Genetické riziko lupusu (SLE) — lupus má približne 50 % dedičnosť a monogénne formy spôsobené deficitom komplementu alebo mutáciami génov TREX1 či DNASE1L3 si vyžadujú odlišné liečebné stratégie ako typický autoimunitný SLE.
Sekvenovanie celého genómu umožňuje vyhodnotiť gény komplementu (C1Q, C2, C4), gény interferonopatie (TREX1, DNASE1L3, RNASEH2A/B/C), HLA haplotypy (DRB1) a všetky ďalšie varianty spojené s lupusom – čím sa odlíši monogénny lupus od polygenického.
Lupus (SLE) — Genetické riziko
Systémový lupus erythematosus (SLE) je chronické autoimunitné ochorenie, ktoré postihuje približne 200 000 – 300 000 ľudí v USA, pričom dedičnosť je približne 50 %. Genetická architektúra zahŕňa ako polygenickú náchylnosť (HLA-DR2, HLA-DR3, ITGAM, STAT4, IRF5, BLK, TNFAIP3 a >100 ďalších GWAS lokusov), tak aj zriedkavé monogénne formy. Najsilnejším bežným genetickým rizikovým faktorom je oblasť HLA triedy II – HLA-DRB1*03:01 a HLA-DRB1*15:01, z ktorých každá zvyšuje riziko približne 2- až 3-násobne. Variácia počtu kópií v géne C4 (komponent komplementu 4) je hlavným genetickým determinantom – nízky počet kópií C4 podstatne zvyšuje riziko lupusu.
Monogénny lupus predstavuje približne 1–3 % všetkých prípadov SLE a jeho identifikácia má kľúčový význam. Deficit komplementu – najmä homozygotný deficit C1q (>90 % pacientov vyvinie lupus), C1r/C1s, C2 a C4 – spôsobuje závažný lupus s raným nástupom v dôsledku narušeného odstraňovania apoptotických zvyškov a imúnnych komplexov. Deficit TREX1 spôsobuje Aicardiho-Goutièresov syndróm/familiárny lupus s mrazivkami v dôsledku akumulácie endogénnych nukleových kyselín, ktoré aktivujú dráhu interferónu typu I. Deficit DNASE1L3 spôsobuje hypokomplementemický lupus s protilátkami proti dsDNA. Tieto monogénne formy majú špecifické patogénne mechanizmy, ktoré ovplyvňujú výber liečby.
Postupne sa objavujú dôsledky genetického subtypizovania lupusu pre liečbu. Anifrolumab (Saphnelo), protilátka proti receptoru interferónu typu I, je schválený FDA na liečbu stredne ťažkého až ťažkého SLE a z hľadiska mechanizmu pôsobenia je najvhodnejší u pacientov s vysokou interferónovou signatúrou – vrátane tých s variantmi dráhy interferónopatie (TREX1, IFIH1, RNASEH2). Lupus s deficitom komplementu môže reagovať na čerstvú mrazenú plazmu (nahradzujúcu chýbajúcu zložku komplementu) alebo inhibítory komplementu, ale NEREAGUJE na štandardnú imunosupresiu zameranú na autoimunitné dráhy. Belimumab (anti-BLyS) sa zameriava na aktiváciu B-buniek a môže byť obzvlášť účinný u pacientov s rizikovými variantmi BLK alebo BANK1.
Deficit C1q spôsobuje lupus u viac ako 90 % nositeľov – ide o najvyššiu penetranciu spomedzi všetkých génov zodpovedných za lupus. Tento lupus spôsobený deficitom komplementu má odlišný patogénny mechanizmus ako autoimunitný SLE a nemusí reagovať na štandardnú imunosupresívnu liečbu.
Monogénny lupus (deficit komplementu, interferonopatia) nereaguje na štandardnú imunosupresívnu liečbu. Molekulárna diagnostika identifikuje 1–3 % pacientov s lupusom, ktorí potrebujú inú liečbu – a nové genetické biomarkery pre cielené terapie, ako je napríklad anifrolumab.
Lupus spojený s deficitom komplementu si vyžaduje substitučnú liečbu komplementom, nie imunosupresiu – nesprávna liečba oddiaľuje účinnú terapiu o celé roky
U pacientov s deficitom C1q dochádza k vzniku ochorenia podobného lupusu v dôsledku zhoršeného odstraňovania apoptotických buniek a imúnnych komplexov – ide o problém s odstraňovaním odpadových produktov, nie o primárny autoimunitný útok. Štandardná imunosupresívna liečba lupusu (mykofenolát, cyklofosfamid) sa zameriava na nesprávny mechanizmus. Infúzia čerstvo zmrazeného plazmy (poskytujúca funkčný C1q) môže spôsobiť dramatické klinické zlepšenie. Bez genetického testovania na deficit komplementu sú týmto pacientom podávané stále silnejšie imunosupresívne lieky na „lupus rezistentný na liečbu“ – pričom správna diagnóza by úplne zmenila smer liečby.
Variabilita počtu kópií génu C4 je najvýznamnejším spoločným genetickým faktorom ovplyvňujúcim riziko lupusu – celogenómové sekvenovanie (WGS) kvantifikuje počet kópií génov C4A a C4B
Lokus C4 na chromozóme 6 patrí medzi štrukturálne najkomplexnejšie oblasti ľudského genómu – gény C4A a C4B sa vyskytujú v rôznom počte kópií (po 0 až 6 kópií). Nízky počet kópií C4 (najmä nízky počet C4A) podstatne zvyšuje riziko lupusu, zatiaľ čo vysoký počet kópií má ochranný účinok. Štandardné genetické testovanie nehodnotí počet kópií C4. WGS číta celý lokus C4, čo umožňuje kvantifikáciu počtu kópií, ktorá poskytuje najdôležitejšie bežné genetické hodnotenie rizika lupusu.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – v oblasti lupusu (SLE), genetického rizika a ďalších ochorení, či už ide o vzácne alebo bežné ochorenia. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
