Riziko dědičného karcinomu ATM – gen zodpovědný za opravu poškození DNA, který je uveden na seznamu sekundárních nálezů ACMG, zvyšuje riziko vzniku rakoviny prsu, slinivky břišní a prostaty a má přímý vliv na citlivost na inhibitory PARP a chemoterapii na bázi platiny.
Sekvenování celého genomu umožňuje současně analyzovat všech 66 exonů genu ATM – jedná se o jediný způsob, jak spolehlivě detekovat celé spektrum variant genu ATM, včetně rozsáhlých delecí a variant hluboko v intronech, které standardní onkologické panely systematicky podceňují.
Riziko dědičného rakoviny u ATM
Gen ATM (ataxia-telangiectasia mutated) kóduje serin-threoninovou protein kinázu, která je hlavním regulátorem reakce na zlomy dvojité šroubovice DNA. Biallelické patogenní varianty ATM způsobují ataxii-telangiektázii (AT), vzácné závažné multisystémové onemocnění charakterizované cerebelární ataxií, okulomotorickou apraxií, imunodeficiencí, telangiektáziemi a výrazně zvýšeným rizikem rakoviny – zejména lymfoidních malignit. Heterozygotní patogenní varianty ATM, které se vyskytují přibližně u 0,5–1 % obecné populace, jsou spojeny s méně závažným, ale klinicky významným syndromem predispozice k rakovině, který byl přesně charakterizován teprve v posledních letech prostřednictvím rozsáhlých populačních genomických studií.
U heterozygotních nositelů genu ATM se celoživotní riziko vzniku rakoviny prsu odhaduje na 20–25 % (oproti přibližně 12 % v průměru populace), přičemž pokyny NCCN doporučují u těchto osob intenzivnější sledování rakoviny prsu (každoroční magnetická rezonance prsu od 40 let). Nositelé genu ATM také čelí zvýšenému riziku rakoviny slinivky břišní (přibližně 5–7 % v průběhu života, ve srovnání s ~1,5 % v průměru populace), zvýšenému riziku rakoviny prostaty u mužů (zejména u vysoce maligních nádorů) a potenciálně zvýšenému riziku rakoviny tlustého střeva a vaječníků. Gen ATM je nyní zahrnut do seznamu sekundárních nálezů ACMG SF v3.2, což odráží konsenzus, že u identifikovaných nositelů jsou oprávněné změny v klinickém managementu.
ATM má přímý význam i mimo stratifikaci rizika rakoviny – jedná se o teranostický biomarker. Nádory vznikající u pacientů s deficitem ATM mohou být obzvláště citlivé na látky, které využívají deficity v drahách opravy DNA: inhibitory PARP, chemoterapii na bázi platiny a inhibitory kinázy ATM, které jsou v současné době ve fázi klinických studií. Stav ATM v zárodečné linii nyní ovlivňuje rozhodnutí o léčbě rakoviny – olaparib je schválen FDA pro metastatický kastračně rezistentní karcinom prostaty u pacientů s patogenními variantami ATM a klinické studie hodnotí kombinace inhibitorů PARP pro karcinom pankreatu u nositelů ATM. Tato dvojí role – řízení rizika dědičné rakoviny a výběr léčby – činí kompletní genotypizaci ATM stále naléhavější.
ATM je gen sestávající z 66 exonů, u něhož bylo zdokumentováno více než 3 000 variant. Mnohé z těchto variant jsou varianty nejasného významu – k jejich správné interpretaci je nutné kompletní sekvenování genu v kontextu jeho funkce.
Gen ATM má 66 exonů a tisíce variant – v omezených panelech často dochází k přehlédnutí vzácných patogenních alel
Gen ATM patří k největším genům predisponujícím k rakovině; jeho délka činí 150 kilobází a obsahuje 66 kódujících exonů. Bylo zdokumentováno více než 3 000 sekvenčních variant genu ATM, z nichž většinu tvoří missense varianty s nejistým významem. Trunkující varianty (nonsense, frameshift, zásadní místo sestřihu) jsou při identifikaci jednoznačně klasifikovány jako patogenní. Velké delece ATM – detekovatelné pouze analýzou variant počtu kopií – představují významnou část patogenních variant ATM v případech familiárního rakoviny a nejsou spolehlivě detekovány standardním panelovým sekvenováním. Sekvenování celého genomu pokrývá všech 66 exonů se současnou analýzou variant počtu kopií, čímž se vyřeší celé spektrum variant ATM.
Stav genu ATM v zárodečné linii nyní určuje vhodnost léčby inhibitory PARP u rakoviny prostaty
Úřad FDA schválil olaparib (Lynparza) a rucaparib (Rubraca) pro léčbu metastatického kastračně rezistentního karcinomu prostaty u pacientů s patogenními variantami genu ATM, a to souběžně s variantami genů BRCA1/2. Díky tomuto schválení se testování germinálních mutací genu ATM stává pro pacienty s karcinomem prostaty přímým předpokladem pro léčbu – pacient, u kterého kompletní genetická analýza prokáže pozitivitu na ATM, může být vhodným kandidátem pro monoterapii inhibitory PARP namísto chemoterapie. Klinické studie také hodnotí inhibitory PARP specificky u karcinomu pankreatu s pozitivním genem ATM v zárodečné linii (oblast s velmi malým počtem schválených možností). Pro přesné určení somatického a zárodečného stavu a posouzení vhodnosti léčby je vyžadováno kompletní genotypování ATM – nikoli částečný panel, který může opomenout vzácné zkrácené nebo strukturální varianty.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o riziko dědičného rakovinového onemocnění ATM nebo jiné nemoci, ať už vzácné či běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
