Gene
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000149311↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 472↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 11q22.3
- Coordenadas
- Cromossoma 11: 108 223 067–108 369 102 (GRCh38)
- Exões
- 63 exões ao longo de 146 kb
- Proteína
- 3056 aminoácidos, 350,7 kDa
- Também conhecido como
- TEL1, TELO1
- Símbolos anteriores
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- Transcrito MANE Select
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
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url <- "https://dantelabs.com/genes/atm.json"
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page$gene$nameAnalise ATM, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Obter o meu Genome TestRelatórios com curadoria relevantes para este gene
Ataxia-Telangiectasia
- Autossómica recessiva
Ataxia cerebelosa progressiva, telangiectasia, imunodeficiência e predisposição para o cancro, causadas por alterações bialélicas no ATM.
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 8 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
▶Acionabilidade
O diagnóstico orienta a prevenção de infeções e a substituição de imunoglobulinas, a minimização da exposição a radiação ionizante, o rastreio de cancro e a monitorização pulmonar, bem como o teste de portadores em familiares.
Infertilidade Feminina
Capacidade reduzida ou ausente de uma mulher para engravidar.
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 8 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
Genes do cancro da mama e do ovário para além de BRCA1/2
- Predisposição para cancro associada a ATMAutossómica dominante
Uma variante isolada em ATM aumenta moderadamente o risco de cancro da mama e está associada ao cancro do pâncreas e da próstata.
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 1 submissor da GenCC classifica-a como definitiva ou forte
▶Acionabilidade
Geralmente recomenda-se um rastreio mamário reforçado; os portadores cujo parceiro também tenha uma variante em ATM podem querer conhecer o risco de ataxia-telangiectasia nos seus filhos.
- Cancro da mama hereditárioAutossómica dominante
Suscetibilidade hereditária ao cancro da mama causada por variantes em um de vários genes.
- 2 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
▶Acionabilidade
Pode ser recomendado um rastreio mamário mais precoce e mais intensivo, incluindo ressonância magnética, consoante o gene.
Agrupamentos mais amplos
Outros Erros Inatos da Imunidade
- Doença de Imunodeficiência
Um de 170 genes ligados a este
Doença em que existe uma deficiência ou defeito nos mecanismos da imunidade, quer celular quer humoral.
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 8 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
▶Acionabilidade
Transplante de células-tronco hematopoiéticas (HSCT) para SCID e PID graves; substituição de imunoglobulinas (IVIG/SCIG) para deficiências de anticorpos; leniolisib (Joenja, FDA 2023) para APDS; terapia génica para SCID-ADA; abatacept para deficiência de CTLA4/LRBA; antibióticos profiláticos; G-CSF para CGD
Doenças Neurodegenerativas Hereditárias
- Doença Neurodegenerativa Associada a KIF5AAutossómica dominante
Um de 372 genes ligados a este
Causada por alterações numa cópia do gene KIF5A, que codifica uma proteína motora com uma cauda de ligação a carga. Diferentes tipos de alteração originam diferentes doenças: paraplegia espástica hereditária tipo 10, uma forma axonal da doença de Charcot-Marie-Tooth e esclerose lateral amiotrófica (ELA).
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 8 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
▶Acionabilidade
O tratamento é sintomático e depende da apresentação clínica, incluindo fisioterapia, medicamentos antiespásticos e cuidados multidisciplinares para a ELA. Cada filho de uma pessoa afetada tem uma probabilidade de 1 em 2 de herdar a alteração; o aconselhamento genético ajuda as famílias a compreender este risco.
Como ATM está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Locais conhecidos associados a doença
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
- Variantes com página
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 12,9 kb dos 146 kb do gene; 9171 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de ATM
2Fácil
Grau de dificuldade de sequenciar ATM com leituras curtas, numa escala de 0 a 100
0 · Fácil100 · Difícil
Quase todos os exões de ATM se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham de forma limpa.
O que acresce: a proporção dos exões de ATM em cada tipo de região difícil
- MapeabilidadeTroços onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessa zona pode estar em falta ou ser incorreta. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 100.0,5%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutros pontos do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 60.0%
- Partilhado com o chrYAs regiões pseudoautossómicas e a região transposta do X, onde o chrX e o chrY têm a mesma sequência ou uma quase idêntica, pelo que uma leitura de um pode ser posicionada no outro. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 60.0%
- Cobertura da referênciaLacunas na montagem de referência nas proximidades, onde não existe sequência à qual as leituras se possam alinhar. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 50.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, em que as leituras escorregam e podem não as abranger. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 30.2,1%
- Conteúdo em GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma deficiente. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 20.5,4%
Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuaçãoCada barra representa a proporção das bases dos exões de ATM que se encontram nesse tipo de região difícil. Qualquer tipo pode, por si só, tornar um gene difícil, e cada tipo adicional acrescenta menos: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em zonas onde as leituras não podem ser posicionadas de forma única.
