Cystická fibróza – v některých populacích dosahuje četnost nosičství genu CFTR až 1 z 25 osob. Komplexní detekce variant genu CFTR před plánováním rodiny odhalí nosičství, které by standardní screeningové testy mohly přehlédnout.
Sekvenování celého genomu identifikuje všechny známé varianty genu CFTR, což umožňuje screening nosičů, plánování rodičovství a přístup k přesné léčbě pomocí modulátorů CFTR.
Cystická fibróza
Cystická fibróza (CF) je autozomálně recesivní multisystémové onemocnění postihující plíce, slinivku břišní, játra, reprodukční systém a potní žlázy. Prevalence je přibližně 1 z 2 500–3 500 v kavkazské populaci; frekvence nosičství je přibližně 1 z 25 Kavkazanů. Onemocnění je způsobeno biallelickými patogenními variantami v genu CFTR, který kóduje regulátor transmembránové vodivosti cystické fibrózy, chloridový kanál kritický pro správnou rovnováhu tekutin a elektrolytů v epitelových tkáních. Bylo identifikováno více než 2 000 variant genu CFTR. F508del (delece fenylalaninu 508) je zdaleka nejčastější, představuje přibližně 70 % alel CF na celém světě a vyskytuje se u přibližně 90 % pacientů s CF (buď heterozygotně, nebo homozygotně). Klinicky se CF projevuje progresivním onemocněním plic (opakované infekce, bronchiektázie), pankreatickou nedostatečností (malabsorpce, diabetes) a ztrátou solí. Medián délky života se prodloužil z kojeneckého věku v 80. letech na přibližně 50 let v současnosti, a to především díky agresivní léčbě plicních onemocnění a stále častěji také díky terapiím s modulátory CFTR, které proměnily CF z fatálního dětského onemocnění v zvládnutelné chronické onemocnění.
Gen CFTR kóduje chloridový kanál o délce 1 480 aminokyselin, regulovaný cAMP, který se nachází na apikálních membránách epitelových buněk. Varianty se klasifikují podle mechanismu: třída I (nonsense, posun čtecího rámce, kanonické místo sestřihu) nevytváří žádný protein; třída II (defekty zpracování včetně F508del) způsobují nesprávné skládání a degradaci v endoplazmatickém retikulu; třída III (defektní řízení kanálu) narušuje otevírání; třída IV (snížená vodivost) umožňuje částečný tok chloridů; třída V (snížené množství) produkuje nízké hladiny funkčního proteinu. F508del je varianta třídy II způsobující nesprávné skládání a předčasnou degradaci. Protein CFTR je naprosto zásadní pro sekreci chloridů; ztráta funkce vede k dehydratovaným, viskózním sekrecím v dýchacích cestách a vývodech, což způsobuje obstrukci, infekci a zánět. V současné době jsou schváleny tři léky modifikující CFTR, které zásadně změnily výsledky léčby: ivakaftor aktivuje mutace brány; lumakaftor/ivakaftor koriguje nesprávné skládání F508del; elexakaftor/tezakaftor/ivakaftor se vztahuje na přibližně 90 % pacientů s CF.
Genotypizace CFTR je klíčová pro diagnostiku cystické fibrózy a stále častěji i pro volbu léčby. Ivakaftor (Kalydeco) aktivuje specifické mutace typu „gating“ (G551D, G1244E a další) a přináší prospěch přibližně 4–6 % pacientů s cystickou fibrózou. Lumacaftor/ivacaftor (Orkambi) je určen pro homozygotní pacienty s mutací F508del – přibližně 15 % pacientů s CF – a vede ke zlepšení FEV1 přibližně o 6 bodů. Elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor (Trikafta), schválený pro pacienty s CF s alespoň jednou kopií mutace F508del, rozšiřuje způsobilost na přibližně 90 % pacientů s CF; Trikafta přináší zlepšení FEV1 přibližně o 10 bodů a dramaticky změnila situaci v oblasti CF – od schválení se zdá, že úmrtnost klesá. Genotyp CFTR přímo určuje, ke kterým modulátorům má pacient přístup, což činí genetické testování nezbytným pro vedení terapie a umožňuje individuální výběr léčby.
Standardní testy na cystickou fibrózu (CF) detekují 23–32 běžných variant. Nezachycují vzácné mutace a vykazují nízkou citlivost u populací neevropského původu.
Standardní panely nezachycují vzácné varianty genu CFTR a vykazují mezery v informacích o původu
Standardní screeningové panely pro nosičství CF testují 23–32 běžných variant (například rozšířený panel ACMG-23). Tato strategie zachytí přibližně 88 % nosičů u bělochů, ale pouze přibližně 64 % u hispánské populace, přibližně 49 % u afroamerické populace a přibližně 30 % u asijské populace – což představuje významnou nerovnost v oblasti zdravotní spravedlnosti. Rozšířené panely zahrnující více než 100 variant zlepšují detekci, ale stále jim unikají vzácné varianty. Současné standardní panely nehodnotí modifikátorové geny (jako TGFB1, MBL2), které ovlivňují závažnost onemocnění. Sekvenování celého genomu zachycuje všechny varianty CFTR včetně nových, poskytuje definitivní hodnocení statusu nosičství pro všechny populace a umožňuje komplexní hodnocení genetického rizika.
Genotyp CFTR určuje přístup k léčbě modulátory, která zásadně mění život
V současné době jsou schváleny tři léky typu CFTR modulátorů: ivakaftor pro specifické mutace typu gating (G551D, G1244E atd.), lumakaftor/ivakaftor pro homozygoty s mutací F508del a elexakaftor/tezakaftor/ivakaftor pro pacienty s alespoň jednou kopií mutace F508del. Trikafta je schválena pro přibližně 90 % pacientů s CF a od svého schválení snížila mortalitu a přinesla zlepšení FEV1 přibližně o 10 bodů. Genotyp CFTR přímo určuje, který modulátor je pro pacienta dostupný. Genotyp, který je zaznamenán v lékařské dokumentaci a sdělen pacientovi, umožňuje informovanou diskusi o terapeutických možnostech, očekáváních léčby a prognóze – čímž se předchází opožděné diagnóze a umožňuje včasný zásah, který může zachovat plicní funkce a dramaticky zlepšit výsledky léčby.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o cystickou fibrózu či jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Pokud chcete kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
