APOE a genetické riziko Alzheimerovej choroby

APOE a genetické riziko Alzheimerovej choroby — alela APOE ε4 je najvýznamnejším bežným genetickým rizikovým faktorom pre Alzheimerovu chorobu s neskorým nástupom a váš genotyp APOE teraz ovplyvňuje to, či máte nárok na liečbu prvými terapiami modifikujúcimi priebeh choroby, ktoré schválila FDA.

Sekvenovanie celého genómu určí váš presný genotyp APOE (ε2/ε3/ε4) a vyhodnotí vzácne determinujúce gény Alzheimerovej choroby – PSEN1, PSEN2 a APP –, čím poskytne kompletný profil genetického rizika, ktorý ovplyvňuje prevenciu, liečbu a vhodnosť pre účasť v klinických štúdiách.

Certifikované podľa CLIA Akreditované v rámci SPP Laboratórium podľa normy ISO 15189 ACMG – dôverné HIPAA a GDPR Sekvenovaných viac ako 100 000genómov
O GÉNE APOE A GENETICKOM RIZIKU ALZHEIMEROVEJ CHOROBY

APOE a genetické riziko Alzheimerovej choroby

Gén APOE (apolipoproteín E, chromozóm 19q13.32) má tri bežné alely – ε2, ε3 a ε4 –, z ktorých vyplýva šesť možných genotypov. APOE ε3/ε3 je najbežnejší genotyp (~60 % populácie) a predstavuje priemerné riziko Alzheimerovej choroby. APOE ε4 je najsilnejší známy bežný genetický rizikový faktor pre neskorý nástup Alzheimerovej choroby: jedna kópia ε4 (ε3/ε4, ~25 % ľudí) zvyšuje celoživotné riziko Alzheimerovej choroby približne 3-4-násobne; dve kópie ε4 (ε4/ε4, ~2-3 % ľudí) zvyšujú riziko približne 8-12-násobne a posúvajú typický nástup o 10-15 rokov skôr. Naopak, APOE ε2 má ochranný účinok – nositelia ε2/ε3 majú približne o 40 % nižšie riziko.

APOE ε4 ovplyvňuje Alzheimerovu chorobu prostredníctvom viacerých mechanizmov: zhoršeného odstraňovania amyloidu-β, zvýšeného neurozápalu, narušenej integrity hematoencefalickej bariéry a zníženej synaptickej plasticity. Rozhodujúce je, že genotyp APOE má teraz priamy terapeutický význam. Lecanemab (Leqembi) a donanemab, prvé protilátky na odstraňovanie amyloidu schválené FDA, sú účinnejšie u nositeľov APOE4, ale zároveň so sebou nesú vyššie riziko ARIA (amyloid-related imaging abnormalities) – najmä u homozygotov ε4/ε4, u ktorých je riziko ARIA natoľko podstatné, že si vyžaduje dôkladné zváženie pomeru prínosov a rizík. Pred začatím antiamyloidovej terapie sa teraz odporúča genotypizácia APOE.

Beyond APOE, rare deterministic Alzheimer's genes cause early-onset familial Alzheimer's disease (EOFAD): PSEN1 (presenilin 1, chromosome 14q24.2, most common — >300 pathogenic variants), PSEN2 (presenilin 2, chromosome 1q42.13), and APP (amyloid precursor protein, chromosome 21q21.3). These autosomal dominant variants cause Alzheimer's with near-complete penetrance, typically with onset between ages 30-60. EOFAD accounts for <1% of all Alzheimer's but is critical to identify because affected families have 50% risk per offspring and may benefit from presymptomatic prevention trials.

Pred začatím liečby lekanemabom alebo donanemabom sa teraz odporúča genotypizácia APOE – u homozygotov APOE4/4 je riziko ARIA podstatne vyššie, čo je potrebné zvážiť voči prínosu liečby. Vďaka tomu sa APOE stáva jedným z prvých farmakogenomických markerov v neurológii.

