Gen
NUP155
nucleoporin 155
- HGNC 8063↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000113569↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 9631↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 5p13.2
- Koordinater
- Kromosom 5: 37 288 137–37 371 106 (GRCh38)
- Exoner
- 35 exoner på 83 kb
- Protein
- 1 391 aminosyror
- Även känd som
- KIAA0791, N155
- MANE Select-transkript
- ENST00000231498.8NM_153485.3
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nup155.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs NUP155, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser NUP155 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är NUP155 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 8,1 kb av genens 83 kb, och 4 176 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av NUP155
15Måttlig
Hur svår NUP155 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Några av NUP155:s exoner ligger där korta läsningar kan missa eller felplacera en förändring.
Det som adderar: andelen av NUP155:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 100 %.1,5 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 60 %.19 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vikt 60 %.0 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 50 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 30 %.5,5 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 20 %.5,7 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av NUP155:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
Egenskaper kopplade till NUP155
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som NUP155 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). NUP155-genen: nucleoporin 155. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/nup155
Dante Labs. NUP155-genen: nucleoporin 155 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/nup155
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor