Syndrom predispozice k nádorům BAP1 – nedávno popsaný dědičný syndrom s vysokou penetrací, při kterém jedna genová varianta zvyšuje riziko vzniku čtyř různých typů rakoviny současně, z nichž mnohé jsou v běžné populaci extrémně vzácné.
Sekvenování celého genomu identifikuje patogenní varianty genu BAP1 – uvedené na seznamu ACMG SF v3.2 – u syndromu, u něhož jediný genetický nález vede k zavedení sledování s ohledem na uveální melanom, mezoteliom, kožní melanom a karcinom ledvinových buněk.
Syndrom predispozice k nádorům BAP1
Syndrom nádorové predispozice BAP1 (BAP1-TPDS) je autozomálně dominantní dědičný onkologický syndrom způsobený patogenními variantami genu BAP1 (BRCA1-associated protein 1) v zárodečné linii na chromozomu 3p21.1. BAP1 je deubikvitináza, která se podílí na remodelaci chromatinu, reakci na poškození DNA a regulaci buněčného cyklu. Patogenní varianty genu BAP1 v zárodečné linii byly systematicky charakterizovány až od roku 2011 – syndrom je popsán relativně nedávno, což znamená, že v mnoha postižených rodinách se po generace vyskytovalo mnoho neobvyklých typů rakoviny bez dědičného vysvětlení. BAP1-TPDS je nyní uznáván jako syndrom s vysokou penetrací a predispozicí k více typům nádorů.
Spektrum nádorů u BAP1-TPDS je charakteristické – nositelé genové mutace čelí výrazně zvýšenému riziku vzniku: uveálního melanomu (očního melanomu postihujícího cévnatku, duhovku a řasnaté těleso; >50násobné riziko oproti běžné populaci), maligního pleurálního mezoteliomu (vzácného nádoru silně spojeného s expozicí azbestu, u kterého se nyní zjistilo, že se vyskytuje i u nositelů BAP1 s minimální nebo žádnou anamnézou expozice azbestu), kožního melanomu (mnohočetných primárních melanomů, často s charakteristickými melanocytárními atypickými intradermálními nádory s mutací BAP1 – lézemi „BAPoma“) a karcinomu ledvinových buněk (zejména subtypy s jasnými buňkami a chromofobní). Každý z těchto typů rakoviny je samostatně vzácný; jejich společný výskyt v jedné rodině je epidemiologickým signálem, který identifikoval BAP1-TPDS.
Klinické důsledky molekulární diagnostiky BAP1 jsou bezprostřední a týkají se více oborů. Při stanovení diagnózy se zahajuje roční oftalmologické vyšetření včetně fundoskopického vyšetření (sledování uveálního melanomu), roční dermatologické vyšetření s dermatoskopií (sledování kožního melanomu a BAPomu), zobrazovací vyšetření ledvin od třetího do čtvrtého desetiletí (sledování RCC), zvážení ročního zobrazovacího vyšetření hrudníku (sledování mezoteliomu u exponovaných nositelů) a kaskádové testování všech příbuzných prvního stupně. Je důležité, že mezoteliom asociovaný s BAP1 je uznáván jako odlišná klinická entita od mezoteliomu indukovaného azbestem — pacienti s mezoteliomem BAP1 bývají mladší, mají delší přežití po diagnóze a mohou mít odlišné profily reakce na chemoterapii.
Gen BAP1 byl jako gen způsobující dědičné nádorové onemocnění identifikován až po roce 2011, a proto není zahrnut do mnoha starších panelů pro screening dědičných nádorových onemocnění. Rodiny s uveálním melanomem, mezoteliomem nebo neobvyklým výskytem nádorových onemocnění mohou mít mutaci BAP1-TPDS, aniž by u nich kdy bylo provedeno odpovídající vyšetření.
BAP1 chybí ve starších panelech pro diagnostiku dědičných nádorových onemocnění – rodiny s neobvyklou anamnézou rakoviny nebyly nikdy vyšetřeny
Systematická charakterizace genu BAP1-TPDS byla zahájena teprve v roce 2011. Mnoho rodin s patogenními variantami BAP1 podstoupilo v předchozím desetiletí testy na dědičné nádorové onemocnění, které nezahrnovaly gen BAP1. Jedinci s rodinnou anamnézou zahrnující uveální melanom, mezoteliom nebo neobvyklé shlukování melanomu a rakoviny ledvin – hlavní spektrum nádorů BAP1 – mohli obdržet negativní výsledky testů provedených před rokem 2011 nebo z panelů, které nikdy nepřidaly BAP1 do svého seznamu genů. Sekvenování celého genomu vyhodnocuje celý genom a identifikuje patogenní varianty BAP1 bez ohledu na to, kdy bylo sekvenování provedeno, a bez omezení předem definovaným seznamem genů.
Potvrzený výsledek testu BAP1 spustí současně čtyři protokoly pro sledování rakoviny
Na rozdíl od syndromů dědičného rakovinového onemocnění, u nichž jeden gen predisponuje především k jednomu typu rakoviny, vyžaduje BAP1-TPDS koordinovaný sledovací program zahrnující čtyři odlišné typy rakoviny – uveální melanom (oftalmologie), kožní melanom (dermatologie), karcinom ledvinových buněk (urologie/radiologie) a mezoteliom (pneumologie/onkologie). Tato koordinace mezi různými obory začíná při první molekulární diagnostice a pokračuje každoročně po celý život. Každá metoda sledování se zaměřuje na typ rakoviny, který standardní populační screening nezahrnuje – žádný stávající obecný program screeningu rakoviny nezahrnuje uveální melanom a screening mezoteliomu není standardem u nediagnostikovaných nositelů genu BAP1. Molekulární diagnostika je předpokladem pro aktivaci této sítě sledování více orgánů.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými sdruženími jakékoli velikosti – ať už se jedná o syndrom predispozice k nádorům BAP1 nebo jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme sdružení v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských sdružení.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
