Gen
CT47A11
cancer/testis antigen family 47 member A11
- HGNC 27397↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000226929↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 255313↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- Xq24
- Koordinater
- Kromosom X: 120 933 840–120 937 158 (GRCh38)
- Exoner
- 3 exoner på 3,3 kb
- Protein
- 288 aminosyror
- Även känd som
- CT47.11
- MANE Select-transkript
- ENST00000457020.3NM_173571.2
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ct47a11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs CT47A11, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser CT47A11 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är CT47A11 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,3 kb av genens 3,3 kb, och 867 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av CT47A11
84Hög
Hur svår CT47A11 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av CT47A11s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.100 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.100 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.13 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.70 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.100 %
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). CT47A11-genen: cancer/testis antigen family 47 member A11. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/ct47a11
Dante Labs. CT47A11-genen: cancer/testis antigen family 47 member A11 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/ct47a11
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor