Fanconiho anémie – komplexní porucha opravy DNA způsobená mutacemi v kterémkoli z 23 genů, přičemž konkrétní komplementační skupina určuje intenzitu přípravy na transplantaci kostní dřeně a protokol celoživotního sledování nádorových onemocnění.
Sekvenování celého genomu umožňuje současně analyzovat všech 23 genů skupiny komplementace Fanconiho anémie – jedná se o jediný praktický způsob, jak zjistit, který gen je za onemocnění zodpovědný, což má přímý vliv na plánování transplantace a průběžnou léčbu nádorového onemocnění.
Fanconiho anémie
Fanconiho anémie (FA) je autozomálně recesivní (a v jednom případě vázaná na chromozom X) porucha opravy DNA způsobená patogenními variantami v genech kódujících jakoukoli složku signální dráhy Fanconiho anémie-BRCA reagující na poškození DNA. FA je geneticky heterogenní – bylo definováno 23 komplementačních skupin (FANC-A až FANC-V, s dalšími podskupinami), které odpovídají 23 odlišným genům. Patogenní varianty FANCA představují přibližně 60–70 % případů FA; FANCC (~10 %) a FANCG (~10 %) jsou dalšími nejčastějšími. FA postihuje přibližně 1 z 130 000 narozených dětí, přičemž vyšší četnost se vyskytuje u specifických populací: FANCC c.711+4A>T je běžná u aškenázských Židů (četnost nosičů ~1 z 90) a delece FANCA jsou častější u španělských romských populací.
FA se vyznačuje různou kombinací: vrozených tělesných anomálií (vady palce a radiálního prstu, malý vzrůst, skvrny café-au-lait, malformace ledvin, srdeční vady – vyskytující se u přibližně 60–75 % pacientů); progresivního selhání kostní dřeně (aplastická anémie, typicky se projevující v prvním desetiletí života); a výrazně zvýšeného rizika rakoviny – zejména akutní myeloidní leukémie a spinocelulárního karcinomu hlavy a krku. Střední věk nástupu selhání kostní dřeně je přibližně 7 let. Transplantace hematopoetických kmenových buněk (HSCT) je jedinou léčbou vedoucí k vyléčení selhání kostní dřeně a rizika AML, ale pacienti s FA velmi špatně snášejí standardní chemoterapii a ozařování před transplantací kvůli deficitu opravy DNA — což vyžaduje speciálně navržené protokoly se sníženou intenzitou.
Konkrétní komplementační skupina FA má přímý klinický význam. FANCB je vázána na chromozom X (jediná komplementační skupina vázaná na chromozom X) – nositelky nemají zvýšené riziko vzniku rakoviny, ale hemizygotní muži jsou vážně postiženi. Patogenní varianty FANCD1 jsou biallelické BRCA2 – tito pacienti vykazují nejzávažnější fenotyp FA, nejčasnější selhání kostní dřeně a nejvyšší dodatečné riziko vzniku rakoviny (meduloblastom, Wilmsův tumor). Biallelické patogenní varianty FANCN jsou biallelické PALB2. Biallelické varianty FANCJ jsou biallelické BRIP1. Toto překrývání se známými geny pro dědičné nádorové onemocnění má důsledky pro heterozygotní členy rodiny – nositelé FANCD1/BRCA2, FANCN/PALB2 a FANCJ/BRIP1 mají heterozygotní riziko vzniku nádorového onemocnění.
Patogenní varianty genu FANCD1 představují biallelickou formu BRCA2 – nejzávažnější fenotyp familiární adenomatózní polypózy (FAP) s nejčasnějším nástupem rakoviny, včetně dětského meduloblastomu a Wilmsova nádoru. Nositeli jsou heterozygoti pro BRCA2 se zvýšeným rizikem rakoviny prsu a vaječníků.
23 komplementačních skupin vyžaduje současné vyšetření 23 genů. Postupné testování jednotlivých genů nebo testování s omezeným počtem genů je nepraktické. Sekvenování celého genomu identifikuje všechny geny způsobující metabolické poruchy v jediném testu, což umožňuje rychlé zařazení do komplementační skupiny.
Testování zlomenin chromozomů umožňuje diagnostikovat FA – ne však určit, který gen je postižen, což je nezbytné pro plánování transplantace
Zlatým standardem v diagnostice Fanconiho anémie je test na zlomy chromozomů (pomocí diepoksybutanu nebo mitomycinu C), který prokazuje charakteristickou poruchu opravy DNA typickou pro FA, avšak neurčuje, která komplementační skupina nebo který gen je za ni zodpovědný. Stanovení komplementační skupiny – historicky prováděné experimenty s buněčnou fúzí – je nezbytné pro návrh protokolu kondicionování HSCT (některé skupiny vyžadují upravené protokoly), plánování intenzity sledování rakoviny (FANCD1/FANCD2 ovlivňují rizikový profil) a kaskádové testování rodiny (k identifikaci příbuzných, kteří mohou být nositeli heterozygotních variant náchylnosti k rakovině). Sekvenování celého genomu současně vyhodnocuje všech 23 genů komplementačních skupin FA a umožňuje rychlé přiřazení do komplementační skupiny na základě jediného vzorku DNA.
Heterozygoty genu FA v rodině mohou být vystaveny riziku dědičného nádorového onemocnění, které vyžaduje zvláštní sledování
V rodinách pacientů s FA se vyskytují povinně heterozygotní nositelé. Pokud do komplementační skupiny FA patří geny BRCA2 (FANCD1), PALB2 (FANCN), BRIP1 (FANCJ) nebo BRCA1 (FANCS), představují heterozygotní členové rodiny riziko dědičného karcinomu prsu a vaječníků, které vyžaduje specializované sledování. Rodič dítěte postiženého FANCD1, který je obligátním heterozygotem BRCA2, potřebuje okamžitou péči o BRCA2-pozitivní dědičný nádor – roční MRI prsu, sledovací protokoly NCCN, zvážení chirurgického zákroku ke snížení rizika. Identifikace komplementační skupiny FA pomocí sekvenování celého genomu přímo vede k vhodnému poradenství ohledně dědičných nádorů pro všechny příbuzné prvního stupně, kteří jsou obligátními nosiči.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o Fanconiho anémii či jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů