Imunodeficiência primária — mais de 450 doenças genéticas em que as infeções recorrentes são um sintoma, e não um diagnóstico, e em que a identificação molecular do gene específico permite o acesso a terapias direcionadas, transplantes curativos e terapia genética.
O sequenciamento do genoma completo avalia simultaneamente todos os mais de 450 genes associados à imunodeficiência primária — desde a SCID (uma emergência neonatal) até à CVID (a imunodeficiência primária sintomática mais comum em adultos) —, proporcionando o diagnóstico molecular que determina se deve ser seguida uma terapia curativa ou de suporte.
Doenças de imunodeficiência primária
As doenças de imunodeficiência primária (PID, também denominadas erros inatos da imunidade) abrangem mais de 450 doenças de origem genética que afetam o desenvolvimento e/ou o funcionamento do sistema imunitário. A União Internacional das Sociedades de Imunologia (IUIS) classifica as PIDs em 10 categorias, incluindo imunodeficiências combinadas (SCID), deficiências predominantemente de anticorpos (CVID, XLA), defeitos fagocitários (CGD), deficiências do complemento e condições autoinflamatórias. A prevalência das PIDs é estimada em 1 em cada 1200 — um número drasticamente superior ao anteriormente estimado, sendo que a maioria dos casos não é diagnosticada.
A imunodeficiência combinada grave (SCID) — causada por variantes nos genes IL2RG (ligada ao cromossoma X, a forma mais comum), ADA, JAK3, RAG1/RAG2, IL7R e outros — constitui uma emergência neonatal: os bebés afetados não possuem praticamente nenhuma célula T funcional e morrem de infeções oportunistas no primeiro ano de vida, na ausência de tratamento definitivo. O rastreio da SCID em recém-nascidos (através do ensaio TREC) é agora realizado em todos os estados dos EUA, identificando os bebés afetados antes da primeira infeção. O transplante de células estaminais hematopoiéticas (HSCT) antes dos 3,5 meses de idade, sem infeção prévia, resulta numa taxa de sobrevivência superior a 95% — tornando a SCID um paradigma de sucesso do tratamento pré-sintomático.
Para além da SCID, o espectro das PID inclui a imunodeficiência variável comum (CVID — a PID sintomática mais comum em adultos, afetando cerca de 1 em cada 25 000 pessoas), a agamaglobulinemia ligada ao cromossoma X (XLA, BTK), a doença granulomatosa crónica (CGD, CYBB) e centenas de doenças mais raras. Estão a surgir terapias direcionadas: leniolisib (FDA 2023) para a síndrome da PI3Kδ ativada (APDS), terapia genética para a ADA-SCID e a SCID ligada ao cromossoma X, e inibidores da JAK para subtipos específicos de PID. O diagnóstico molecular é necessário para todas as terapias direcionadas e é essencial para a seleção de dadores de TCTH e para o planeamento do regime de condicionamento.
O leniolisib (Joenja, FDA 2023) é a primeira terapia direcionada para a síndrome da PI3Kδ ativada (APDS) — causada por variantes de ganho de função dos genes PIK3CD ou PIK3R1. É necessária uma confirmação molecular para a prescrição. O sequenciamento do genoma completo (WGS) identifica todas as variantes da APDS.
Mais de 450 genes PID não podem ser avaliados por um único ensaio imunológico. Os níveis de imunoglobulinas e os subconjuntos de linfócitos permitem identificar a imunodeficiência, mas não a sua causa genética — é necessário um diagnóstico molecular para um tratamento definitivo.
A SCID é curável se for diagnosticada antes da primeira infeção — o TCTH realizado antes dos 3,5 meses de idade proporciona uma taxa de sobrevivência superior a 95%
O gene específico da SCID determina o regime de condicionamento ideal para o TCTH, a seleção do dador e a viabilidade da terapia genética como alternativa. A SCID IL2RG (ligada ao cromossoma X) dispõe de um programa ativo de terapia genética. A ADA-SCID dispõe de uma terapia genética aprovada (Strimvelis). A RAG1/RAG2-SCID requer condicionamento mieloablativo para o enxerto. Estas decisões de transplante específicas para cada gene requerem um diagnóstico molecular rápido no período neonatal — idealmente nas primeiras semanas de vida. O WGS proporciona uma avaliação abrangente dos genes da SCID mais rapidamente do que os testes sequenciais de um único gene.
