Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

HAVCR1

hepatitis A virus cellular receptor 1

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
5q33.3
Współrzędne
Chromosom 5: 157 029 413–157 059 116 (GRCh38)
Eksony
9 eksonów na odcinku 29,7 kb
Białko
364 aminokwasów
Znany również jako
HAVCR-1, TIM-1, TIM1, HAVCR, TIMD1, CD365, KIM1
Transkrypt MANE Select
ENST00000523175.6NM_001173393.3
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu HAVCR1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu HAVCR1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 5, z nawiasem wskazującym położenie HAVCR1. HAVCR1 i 12 genów w pobliżu na chromosomie 5, od 156 544 265 do 157 544 264.Chromosom 55q33.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3156,6 Mb156,8 Mb157 Mb157,2 Mb157,4 MbSGCD: 155 870 344–156 767 788, nić dodatniejSGCDPPP1R2B: 156 850 295–156 852 528, nić dodatniejPPP1R2BTIMD4: 156 918 639–156 963 230, nić ujemnejTIMD4HAVCR1: 157 029 413–157 059 116, nić ujemnejHAVCR1HAVCR2: 157 085 422–157 142 869, nić ujemnejHAVCR2MED7: 157 134 848–157 159 019, nić ujemnejMED7ITK: 157 142 933–157 255 185, nić dodatniejITKGARIN3: 157 161 846–157 166 264, nić ujemnejGARIN3CYFIP2: 157 266 079–157 395 595, nić dodatniejCYFIP2: 157 341 596–157 460 100, nić ujemnejFNDC9: 157 341 598–157 345 766, nić ujemnejFNDC9ADAM19: 157 395 534–157 575 858, nić ujemnejADAM19NIPAL4: 157 460 213–157 474 723, nić dodatniejNIPAL4Schemat HAVCR1: 9 eksonów na nici ujemnej chromosomu 5Ekson 9: 157 029 413–157 029 841, 429 zasadEkson 8: 157 032 854–157 032 887, 34 zasadEkson 7: 157 037 247–157 037 361, 115 zasadEkson 6: 157 042 627–157 042 682, 56 zasadEkson 5: 157 049 038–157 049 145, 108 zasadEkson 4: 157 052 361–157 052 654, 294 zasadEkson 3: 157 055 201–157 055 533, 333 zasadEkson 2: 157 057 898–157 057 955, 58 zasadEkson 1: 157 058 921–157 059 116, 196 zasad9876543215′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 1,6 kb z 29,7 kb genu; 1095 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie HAVCR1

11Umiarkowany

Jak trudno sekwencjonować HAVCR1 krótkimi odczytami, w skali 0–100

  • Mapowalność1,6%
  • Homologia26%
  • Powtórzenia15%
  • Zawartość GC0%
  • Pokrycie referencyjne0%

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen HAVCR1: hepatitis A virus cellular receptor 1. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/havcr1

Vancouver

Dante Labs. Gen HAVCR1: hepatitis A virus cellular receptor 1 [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/havcr1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test