Homocystinurie – při této poruše genotyp CBS určuje, zda pacient reaguje na léčbu vitamínem B6 s téměř normálními výsledky, nebo zda potřebuje celoživotní dietu s omezeným příjmem methioninu a doplňky betainu.
Sekvenování celého genomu umožňuje identifikovat konkrétní variantu CBS – a tím odlišit homocystinurii reagující na pyridoxin (B6) od té, která na něj nereaguje – což představuje nejdůležitější prognostický a terapeutický rozdíl u tohoto onemocnění.
Homocystinurie
Klasická homocystinurie je autozomálně recesivní porucha metabolismu methioninu způsobená deficitem cystathionin-β-syntázy (CBS, chromozom 21q22.3). Enzym CBS katalyzuje kondenzaci homocysteinu se serinem za vzniku cystathioninu – což představuje první krok transsulfurační dráhy. Nedostatek CBS způsobuje hromadění homocysteinu a methioninu v krvi a tkáních. Homocystinurie postihuje přibližně 1 z 200 000–300 000 narozených dětí po celém světě, přičemž vyšší prevalence je v Irsku (~1 z 65 000) a Kataru (~1 z 1 800). Pyridoxin (vitamín B6) je kofaktorem pro CBS a přibližně 50 % pacientů má formy reagující na B6, které si zachovávají částečnou aktivitu CBS.
Neléčená homocystinurie vyvolává charakteristický klinický syndrom: ektopii čočky (posun čočky – typicky směrem dolů, což ji odlišuje od Marfanova syndromu, kde dochází k posunu čočky směrem nahoru), marfanoidní kostní rysy (vysoký vzrůst, dlouhé končetiny, deformita hrudníku, skolióza), tromboembolismus (hlavní příčina úmrtnosti — zvýšená hladina homocysteinu podporuje poškození endotelu a aktivaci srážení) a mentální postižení (variabilní, od normální inteligence po těžké postižení). Riziko tromboembolie trvá po celý život: cévní mozková příhoda, plicní embolie a hluboká žilní trombóza způsobují významnou morbiditu a mortalitu, zejména během chirurgického zákroku, těhotenství nebo imobilizace.
Léčba závisí v zásadě na citlivosti na vitamín B6. Pacienti reagující na vitamín B6 (přibližně 50 %) jsou léčeni vysokými dávkami pyridoxinu (100–500 mg/den), což zvyšuje zbytkovou aktivitu CBS a normalizuje nebo téměř normalizuje hladiny homocysteinu v plazmě – tito pacienti mají podstatně lepší výsledky, včetně zachování intelektu, sníženého rizika tromboembolie a často i bez nutnosti dietního omezení methioninu. Pacienti, kteří na vitamín B6 nereagují, vyžadují celoživotní dietu s omezeným příjmem methioninu, suplementaci betainem (který poskytuje alternativní cestu pro remetylaci homocysteinu), folátem a vitamínem B12. Rozlišení mezi formami reagujícími a nereagujícími je klíčovým rozhodnutím při léčbě a je určeno specifickým genotypem CBS.
U homocystinurie dochází k posunu čočky typicky směrem dolů (inferonazálně), zatímco u Marfanova syndromu je to směrem nahoru (superotemporálně). U každého pacienta s posunem čočky by mělo být provedeno měření hladiny homocysteinu v plazmě – tento jediný laboratorní test umožňuje rozlišit tyto dvě onemocnění.
Reakce na vitamín B6 určuje celý přístup k léčbě i dlouhodobou prognózu. Genotyp CBS předpovídá reakci s vysokou přesností, což umožňuje okamžitou optimalizaci léčby namísto měsíčního empirického zkoušení.
Varianty genu CBS reagující na vitamín B6 předpovídají téměř normální průběh onemocnění – varianty nereagující na vitamín B6 předpovídají nutnost celoživotního dietního omezení
Varianty CBS p.Ile278Thr a p.Ala114Val jsou spojeny s homocystinurií reagující na vitamín B6 a zachovávají si významnou zbytkovou enzymatickou aktivitu. U pacientů, kteří jsou homozygotní nebo složeně heterozygotní pro tyto varianty, dochází obvykle k biochemické normalizaci již při léčbě samotným pyridoxinem, přičemž dlouhodobé výsledky z hlediska intelektuálního vývoje a cévního systému jsou vynikající. Naproti tomu p.Gly307Ser (nejběžnější irská/evropská varianta) nereaguje na vitamín B6 a vyžaduje celoživotní dietu s omezeným příjmem methioninu a betainu. Molekulární genotypizace umožňuje okamžitou stratifikaci léčby – namísto 6–8týdenní empirické léčby vitamínem B6, která oddaluje definitivní léčbu.
U nediagnostikované homocystinurie je chirurgické a anesteziologické riziko výrazně zvýšené – molekulární diagnostika zabraňuje perioperačním komplikacím
Zvýzená hladina homocysteinu výrazně zvyšuje perioperační riziko tromboembolických příhod. Pacienti s nediagnostikovanou homocystinurií, kteří podstupují chirurgický zákrok – zejména ortopedické operace spojené s imobilizací – jsou vystaveni extrémnímu riziku intraoperační nebo pooperační cévní mozkové příhody, plicní embolie či hluboké žilní trombózy. Několik kazuistik dokumentuje perioperační úmrtí u pacientů s dosud nediagnostikovanou homocystinurií. Molekulární diagnostika umožňuje vhodnou předoperační terapii ke snížení hladiny homocysteinu, perioperační antikoagulační léčbu a vyhnutí se anestézii oxidem dusným (který inhibuje methionin syntázu a akutně zhoršuje hladiny homocysteinu).
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o homocystinurii či jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
