Duchennova svalová dystrofie – nejčastější závažná forma dětské svalové dystrofie, u níž konkrétní varianta DMD určuje, pro kterou z nově se objevujících terapií založených na vynechávání exonů je dítě vhodným kandidátem.
Sekvenování celého genomu zachycuje celý gen DMD – největší gen v lidském genomu o délce 2,4 milionu bázových párů – a identifikuje všechny body zlomu delecí, duplikace a hluboké intronové varianty, které jsou rozhodující jak pro stanovení diagnózy, tak pro určení vhodnosti léčby.
Duchennova svalová dystrofie
Duchennova svalová dystrofie (DMD) je recesivní neuromuskulární onemocnění vázané na chromozom X, způsobené patogenními variantami v genu DMD na chromozomu Xp21.2, který kóduje dystrofin – strukturální protein nezbytný pro integritu membrány svalových vláken. Nedostatek dystrofinu vede k progresivní degeneraci svalových vláken, chronickému zánětu a nahrazení svalové tkáně fibrotickou a tukovou tkání. DMD je nejčastější závažná dětská svalová dystrofie, která postihuje přibližně 1 z 3 500–5 000 narozených chlapců po celém světě. Onemocnění se obvykle projeví ve věku 2–5 let slabostí proximálních svalů, která se projevuje obtížemi při běhu, chůzi do schodů a vstávání z podlahy (Gowersův příznak). Bez léčby dochází ke ztrátě schopnosti chůze ve věku 12–13 let a úmrtí v důsledku respiračního nebo srdečního selhání obvykle nastává v pozdním dospívání až v polovině dvacátých let.
Přibližně 60–70 % variant způsobujících DMD tvoří rozsáhlé delece zasahující jeden nebo více exonů, které se soustřeďují do dvou „hotspotových“ oblastí (exony 2–20 a exony 44–55). Rozsáhlé duplikace představují 5–15 % variant a zbývajících 20–30 % tvoří bodové mutace (nonsense, posun čtecího rámce, místo sestřihu). Pravidlo čtecího rámce odlišuje DMD od mírnějšího alelického onemocnění, Beckerovy svalové dystrofie (BMD): varianty mimo rámec, které eliminují produkci funkčního dystrofinu, způsobují DMD, zatímco varianty v rámci, které produkují zkrácený, ale částečně funkční dystrofin, způsobují BMD. Tato korelace genotypu a fenotypu určuje prognózu a stále více ovlivňuje výběr léčby.
Oblast léčby DMD prošla zásadní proměnou díky přesným terapiím zaměřeným na konkrétní genotypy. Antisense oligonukleotidy pro přeskočení exonu — eteplirsen (exon 51, ~13 % pacientů s DMD), golodirsen/viltolarsen (exon 53, ~8 %) a casimersen (exon 45, ~8 %) — obnovují čtecí rámec tak, aby produkoval zkrácený, ale funkční dystrofin, čímž mění fenotyp DMD na BMD. Ataluren cílí na varianty s nesmyslným (předčasným stop kodonem), které tvoří přibližně 10–15 % případů. Terapie nahrazením genu (delandistrogene moxeparvovec, schválena v roce 2023) využívá mikro-dystrofin dodávaný prostřednictvím vektoru AAV. Každá z těchto terapií vyžaduje definitivní charakterizaci varianty DMD k určení způsobilosti – což činí genetickou diagnostiku nejen diagnostickou, ale přímo terapeutickou.
Pravidlo čtecího rámce určuje, zda varianta genu DMD způsobuje Duchennovu (závažnou, mimo rámec) nebo Beckerovu (mírnější, v rámci) svalovou dystrofii. Přesná charakteristika místa zlomu určuje vhodnost pro terapii přeskočením exonů – toto rozhodnutí závisí na tom, které exony jsou postiženy.
Standardní testování delecí a duplikací identifikuje dotčené exony, nikoli však přesné intronové zlomy. Varianty v hlubokých intronech, které způsobují abnormální sestřih, zůstávají panelům zaměřeným na exony skryty. Sekvenování celého genomu poskytuje kompletní obraz variant.
Přesné body přerušení při deleci určují, zda je možné přeskočit exon – samotné testování na úrovni exonů nestačí
MLPA (multiplexní amplifikace sond závislá na ligaci) – standardní diagnostický test první linie pro DMD – identifikuje, které exony jsou vynechány nebo duplikovány, nedokáže však určit polohu zlomových bodů v intronech s přesností na úroveň párů bází. Pro posouzení vhodnosti pro terapii vynecháváním exonů je rozhodující přesná poloha zlomového bodu, která určuje, zda terapeutické vynechání exonu může obnovit čtecí rámec. Kromě toho MLPA nedokáže spolehlivě detekovat komplexní přestavby — inverze, nesouvislé delece a inzerce-delece. Sekvenování celého genomu mapuje zlomy delecí na úrovni nukleotidů napříč všemi 79 exony DMD a 2,2 miliony mezilehlých párů bází intronové sekvence.
20–30 % variant DMD tvoří bodové mutace, k jejichž detekci je nutné sekvenování celého genu
U jedné třetiny pacientů s DMD se vyskytují bodové mutace – varianty typu „nonsense“, posun čtecího rámce nebo varianty v místě sestřihu – spíše než rozsáhlé delece či duplikace. Metoda MLPA bodové mutace nedetekuje; u těchto pacientů je jako druhý diagnostický krok nutné provést kompletní sekvenování genu DMD. Z pacientů s bodovými mutacemi mohou být ti s variantami obsahujícími předčasný stop-kodon (nonsense) vhodnými kandidáty pro léčbu přípravkem Ataluren. Hluboké intronové varianty, které vytvářejí kryptická místa sestřihu, představují další kategorii detekovatelnou pouze sekvenováním nad rámec kódujících exonů. Sekvenování celého genomu zachycuje delece, duplikace, bodové mutace a hluboké intronové varianty v jediném testu – čímž eliminuje postupnou diagnostickou cestu s více testy.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o Duchennovu svalovou dystrofii nebo jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
