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Um teste, atualizado para toda a vida: como a ciência do genoma melhora a cada ano

Quando se faz uma análise ao sangue, o resultado é um instantâneo — preciso naquele momento, mas irrelevante um ano depois. Quando se sequencia todo o genoma, o resultado é permanente. A sequência do seu ADN não muda. Mas a ciência que a interpreta muda — e é isso que torna o sequenciamento do genoma completo fundamentalmente diferente de qualquer outro exame de saúde.

Os seus dados são fixos. A ciência não.

Todos os meses, investigadores de todo o mundo publicam novas descobertas que associam variantes genéticas a doenças, respostas a medicamentos e condições de saúde. A base de dados ClinVar — o principal arquivo público de relações entre variantes e doenças — adiciona milhares de novas entradas por ano. Este ritmo está a acelerar à medida que ficam disponíveis conjuntos de dados genómicos de maior dimensão para análises à escala populacional.

Isto significa que uma variante no seu genoma que hoje é classificada como uma «variante de significado incerto» (VUS) poderá ser reclassificada como patogénica no próximo ano — quando se acumularem provas suficientes provenientes de estudos clínicos. Por outro lado, uma variante que parecia preocupante poderá ser reclassificada como menos preocupante à medida que forem surgindo mais dados populacionais.

A questão fundamental é: o seu fornecedor de testes volta a analisar os seus dados quando estas atualizações ocorrem?

Por que razão a maioria dos testes fica estagnada no tempo

Os testes de genotipagem para consumidores — do tipo oferecido pela 23andMe, AncestryDNA e serviços semelhantes — analisam um conjunto pré-selecionado de posições genéticas num chip. O relatório que recebe reflete o que se sabia sobre essas posições específicas na data em que o chip foi concebido. Se a ciência descobrir algo novo sobre uma variante que não estava no chip, ou reclassificar uma variante que estava, os seus resultados não são atualizados — porque os dados subjacentes estão incompletos.

Até mesmo alguns testes clínicos têm esta limitação. Os painéis genéticos específicos analisam apenas os genes incluídos no painel. Se, em investigações futuras, for identificada uma variante clinicamente importante num gene que não constava do seu painel, será necessário realizar um novo teste para a detetar.

Como funciona a reanálise do genoma completo

O sequenciamento do genoma completo lê todas as posições do seu genoma — aproximadamente 6,4 mil milhões de pares de bases. Isto significa que o seu ficheiro de dados está completo desde o primeiro dia. Nada foi deixado de fora. Nada precisa de ser recolhido novamente.

Quando forem publicadas e clinicamente validadas novas associações entre variantes e doenças, os dados brutos do seu sequenciamento original poderão ser reanalisados com base em bases de dados atualizadas. Podem surgir novos resultados clinicamente significativos que não eram conhecidos na altura do seu teste original — sem necessidade de uma colheita de sangue, um novo kit ou um novo teste.

Na Dante Labs, esta reanálise ocorre automaticamente através da plataforma Genome Manager. Quando validamos novas associações entre variantes e doenças através do nosso processo de revisão clínica, os seus relatórios são atualizados para refletir os dados científicos mais recentes. Recebe uma notificação sobre quaisquer alterações clinicamente relevantes .

Como isto se traduz na prática

Considere um exemplo da vida real: nos anos desde que o ClinVar começou a acompanhar as classificações das variantes, aproximadamente 7% de todas as variantes classificadas foram reclassificadas pelo menos uma vez, à medida que surgiram novas evidências. Algumas variantes VUS foram reclassificadas como patogénicas. Algumas variantes provavelmente patogénicas foram reclassificadas para um nível inferior. Estas reclassificações têm consequências clínicas diretas — determinam se o rastreio é recomendado, quais os medicamentos adequados e quais os membros da família que devem ser testados.

Com um conjunto de dados genómicos completo, estas reclassificações são aplicadas automaticamente aos seus relatórios. Com um conjunto de dados incompleto — qualquer coisa que não seja o sequenciamento do genoma completo —, isso pode não acontecer, seja porque a variante relevante não foi testada, seja porque o prestador de serviços não oferece reanálise.

A economia do sequenciamento único

Há também um argumento prático. O sequenciamento do genoma completo custa uma fração do que custava há cinco anos — e a tendência continua a diminuir. Mas o cálculo não se resume apenas ao preço atual. Trata-se do custo total ao longo da vida da informação genética.

Se fizer um teste de painel específico hoje e um teste de painel diferente no próximo ano — porque a sua questão clínica mudou ou porque foram adicionados novos genes ao painel — estará a pagar duas vezes por visões incompletas do mesmo genoma. O sequenciamento do genoma completo capta tudo de uma só vez. Todas as questões futuras são respondidas a partir do mesmo conjunto de dados.

Conclusão

O seu genoma é o único teste de saúde que ganha mais valor depois de o ter feito. Não porque o seu ADN mude — isso não acontece. Mas porque a ciência que o analisa nunca pára de avançar. O único requisito é que o seu teste original tenha captado tudo. É exatamente isso que o sequenciamento do genoma completo faz.

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