Gaucherova choroba – lysozomální střádavé onemocnění způsobené mutacemi genu GBA. Identifikace konkrétní mutace určuje typ onemocnění, slouží jako vodítko pro enzymatickou substituční terapii a poskytuje podklady pro screening v rodině.
Sekvenování celého genomu identifikuje varianty genu GBA, které způsobují hromadění látek v lyzozomech – což umožňuje nasazení enzymatické substituční terapie nebo terapie zaměřené na snížení množství substrátu přizpůsobené vašemu genetickému podtypu.
Gaucherova choroba
Gaucherova choroba je autozomálně recesivní lysosomální střádavé onemocnění způsobené mutacemi v genu GBA, které kóduje glukocerebrosidázu – enzym rozkládající glukocerebrosid na glukózu a ceramid. Varianty genu GBA s ztrátou funkce narušují tento rozklad, což vede k hromadění glukocerebrosidu v makrofágech a dalších buňkách a vytváří charakteristické Gaucherovy buňky naplněné lipidy. Onemocnění se projevuje ve třech klinických typech: typ 1 (neuropatický, ~95 % případů) se vyznačuje hepatosplenomegalií, anémií, trombocytopenií a progresivním onemocněním kostí; typ 2 (akutní neuropatický, vzácný) je smrtelný ve věku 2–4 let; a typ 3 (chronický neuropatický) vykazuje progresivní neurologický úpadek spolu s postižením orgánů.
Gaucherova choroba postihuje celosvětově přibližně 1 z 40 000 až 1 z 60 000 osob, avšak prevalence je výrazně vyšší u aškenázských židovských populací (přibližně 1 z 850). Bylo identifikováno více než 400 variant genu GBA. Čtyři aškenázské zakladatelské mutace – N370S, 84GG, L444P a IVS2+1G>A – představují přibližně 96 % alel v této populaci. Genotyp předurčuje závažnost onemocnění: varianty typu 1 (ne-neuronopatické) si obvykle zachovávají zbytkovou enzymatickou aktivitu (~10–30 %), zatímco varianty typu 2/3 (neuronopatické) aktivitu výrazněji snižují nebo produkují nesprávně složený enzym. Zajímavé je, že heterozygotní nositelé GBA (přibližně 1–3 % obecné populace) mají 5–10krát vyšší riziko Parkinsonovy choroby, což odhaluje neočekávanou souvislost mezi lysozomální dysfunkcí a neurodegenerací.
Potvrzená diagnóza patogenní varianty genu GBA umožňuje zahájit enzymatickou substituční terapii (imiglucerázou, velaglucerázou alfa) nebo terapii zaměřenou na redukci substrátu (eliglustatem u typu 1, miglustatem u typů 1 a 3) – obě tyto terapie jsou schváleny FDA a přímo se zaměřují na molekulární důsledky ztráty funkce genu GBA. Varianty typu 1 (neuropatické) obvykle dobře reagují na léčbu, která snižuje hepatosplenomegalii, zlepšuje hematologické parametry a zastavuje progresi kostního onemocnění. Pro typ 2 (akutní neuropatický) v současné době neexistuje účinná léčba modifikující průběh onemocnění. Typ 3 vykazuje variabilní reakci na enzymatickou substituční terapii. Účinnost léčby koreluje s genotypem: N370S (mírnější) obvykle reaguje lépe než L444P (závažnější). Genetická diagnostika umožňuje včasné zahájení léčby a zabraňuje nevratným orgánovým a kostním komplikacím.
Genotyp GBA předurčuje klinický typ a reakci na léčbu – varianty typu 1 obvykle dobře reagují na enzymatickou substituční terapii nebo terapii zaměřenou na snížení množství substrátu, zatímco typ 2 zůstává neléčitelný a typ 3 vykazuje proměnlivou reakci.
Testování GBA je z technického hlediska náročné kvůli kontaminaci pseudogeny. Existuje více než 400 variant a standardní sekvenování často přináší nejednoznačné výsledky.
Sekvenování GBA vyžaduje specializované techniky k rozlišení skutečných variant od artefaktů způsobených pseudogeny
Sekvenování genu GBA je technicky náročné, protože gen GBA má na chromozomu 1 pseudogen (GBAP1), s nímž sdílí 96% sekvenční identitu. Při standardním sekvenování krátkých čtení dochází často k nesprávnému přiřazení sekvencí GBA a GBAP1, což vede k nejednoznačným nebo nesprávným výsledkům. Velké delece nebo komplexní přestavby nemusí být detekovány pouze sekvenováním exomu. Bylo identifikováno více než 400 variant GBA, z nichž mnohé jsou specifické pro určitou populaci. Pro přesnost diagnostiky je nezbytné specializované testování GBA s pečlivou bioinformatickou anotací a schopností sekvenování dlouhých čtení. Sekvenování celého genomu s vhodnými bioinformatickými kontrolami dokáže zachytit varianty GBA a zároveň kontrolovat kontaminaci pseudogenem.
Výběr léčby na základě genotypu výrazně zlepšuje výsledky
Potvrzená patogenní varianta genu GBA umožňuje enzymatickou substituční terapii (imigluceráza, velagluceráza alfa) nebo terapii zaměřenou na snížení hladiny substrátu (eliglustat, miglustat) – léky schválené FDA, které přímo působí proti hromadění glukocerebrosidu. Reakce na léčbu souvisí s genotypem: varianty typu 1 (ne-neuronopatické) obvykle reagují dobře, s rychlým ústupem hepatosplenomegalie a zlepšením hematologických a kostních parametrů. Mírnější varianty (N370S) obvykle reagují lépe než závažnější varianty (L444P). Včasné zahájení léčby zabraňuje nevratným orgánovým a kostním komplikacím. Heterozygotní nositelé GBA identifikovaní prostřednictvím kaskádového screeningu mohou mít prospěch ze zvýšeného neurologického sledování rizika Parkinsonovy choroby.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o Gaucherovu chorobu nebo jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Pokud chcete kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