2935
posições em ATM onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
Destas, 11 (0,4%) situam-se em regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (11 locais)
Um genoma completo cobre todos os 146 kb de ATM, incluindo os intrões, e não apenas os 12,9 kb de exões.
Variantes com página (811)
As variantes de ATM com página aqui, primeiro as de mais estrelas de revisão. Cada página descreve o registo público da variante na ClinVar, nunca um resultado.
| Variante | HGVS c. | Exão ou intrão | Posição (GRCh38) | Classificação na ClinVar | Estado de revisão |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Exão 18 | 108 268 501 | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| c.2T>C | Exão 2 | 108 227 626 | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos | |
| c.332-1G>A | Intrão 4 | 108 235 669 | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos | |
| c.496+5G>A | Intrão 5 | 108 235 839 | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos | |
| c.1122_1123del | Exão 9 | 108 248 987 | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos | |
| c.1607+1G>T | Intrão 10 | 108 251 073 | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos | |
| c.2251-2A>T | Intrão 14 | 108 257 479 | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos | |
| c.2251-4A>G | Intrão 14 | 108 257 477 | Provavelmente patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos | |
| c.2466+5G>C | Intrão 16 | 108 259 080 | Provavelmente patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos | |
| c.2639-23_2639-21del | Intrão 17 | 108 268 386 | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
Variantes patogénicas ClinVar (3833)
As variantes de ATM que a ClinVar classifica como patogénicas ou provavelmente patogénicas para qualquer condição, revistas por pelo menos um submissor com critérios, e as mais revistas entre elas. É o registo público da ClinVar sobre o gene, nunca um resultado.
- Patogénica 2826
- Patogénica/provavelmente patogénica 278
- Provavelmente patogénica 729
| Variante | Condições | Classificação na ClinVar | Estado de revisão |
|---|---|---|---|
| NM_000051.4(ATM):c.2T>C (p.Met1Thr) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.67C>T (p.Arg23Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.217_218del (p.Glu73fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.332-1G>A | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.387del (p.Asp130fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.467G>A (p.Trp156Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.480_484del (p.Gln161fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.496+5G>A | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.748C>T (p.Arg250Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.790del (p.Tyr264fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.824del (p.Ser274_Leu275insTer) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.1122_1123del (p.Glu376fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.1158del (p.Lys387fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.1355del (p.Thr452fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.1396C>T (p.Gln466Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.1402_1403del (p.Lys468fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.1442T>G (p.Leu481Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.1564_1565del (p.Glu522fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.1607+1G>T | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.1782del (p.Val595fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.2152dup (p.Cys718fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.2251-2A>T | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.2284_2285del (p.Leu762fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.2413C>T (p.Arg805Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
| NM_000051.4(ATM):c.2508dup (p.Ser837fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrelas em 4 revista por painel de peritos |
Veja todas as 3833 com todas as outras variantes de ATM na ClinVar → (abre num novo separador)
Genes associados às mesmas condições
- FMR1fragile X messenger ribonucleoprotein 1Partilha 2 condições
- TWNKtwinkle mtDNA helicasePartilha 2 condições
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Partilha 1 condição
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialPartilha 1 condição
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 7Partilha 1 condição
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Partilha 1 condição
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipasePartilha 1 condição
- ACER3alkaline ceramidase 3Partilha 1 condição
- ACO2aconitase 2Partilha 1 condição
- ADAadenosine deaminasePartilha 1 condição
- ADARadenosine deaminase RNA specificPartilha 1 condição
- ADPRSADP-ribosylserine hydrolasePartilha 1 condição
Características associadas a ATM
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que ATM pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
Mostrar mais 29 características
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
Mostrar mais 3 características
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
Mostrar mais 1 característica
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- GenCC e ClinGen, publicados em 2026-10-21: as condições a que o gene está associado e a força dessa associação.
- A lista de achados secundários do ACMG, SF v3.2.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos que causam doença e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão de dados 2026.10.21-c791e85a.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene ATM: ATM serine/threonine kinase. Consultado em 23 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/atm
Dante Labs. Gene ATM: ATM serine/threonine kinase [Internet]. [consultado em 23 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/atm
Um teste. Respostas para toda a vida.
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