Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

SLX1A

structure-specific endonuclease subunit SLX1A

Sammanfattning

Cytogenetisk position
16p11.2
Koordinater
Kromosom 16: 30 193 875–30 197 561 (GRCh38)
Exoner
6 exoner på 3,7 kb
Protein
275 aminosyror
Tidigare symboler
GIYD1
MANE Select-transkript
ENST00000251303.11NM_001014999.3
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser SLX1A ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är SLX1A uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 16, med en parentes där SLX1A finns. SLX1A och 51 gener i närheten på kromosom 16, från 29 695 718 till 30 695 717.Kromosom 1616p11.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.329,8 Mb30 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 MbQPRT: 29 662 957–29 698 704, framåt-strängQPRTC16orf54: 29 742 463–29 746 079, bakåt-strängC16orf54ZG16: 29 760 591–29 783 885, framåt-strängZG16KIF22: 29 790 137–29 805 388, framåt-strängMAZ: 29 805 637–29 811 176, framåt-strängPRRT2: 29 811 382–29 815 892, framåt-sträng: 29 812 261–29 820 092, framåt-strängPAGR1: 29 816 086–29 822 489, framåt-strängPAGR1: 29 817 239–29 830 627, framåt-strängMVP: 29 820 394–29 848 039, framåt-strängMVPCDIPT: 29 857 474–29 863 414, bakåt-strängCDIPTSEZ6L2: 29 871 159–29 899 582, bakåt-strängSEZ6L2ASPHD1: 29 900 363–29 919 864, framåt-strängASPHD1KCTD13: 29 903 877–29 926 236, bakåt-strängKCTD13TMEM219: 29 940 885–29 973 052, framåt-strängTMEM219TAOK2: 29 973 675–29 992 262, framåt-strängHIRIP3: 29 992 314–29 996 126, bakåt-strängINO80E: 29 994 983–30 005 794, framåt-strängINO80EDOC2A: 30 005 507–30 023 270, bakåt-strängDOC2AFIMP1: 30 023 198–30 027 736, framåt-strängFIMP1TLCD3B: 30 024 425–30 052 978, bakåt-sträng: 30 053 101–30 071 526, framåt-strängALDOA: 30 064 164–30 070 457, framåt-strängPPP4C: 30 075 967–30 085 391, framåt-strängTBX6: 30 085 793–30 091 933, bakåt-strängTBX6YPEL3: 30 092 314–30 096 915, bakåt-strängYPEL3GDPD3: 30 104 810–30 114 034, bakåt-strängGDPD3MAPK3: 30 114 104–30 123 506, bakåt-strängMAPK3CORO1A: 30 182 798–30 189 085, framåt-strängCORO1ABOLA2B: 30 192 928–30 194 306, bakåt-strängBOLA2BSLX1A: 30 193 875–30 197 561, framåt-strängSLX1ASULT1A3: 30 198 059–30 204 324, framåt-strängSULT1A3NPIPB13: 30 222 893–30 255 268, bakåt-strängCD2BP2: 30 341 365–30 355 851, bakåt-strängCD2BP2TBC1D10B: 30 357 102–30 370 529, bakåt-strängTBC1D10BMYL11: 30 370 332–30 377 991, framåt-strängMYL11ZNF48: 30 378 106–30 400 108, framåt-strängSEPTIN1: 30 378 135–30 395 991, bakåt-strängSEPTIN1ZNF771: 30 407 143–30 431 108, framåt-strängDCTPP1: 30 413 033–30 430 162, bakåt-strängSEPHS2: 30 443 631–30 445 874, bakåt-strängSEPHS2ITGAL: 30 472 658–30 523 567, framåt-strängITGALZNF768: 30 524 001–30 527 328, bakåt-strängZNF768: 30 525 923–30 534 852, bakåt-strängZNF747: 30 529 534–30 535 347, bakåt-strängZNF747ZNF764: 30 553 764–30 558 524, bakåt-strängZNF688: 30 569 281–30 572 734, bakåt-strängZNF688ZNF785: 30 573 740–30 585 806, bakåt-strängZNF689: 30 602 558–30 624 012, bakåt-strängZNF689: 30 610 211–30 610 351, bakåt-strängPRR14: 30 650 696–30 656 427, framåt-strängPRR14FBRS: 30 658 431–30 670 810, framåt-strängFBRSDiagram över SLX1A: 6 exoner på framåt-strängen av kromosom 16Exon 1: 30 193 875–30 194 272, 398 baserExon 2: 30 194 740–30 194 791, 52 baserExon 3: 30 194 886–30 195 227, 342 baserExon 4: 30 196 974–30 197 101, 128 baserExon 5: 30 197 270–30 197 357, 88 baserExon 6: 30 197 437–30 197 561, 125 baser1234565′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 1,1 kb av genens 3,7 kb, och 828 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av SLX1A

100Svår

Hur svår SLX1A är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Stora delar av SLX1A ligger där korta läsningar kan missa eller felplacera en förändring.

Det som adderar: andelen av SLX1A:s exoner i varje typ av svårt område

  • Mappbarhet100 %
  • Homologi100 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner7,5 %
  • GC-innehåll70 %

En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängen

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). SLX1A-genen: structure-specific endonuclease subunit SLX1A. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/slx1a

Vancouver

Dante Labs. SLX1A-genen: structure-specific endonuclease subunit SLX1A [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/slx1a

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test