Deficit G6PD – nejčastější enzymová porucha u lidí, která postihuje 500 milionů lidí a způsobuje akutní hemolytické krize v důsledku užívání běžných léků, včetně antimalarik, antibiotik a chemoterapeutik.
Sekvenování celého genomu umožňuje určit kompletní genotyp G6PD – včetně třídy aktivity specifické pro danou variantu, která je nezbytná k rozlišení třídy I (závažná chronická hemolýza) od třídy II–III (hemolýza vyvolaná určitými spouštěči) a od třídy IV (normální aktivita) – a tím zajistit bezpečné předepisování oxidačních léků.
Nedostatek G6PD
Deficit glukózo-6-fosfátdehydrogenázy (G6PD) je nejčastější enzymopatií u lidí, která postihuje odhadem 400–500 milionů lidí po celém světě. Gen pro G6PD je lokalizován na chromozomu X (Xq28) a tento enzym představuje rychlostně limitující fázi pentózofosfátového cyklu, v jehož rámci vzniká NADPH – látka nezbytná pro regeneraci redukovaného glutathionu a ochranu červených krvinek před oxidačním poškozením. Červené krvinky s deficitem G6PD jsou velmi náchylné k oxidačnímu stresu, což vede k akutním hemolytickým epizodám, pokud jsou vyvolány oxidačními léky, infekcí nebo konzumací bobů (favismus). Neonatální hyperbilirubinémie je nejzávažnějším následkem v novorozeneckém období.
Over 200 G6PD variants have been characterized, classified by WHO into functional activity classes: Class I (severely deficient, <10% activity, associated with chronic non-spherocytic hemolytic anemia); Class II (severely deficient, <10% activity, acute hemolysis on oxidant exposure); Class III (moderately deficient, 10-60% activity, hemolysis only with strong oxidant triggers); Class IV (normal activity, 60-150%); Class V (increased activity). The most common Class II variants are G6PD Mediterranean (c.563C>T, most common in Mediterranean, Middle Eastern, and Indian populations), G6PD A- (c.202G>A + c.376A>G, most common in African ancestry), and G6PD Canton (c.1376G>T, common in Southeast Asian populations). G6PD A- causes Class III disease; G6PD Mediterranean causes Class II disease with more severe hemolytic episodes.
Mezi klinicky významné lékové interakce patří: primaquin a tafenoquin (profylaxe malárie – podle FDA vyžadují status G6PD třídy B (normální nebo mírný deficit)), rasburikáza (kontraindikována při deficitu G6PD – způsobuje akutní život ohrožující hemolýzu), dapson, nitrofurantoin, methylenová modř (důležitá jako antidotum při methemoglobinémii — nelze použít při deficitu G6PD) a několik chemoterapeutických látek (adriamycin, doxorubicin ve vysokých dávkách). Pro rasburikázu a G6PD existují pokyny CPIC úrovně A. FDA vyžaduje testování G6PD před předepsáním tafenoquinu (KrintafelL) k léčbě malárie.
G6PD je vázáno na chromozom X. Hemizygotní muži projevují plný fenotyp G6PD daný svou jedinou alelou. Heterozygotní ženy mají dva chromozomy X – jeden normální a jeden s deficitem G6PD – a nerovnoměrná inaktivace chromozomu X u nich vede ke vzniku spektra fenotypů od normálního až po úplný deficit G6PD.
Testování enzymatické aktivity měří aktivitu G6PD, nikoli však konkrétní variantu nebo třídu aktivity podle klasifikace WHO. K určení třídy aktivity, předpovědi závažnosti hemolýzy a stanovení doporučení ohledně vyhýbání se určitým lékům jsou zapotřebí údaje o konkrétních variantách získané sekvenováním celého genomu.
Testování enzymatické aktivity vykazuje u žen a během hemolytických epizod falešně normální výsledky
Stanovení aktivity enzymu G6PD – standardní test G6PD prováděný přímo u lůžka pacienta – má v klinické praxi dvě hlavní omezení. Za prvé, u heterozygotních žen, u nichž se inaktivace chromozomu X přiklání k normálnímu alelu, je naměřená enzymová aktivita v normě, ačkoli mají alel s deficitem G6PD, který by mohl způsobit významnou hemolýzu, pokud by se inaktivace chromozomu X během nemoci nebo při užívání léků posunula. Za druhé, během akutní hemolytické epizody jsou selektivně ničeny červené krvinky s nejzávažnějším deficitem G6PD — zbývající populace červených krvinek je obohacena o mladší buňky s menším deficitem a naměřená enzymatická aktivita může být falešně zvýšená (falešně normální). Molekulární genotypizace pomocí sekvenování celého genomu identifikuje specifickou variantu G6PD bez ohledu na naměřenou enzymatickou aktivitu — a poskytuje tak správnou klasifikaci i v případě, že enzymatické testy dávají zavádějící výsledky.
Konkrétní varianta genu G6PD určuje, které léky jsou bezpečné – ne všechny formy deficitu G6PD jsou stejné
G6PD A- (třída III, častá u osob afrického původu) způsobuje mírný enzymový deficit s hemolýzou vyvolanou pouze silnými oxidačními spouštěči, jako je vysoká dávka primaquinu – většina postižených jedinců snáší profylaktické dávky proti malárii při pečlivém sledování. G6PD středomořský typ (třída II) způsobuje závažný deficit s hemolýzou již při nižším oxidačním stresu, včetně terapeutických dávek léků, které by pacienti s G6PD A- snášeli. Rasburikáza (používaná k léčbě syndromu nádorové lýzy) je u všech pacientů s deficitem G6PD absolutně kontraindikována kvůli tvorbě peroxidu vodíku. Tyto klinické rozdíly specifické pro jednotlivé varianty vyžadují k implementaci molekulární genotypizaci – výsledek enzymatické aktivity neidentifikuje, která varianta G6PD je přítomna ani do které rizikové kategorie pacient spadá.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o nedostatek G6PD nebo jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