A CVID afeta 1 em cada 25 000 adultos — muitos são portadores de variantes monogénicas para as quais existem terapias direcionadas específicas
A CVID era anteriormente considerada um diagnóstico de exclusão com base genética desconhecida. Estudos genómicos identificaram causas monogénicas em 25-30% dos doentes com CVID — incluindo TNFRSF13B (TACI), NFKB1, CTLA4, PIK3CD, PIK3R1, LRBA e outros. Várias destas têm terapias direcionadas específicas: abatacept para a deficiência de CTLA4/LRBA, leniolisib para o ganho de função de PIK3CD. Os doentes que recebem apenas reposição de imunoglobulina padrão podem beneficiar de terapia direcionada adicional assim que a sua causa genética específica for identificada por WGS.
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Perguntas frequentes sobre o sequenciamento do genoma completo.
Qual é a diferença entre o sequenciamento do genoma completo e um teste genético direcionado?
Os testes genéticos direcionados — incluindo os painéis padrão de cancro hereditário — analisam uma lista pré-definida de variantes conhecidas num conjunto específico de genes. São concebidos para identificar o que já se sabe que devem procurar. O sequenciamento do genoma completo analisa todo o seu genoma: todos os 6 mil milhões de pares de bases, todos os genes, todas as regiões entre os genes. Um estudo da Mayo Clinic publicado na JAMA Oncology descobriu que as diretrizes de testes padrão não detectavam mais de metade dos doentes com mutações cancerígenas hereditárias. O Teste Genómico não tem uma lista fixa.
O que receberei quando os meus resultados estiverem prontos?
O seu Dante Genome fornece mais de 200 relatórios prontos para uso médico, organizados por categoria clínica — cancro hereditário, doenças cardíacas, doenças raras, farmacogenómica, estatuto de portador e muito mais. Os relatórios são enviados para o seu Genome Manager seguro e estão formatados para utilização clínica direta. Os seus dados genómicos são mantidos permanentemente e reanalisados automaticamente à medida que a ciência avança.
O que acontece se for detetada uma variante clinicamente significativa?
Se for identificada uma variante patogénica ou potencialmente patogénica, esta será claramente assinalada no seu relatório destinado ao médico, acompanhada do contexto clínico, da evidência publicada e das medidas recomendadas a seguir. Recomendamos que partilhe qualquer resultado clinicamente significativo com o seu médico ou com um conselheiro genético, que poderá orientar as decisões relativas à monitorização, à redução do risco ou à realização de testes em cascata aos membros da família.
Em que é que isto difere de um teste de ADN para o público em geral, como o 23andMe ou o AncestryDNA?
Os testes de ADN para o público em geral utilizam chips de genotipagem que analisam menos de 0,1% do seu genoma — um pequeno conjunto pré-selecionado de variantes comuns. Estão otimizados para determinar a ascendência e características populacionais, e não para resultados genéticos clínicos. O Teste Genómico Dante sequencia 100% do seu genoma com uma cobertura de 30X, o mesmo padrão utilizado em contextos de diagnóstico clínico. Os dois testes não são comparáveis em termos de âmbito, metodologia ou utilidade clínica.
Quanto tempo demora a obter resultados e como é que estes são apresentados?
O seu kit de recolha é enviado no prazo de 48 horas após a encomenda. Assim que a sua amostra chegar ao nosso laboratório certificado pela CLIA, o sequenciamento e a análise demoram entre 6 a 8 semanas. Os resultados são enviados de forma segura para o seu Genome Manager, onde pode aceder aos seus relatórios, partilhá-los com o seu médico e receber atualizações automáticas à medida que novas descobertas são validadas em relação ao seu genoma.
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A Dante Labs colabora com grupos de defesa dos doentes de qualquer dimensão — para doenças de imunodeficiência primária e outras condições, tanto raras como comuns. Apoiamos grupos em qualquer país, incluindo grupos virtuais de defesa dos doentes.
Podemos fornecer relatórios personalizados, descontos para grupos e pacotes adaptados aos seus membros. Entre em contacto connosco através do formulário e responderemos no prazo de dois dias úteis.
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