PREČO SEKVENCIA CELÉHO GENÓMU

Genotypizácia génu APOE má čoraz väčší klinický význam – ovplyvňuje rozhodnutia o liečbe zameranej proti amyloidu, vhodnosť pre účasť v klinických štúdiách a preventívne stratégie založené na stratifikácii rizika. Metóda WGS umožňuje v rámci jedného testu zistiť genotyp génu APOE aj všetky zriedkavé gény spojené s Alzheimerovou chorobou.

Pri rozhodovaní o antiamyloidovej liečbe je teraz potrebné zohľadniť genotyp APOE – pomer rizík a prínosov liekov lecanemab a donanemab sa líši v závislosti od genotypu APOE

V príbalových letákoch FDA pre lieky lecanemab a donanemab sa odporúča genotypizácia APOE pred začatím liečby. U homozygotov APOE4/4 je riziko ARIA približne 35 % (oproti ~5–10 % u osôb, ktoré nie sú nositeľmi tohto génu), vrátane zriedkavých prípadov závažného cerebrálneho edému. V prípade homozygotov ε4/ε4 si rozhodnutie o liečbe vyžaduje dôkladnú diskusiu v rámci informovaného súhlasu, pri ktorej sa zvažujú kognitívne prínosy voči riziku ARIA. U heterozygotov ε4 je pomer prínosov a rizík priaznivejší, ale stále si vyžaduje monitorovanie ARIA. WGS poskytuje definitívne genotypizovanie APOE spolu s komplexným neurogenomickým vyhodnotením.

Gény zodpovedné za vzácnu familiárnu formu Alzheimerovej choroby (PSEN1, PSEN2, APP) spôsobujú deterministickú formu s raným nástupom – ich identifikácia umožňuje zaradenie do preventívnych klinických štúdií

Patogénne varianty génov PSEN1, PSEN2 a APP spôsobujú autozomálne dominantnú formu Alzheimerovej choroby s takmer 100-percentnou penetranciou, pričom ochorenie sa zvyčajne prejaví pred 60. rokom života. Sieť Dominantly Inherited Alzheimer Network (DIAN) a ďalšie preventívne klinické štúdie sa zameriavajú konkrétne na presymptomatických nositeľov týchto deterministických variantov, čím ponúkajú možnosť predísť vzniku ochorenia alebo oddialiť jeho nástup. Identifikácia deterministického variantu má tiež zásadný vplyv na členov rodiny, ktorí majú 50 % šancu, že sú nositeľmi toho istého variantu. WGS komplexne vyhodnocuje všetky tri gény.

ČO V SKUTOČNOSTI ZNAMENÁ SEKVENCIA CELÉHO VAŠEHO GENÓMU
01

Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)

Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.

02

Komplexné analýzy a odborné správy

Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.

03

Vaša skúška získava každým rokom na hodnote

Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.

VÝSLEDKY

Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.

Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.

Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.

Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.

Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.

Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.

Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.

Pozrite si výsledky →
KOMU POMÁHAME

Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.

Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.

Už bolo otestované

DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.

Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.

Zistiť viac

Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.

30-násobné pokrytie celého genómu
Viac ako 5 miliónov variantov identifikovaných na jeden test
Viac ako 200 prispôsobených klinických správ
99,98 % presnosť sekvencovania

Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.

Akreditované a publikované v

Dodatky k zákonu o zlepšení klinických laboratórií Kolegium amerických patológov Americká spoločnosť pre ľudskú genetiku Nature Medzinárodná spoločnosť pre bunkovú a génovú terapiu Časopis Gene
ČASTO KLADENÉ OTÁZKY

Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.

Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?

Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.

Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?

Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.

Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?

Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.

V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?

Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.

Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?

Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.

SKUPINY ZASTUPUJÚCE ZÁUJMY PACIENTOV

Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.

Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o genetické riziko APOE a Alzheimerovej choroby, alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.

Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.

  • Individuálne genomické správy pre vašich členov
  • Skupinové zľavy a balíčky na mieru
  • Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
  • Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia

Jeden test.
Odpovede na celý život.

Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.

Doprava po celom svete zadarmo
Expedujeme do 48 hodín
Výsledky za 6–8 týždňov

Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov

Súprava na testovanie genómu od Dante Labs