Dědičná difúzní rakovina žaludku – u pacientů s funkční ztrátou genu CDH1 dosahuje celoživotní riziko vzniku rakoviny žaludku až 70 %; nádor se vyvíjí pod žaludeční sliznicí a při endoskopickém vyšetření není viditelný, dokud není chirurgicky neoperovatelný.
Sekvenování celého genomu identifikuje všechny varianty genu CDH1 – včetně rozsáhlých delecí a mozaikových mutací – a umožňuje tak stanovit diagnózu, na jejímž základě se doporučuje preventivní totální gastrektomie ještě předtím, než se endoskopicky nezjistitelný nádor rozvine.
Dědičná difúzní rakovina žaludku
Hereditární difúzní karcinom žaludku (HDGC) je syndrom predisponující k rakovině s autozomálně dominantním dědičným přenosem, způsobený patogenními variantami v genu CDH1 (E-kadherin) na chromozomu 16q22.1. Gen CDH1 kóduje protein zajišťující mezibuněčnou adhezi, který je zásadní pro integritu epitelu; jeho funkční ztráta vede k charakteristickému růstovému vzoru difúzního karcinomu žaludku (karcinom s prstencovými buňkami), který se vyznačuje slabou soudržností a infiltrativním růstem. HDGC byl poprvé definován v roce 1998 u rozsáhlého maorského rodu z Nového Zélandu a zůstává jedním z nejsmrtelnějších syndromů dědičného rakovinového onemocnění — celoživotní riziko rakoviny žaludku u nositelů patogenních variant CDH1 se odhaduje na 40–70 % u mužů a 45–70 % u žen. Medián věku nástupu onemocnění u familiárních případů je 38 let, ale byly zaznamenány i případy u pacientů ve věku kolem 20 let.
Klinickou výzvou u HDGC je skutečnost, že difúzní karcinom žaludku roste formou jednotlivých prstencových buněk, které pronikají do submukózy – jedná se o růstový vzorec, který nevytváří viditelnou masu a nelze jej spolehlivě odhalit standardní endoskopií. Endoskopické sledování, i při použití systematických protokolů pro odběr vzorků, přehlédne většinu časných lézí HDGC. Každá totální gastrektomie provedená profylakticky u nositelů patogenní varianty CDH1 odhalí při patologickém vyšetření skrytá ložiska buněk typu signet ring – což znamená, že i „normálně“ vypadající žaludky skrývají mikroskopický karcinom prakticky u všech nositelů. Právě tato biologická skutečnost je důvodem pro doporučení profylaktické totální gastrektomie u nositelů CDH1 ve věku 18–40 let namísto sledování.
Ženy, které jsou nositelkami genu CDH1, čelí rovněž výrazně zvýšenému riziku lobulárního karcinomu prsu – odhadovanému na 42–56 % v průběhu života. Lobulární karcinom prsu, podobně jako difúzní karcinom žaludku, roste infiltrativním způsobem v jedné řadě, což standardní mamografie nemusí zachytit, a proto je magnetická rezonance prsu nezbytnou součástí sledování. CDH1 je zahrnut do seznamu sekundárních nálezů ACMG SF v3.2, což odráží konsenzus, že identifikace nositelů CDH1 před rozvojem rakoviny je klinicky využitelná a zachraňuje životy. Přibližně 40 % rodin splňujících klinická kritéria HDGC je CDH1-negativních; některé z těchto rodin mají varianty v CTNNA1 (alfa-E-katenin) nebo jiných genech, a je indikován komplexní genomický přístup.
Standardní panely pro detekci dědičného rakoviny nezachycují rozsáhlé delece genu CDH1 ani mozaikové varianty. U syndromu, u něhož je preventivní chirurgický zákrok podmíněn molekulárním potvrzením, má neúplný genetický výsledek přímé chirurgické důsledky.
Rozsáhlé delece genu CDH1 představují 10–15 % případů HDGC a při sekvenování exonů zůstávají nezjištěny
Přibližně 10–15 % patogenních variant genu CDH1 v rodinách s hereditárním germinálním karcinomem prsu (HDGC) tvoří rozsáhlé genomové delece zasahující jeden nebo více exonů. Panely pro sekvenování exonů, které nezahrnují analýzu delecí a duplikací metodou MLPA ani detekci variant počtu kopií, tyto varianty nezachytí. Navíc byl v některých rodinách dokumentován somatický mozaicismus – kdy je varianta CDH1 přítomna pouze v části buněk pacienta – který může být při standardní hloubce sekvenování přehlédnut. Sekvenování celého genomu umožňuje současnou detekci bodových mutací a analýzu variant počtu kopií v celém genu CDH1, čímž v jediném testu odhalí jak běžné intragenové varianty, tak strukturální přestavby.
Profylaktická gastrektomie vyžaduje molekulární potvrzení – negativní výsledek panelového testu není totéž jako skutečně negativní výsledek
Totální gastrektomie je závažný chirurgický zákrok s významnými dlouhodobými dopady na kvalitu života. U nositelů mutace v genu CDH1 se doporučuje, protože difúzní karcinom žaludku v časném stadiu není endoskopicky viditelný a preventivní sledování nedokázalo zabránit úmrtím v rodinách známých nositelů. Toto doporučení je vhodné pouze v případě, že je potvrzena molekulární přítomnost patogenní varianty genu CDH1. Neúplný panel, který nehodnotil velké delece ani neprovedl komplexní analýzu CDH1, poskytuje falešnou jistotu rodině, ve které může patogenní varianta stále existovat, ale nebyla jednoduše detekovatelná omezeným testováním. Sekvenování celého genomu tuto nejednoznačnost odstraňuje.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o hereditární difúzní karcinom žaludku nebo jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
