytem více nezávislých primárních nádorů.
Li-Fraumeniho syndrom postihuje přibližně 1 z 5 000–20 000 osob, ačkoli je jeho prevalence pravděpodobně podhodnocena kvůli rozmanitým rodinným anamnézám a de novo variantám (7–20 % případů). Pět hlavních typů nádorů tvoří sarkomy měkkých tkání, osteosarkomy, mozkové nádory, premenopauzální karcinom prsu a karcinomy kůry nadledvin – spektrum onemocnění se však rozšiřuje prakticky na všechny typy tkání. Celoživotní riziko vzniku rakoviny se u žen blíží 100 % a u mužů ~75 % do věku 70 let. U mnoha postižených jedinců se v průběhu života vyvine více nezávislých primárních nádorů, někdy již před 40. rokem věku.
Potvrzená diagnóza varianty genu TP53 umožňuje zapojení do Torontského protokolu – komplexního programu sledování, který zahrnuje každoroční celotělové MRI, MRI mozku a MRI prsu od 20 let věku, jakož i ultrazvukové vyšetření břicha. Toto sledování odhaluje nádorová onemocnění v raném stadiu, kdy jsou prognózy nejpříznivější, a významně tak zvyšuje celkové přežití. Je zásadně důležité minimalizovat expozici záření: buňky s deficitem TP53 jsou hypersenzitivní na sekundární nádory vyvolané zářením, což činí CT vyšetření a radiační terapii obzvláště nebezpečnými. Kaskádové testování příbuzných prvního stupně, včetně dětí, identifikuje další osoby v riziku ještě předtím, než se objeví příznaky.
Patogenní varianty genu TP53 představují převážně missense mutace v doméně vázající DNA, zahrnují však také zkrácené varianty, varianty v místech sestřihu a delece celého genu – u každé z nich existují potenciální rozdíly mezi genotypem a fenotypem, které ovlivňují intenzitu sledování.
Standardní testy mohou varianty genu TP53 zcela opomenout, nebo mohou detekovat somatické varianty v klonální hematopoéze, které napodobují nálezy v zárodečné linii – což vyžaduje rozlišení tkání, které standardní sekvenování nedokáže zajistit.
Gen TP53 vykazuje nejvyšší podíl variací s neznámým významem (VUS) ve standardních panelech
Ačkoli je gen TP53 zahrnut do většiny panelů pro screening dědičných nádorových onemocnění, vykazuje jednu z nejvyšších frekvencí variant nejasného významu (VUS) – což pacientům i lékařům přináší nejednoznačné výsledky. Kromě toho může klonální hematopoéza s neurčitým potenciálem (CHIP) produkovat somatické varianty TP53 v krvi s nízkými alelickými frakcemi, které napodobují patogenní varianty v zárodečné linii. Standardní sekvenování nedokáže rozlišit mezi variantami v zárodečné linii (přítomnými ve všech buňkách) a mozaikovými variantami (přítomnými pouze v části buněk). Sekvenování celého genomu s analýzou specifickou pro daný typ buněk dokáže tyto varianty rozlišit a poskytnout definitivní odpovědi.
Objev týkající se genu TP53 zcela mění přístup k léčbě rakoviny
Potvrzení patogenní varianty genu TP53 umožňuje realizaci Torontského protokolu – jednoho z nejkomplexnějších programů sledování nádorových onemocnění v medicíně. Každoroční celotělové screeningové vyšetření pomocí magnetické rezonance detekuje karcinomy kůry nadledvin ve věku, kdy se vyskytují u kojenců a malých dětí – tedy v době, kdy je včasná detekce nejvíce zachraňuje život. Identifikuje rakovinu prsu v raném stadiu, mozkové nádory a sarkomy dříve, než se rozvinou. Stejně důležité je, že umožňuje při plánování léčby vyhnout se ozáření, čímž předchází sekundárním nádorům vyvolaným ozářením u populace, která je vůči nim obzvláště citlivá.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o Li-Fraumeniho syndrom či jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Pokud chcete kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
