Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

NFATC2

nuclear factor of activated T cells 2

Sammanfattning

Cytogenetisk position
20q13.2
Koordinater
Kromosom 20: 51 386 963–51 542 719 (GRCh38)
Exoner
11 exoner på 155,8 kb
Protein
921 aminosyror
Även känd som
NF-ATP, NFATp, NFAT1
MANE Select-transkript
ENST00000371564.8NM_012340.5
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser NFATC2 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är NFATC2 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 20, med en parentes där NFATC2 finns. NFATC2 och 3 gener i närheten på kromosom 20, från 50 964 841 till 51 964 840.Kromosom 2020q13.2p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3351 Mb51,2 Mb51,4 Mb51,6 Mb51,8 MbKCNG1: 51 003 655–51 023 244, bakåt-strängKCNG1NFATC2: 51 386 963–51 542 719, bakåt-strängNFATC2ATP9A: 51 596 512–51 768 716, bakåt-strängATP9ASALL4: 51 782 331–51 802 578, bakåt-strängSALL4Diagram över NFATC2: 11 exoner på bakåt-strängen av kromosom 20Exon 11: 51 386 963–51 391 451, 4 489 baserExon 10: 51 398 643–51 398 730, 88 baserExon 9: 51 432 067–51 432 756, 690 baserExon 8: 51 435 188–51 435 314, 127 baserExon 7: 51 435 706–51 435 761, 56 baserExon 6: 51 454 548–51 454 688, 141 baserExon 5: 51 473 980–51 474 152, 173 baserExon 4: 51 475 458–51 475 660, 203 baserExon 3: 51 516 784–51 516 955, 172 baserExon 2: 51 523 081–51 524 110, 1 030 baserExon 1: 51 542 370–51 542 719, 350 baser1110864215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 7,5 kb av genens 155,8 kb, och 2 766 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av NFATC2

5Lätt

Hur svår NFATC2 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i NFATC2 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som adderar: andelen av NFATC2:s exoner i varje typ av svårt område

  • Mappbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner3 %
  • GC-innehåll23 %

En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängen

Egenskaper kopplade till NFATC2

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som NFATC2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). NFATC2-genen: nuclear factor of activated T cells 2. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/nfatc2

Vancouver

Dante Labs. NFATC2-genen: nuclear factor of activated T cells 2 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/nfatc2

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test