Cowdenův syndrom – ztráta funkce genu PTEN, která představuje jedno z nejvyšších celoživotních rizik vzniku rakoviny prsu ze všech dědičných syndromů, spolu se zvýšeným rizikem rakoviny děložní sliznice, štítné žlázy, tlustého střeva a konečníku a ledvin.
Gen PTEN je uveden na seznamu ACMG SF v3.2, který zahrnuje geny vyžadující hlášení sekundárních nálezů při klinickém sekvenování genomu. Sekvenování celého genomu umožňuje charakterizovat kompletní lokus PTEN – včetně variant v promotorové oblasti a rozsáhlých delecí, které standardní onkologické panely běžně nezachycují.
Cowdenův syndrom – syndrom PTEN hamartomů
Cowdenův syndrom (CS) – nejčastější z PTEN hamartomových nádorových syndromů (PHTS) – je autozomálně dominantní syndrom predisponující k rakovině, který je způsoben patogenními variantami genu PTEN (fosfatáza a homolog tensinu) v zárodečné linii na chromozomu 10q23.31. PTEN je tumor supresor, který reguluje signální dráhu PI3K/AKT/mTOR; ztráta funkce PTEN vede k nekontrolované buněčné proliferaci a tvorbě nádorů. Cowdenův syndrom je charakterizován mukokutánními lézemi (trichilemmomy, papilomatózní papuly a akrální keratózy), makrocefalií, benigními hamartomy v mnoha orgánech a podstatně zvýšeným rizikem vzniku mnoha zhoubných nádorů. Odhadovaná prevalence je 1 z 200 000, ačkoli molekulární diagnostika odhaluje výrazně vyšší četnost.
Celoživotní riziko vzniku rakoviny u nositelů patogenních variant genu PTEN patří k nejvyšším, jaká byla u jakéhokoli genu způsobujícího dědičnou rakovinu zaznamenána: riziko rakoviny prsu dosahuje 67–85 % (oproti průměru v populaci ~12 %); riziko rakoviny děložní sliznice se pohybuje kolem 28–44 %; riziko rakoviny štítné žlázy (převážně folikulární) dosahuje 21–38 %; riziko kolorektálního karcinomu je zvýšené (9–18 %); a riziko karcinomu ledvinových buněk je přibližně 34 %. Muži, kteří jsou nositeli této mutace, mají zvýšené riziko rakoviny prsu a jsou také vystaveni zvýšenému riziku rakoviny štítné žlázy a tlustého střeva a konečníku. Bannayan-Riley-Ruvalcaba syndrom (BRR) a Proteusův syndrom (PS) představují alelické poruchy PTEN s překrývajícími se, ale odlišnými klinickými rysy, které jsou všechny způsobeny patogenními variantami PTEN.
Přibližně u 25 % osob splňujících klinická diagnostická kritéria pro Cowdenův syndrom nelze identifikovat žádnou variantu kódující sekvence genu PTEN – u této skupiny se mohou vyskytovat varianty v promotorové oblasti genu PTEN, hluboké intronové varianty, rozsáhlé genomové přestavby nebo patogenní varianty v jiných genech spojených s PHTS (SDHB, SDHD, KLLN). Pokyny NCCN doporučují komplexní analýzu PTEN včetně testování na delece/duplikace jako součást kompletního vyhodnocení PHTS. Léčba potvrzených nositelů PTEN zahrnuje roční MRI prsu od 30 let, roční mamografie od 30–35 let, zvážení mastektomie ke snížení rizika, roční odběr vzorků endometria od 30–35 let a roční ultrazvuk štítné žlázy.
Mezi nádorové syndromy spojené s hamartomy PTEN patří Cowdenův syndrom, Bannayan-Riley-Ruvalcabaův syndrom, Proteusův syndrom a Proteusův-podobný syndrom – alelické stavy s překrývajícími se, avšak klinicky odlišitelnými projevy, které jsou všechny způsobeny patogenními variantami genu PTEN.
Varianty promotoru genu PTEN a rozsáhlé genomové přestavby představují až 25 % případů PHTS – jedná se o varianty, které standardní panely pro detekci dědičného rakoviny, které sekvenují pouze kódující exony genu PTEN, systematicky přehlížejí.
Varianty v promotorové oblasti genu PTEN nejsou zahrnuty do většiny panelů pro diagnostiku rakoviny
U pacientů s Cowdenovým syndromem, u nichž byly standardní panely pro sekvenování exonů genu PTEN negativní, byly identifikovány patogenní varianty v promotorové oblasti genu PTEN – zejména opakující se varianta c.-1019_-1018dupTA. Tyto varianty snižují transkripci genu PTEN, což vede k funkční haploinsuficienci, aniž by došlo ke změně kódující sekvence. Standardní panely pro rakovinu sekvenují pouze 9 kódujících exonů PTEN a kanonická místa sestřihu; nezahrnují promotorovou oblast ani intergenové regulační prvky. Sekvenování celého genomu čte kompletní lokus PTEN včetně promotoru, všech intronů a 3' UTR — oblastí, kde se nacházejí regulační patogenní varianty.
Řízení rizika vzniku různých druhů rakoviny vyžaduje potvrzení stavu genu PTEN v co nejranějším věku
Riziko vzniku rakoviny spojené s genem PTEN patří k nejvyšším ze všech dědičných syndromů a screening je nutné zahájit již ve třetím desetiletí života – tedy ještě předtím, než je u této populace možné klinicky zjistit většinu případů rakoviny prsu a děložní sliznice. NCCN doporučuje každoroční MRI prsu a mamografii od 30 let, přičemž sledování endometria by mělo začít ve věku 30–35 let. Tento agresivní plán sledování je odůvodněn údaji o celoživotním riziku, ale k jeho zavedení je nutná potvrzená patogenní varianta PTEN. Negativní výsledek neúplného panelu – který nehodnotil promotor PTEN ani strukturální přestavby – může poskytovat falešnou jistotu, která o několik let oddaluje nezbytné sledování.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Learn more →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o Cowdenův syndrom, PTEN hamartomový tumorový syndrom nebo jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
