Anemia sierpowata — pojedyncza zmiana nukleotydowa w genie HBB, która zmienia budowę czerwonych krwinek, utrudnia mikrokrążenie i determinuje konieczność leczenia przez całe życie.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala scharakteryzować pełny genotyp HBB — w tym kombinacje heterozygotyczne złożone, loci modyfikujące nasilenie choroby oraz współdziedziczone warianty talasemii alfa, które są systematycznie pomijane w standardowych badaniach przesiewowych w kierunku nosicielstwa.
Anemia sierpowata
Anemia sierpowata (SCD) to autosomalna recesywna hemoglobinopatia spowodowana zamianą kwasu glutaminowego na walinę w kodonie 6 genu beta-globiny (HBB p.Glu7Val; rs334). Ta wariant pojedynczego nukleotydu powoduje polimeryzację hemoglobiny S (HbS) w warunkach niedotlenienia, zniekształcając erytrocyty do sztywnego kształtu sierpa. Te zdeformowane komórki zatykają małe naczynia krwionośne, wywołując kryzysy niedrożności naczyń, niedokrwistość hemolityczną i postępujące uszkodzenia narządów w niemal każdym układzie — w tym śledziony, nerek, płuc, mózgu i szkieletu. Anemia sierpowata dotyka rocznie około 300 000 noworodków na całym świecie, a jej najwyższa częstość występowania odnotowuje się w Afryce Subsaharyjskiej, Indiach i na Bliskim Wschodzie, choć choroba ta występuje we wszystkich populacjach.
Struktura genotypowa SCD jest bardziej złożona niż klasyczny obraz HbSS. Choroba HbSC (HBB Glu7Val/Glu6Lys) oraz talasemia beta z HbS (HbS/beta⁰ lub HbS/beta⁺) powodują odmienne fenotypy kliniczne o różnym stopniu nasilenia objawów i implikacjach terapeutycznych. Nasilenie choroby jest dodatkowo modulowane przez poziomy hemoglobiny płodowej (HbF) — na które wpływają warianty w genach BCL11A, HBS1L-MYB oraz samym locus HBB — oraz przez współdziedziczną talasemię alfa (delecje HBA1/HBA2), która zmniejsza polimeryzację HbS i wiąże się z łagodniejszym przebiegiem choroby. Standardowe badanie nosicielstwa dwóch alleli identyfikuje podstawowy wariant Glu7Val, ale nie jest zaprojektowane tak, aby odzwierciedlać pełną złożoność genotypową, która determinuje przebieg choroby u danej osoby.
Określenie statusu nosicielstwa przed ciążą lub w jej trakcie stanowi główny powód wykonywania badań genetycznych w rodzinach, w których nie odnotowano wcześniej przypadków choroby. Standardowymi wskazaniami klinicznymi są badania kaskadowe w rodzinach, o których wiadomo, że są nosicielami, oraz genotypowanie potwierdzające w przypadku pozytywnych wyników badań przesiewowych noworodków. W przypadku pacjentów z chorobą coraz częściej uznaje się, że pełne genotypowanie — obejmujące loci modyfikujące HbF oraz współdziedziczną talasemię alfa — ma istotne znaczenie dla przewidywania odpowiedzi na hydroksymocznik oraz ustalania kryteriów kwalifikujących do przeszczepu szpiku kostnego.
Talasemia typu HbSS, HbSC, HbS-beta⁰ oraz HbS-beta⁺ charakteryzują się odmiennymi rokowaniami klinicznymi. Sam genotyp HBB nie pozwala przewidzieć stopnia ciężkości choroby; pełny obraz sytuacji uwzględnia również loci modyfikujące oraz współdziedziczone warianty.
Standardowe badania nosicielstwa wykrywają wariant Glu7Val. Nie pozwalają one jednak na określenie pełnego genotypu, loci modyfikujących ani współdziedziczonych wariantów, które mają wpływ na przebieg kliniczny.
Obraz heterozygotyczny złożony ma równie duże znaczenie jak status nosiciela
Osoba, która odziedziczyła jeden allel HbS i jeden allel beta-talasemii, cierpi na anemię sierpowatokrwinkową — a nie tylko na cechę sierpowatokrwinkową. Standardowe testy nosicielstwa obejmujące dwa warianty są zaprojektowane tak, by wykrywać substytucję rs334 Glu7Val, ale nie są przystosowane do jednoczesnej identyfikacji alleli beta-talasemii w całym genie HBB. Sekwencjonowanie całego genomu odczytuje kompletną sekwencję kodującą i regulacyjną HBB, identyfikując wszelkie współdziedziczone warianty beta-talasemii obok allelu Glu7Val — określając, czy ryzyko dla pary nosicieli dotyczy HbSS, HbSC, HbS-beta talasemii, czy cechy HbS.
Lokusi modyfikujące HbF oraz współdziedziczenie talasemii alfa nie są wykrywane przez standardowe panele
Poziom hemoglobiny płodowej jest najsilniejszym znanym czynnikiem modyfikującym nasilenie przebiegu anemii sierpowatej. Wysoki poziom HbF hamuje polimeryzację HbS, zmniejszając liczbę zdarzeń okluzji naczyniowej i uszkodzeń narządów docelowych. Poziomy HbF są regulowane przez powszechne warianty w genie BCL11A (rs1427407), regionie międzygenowym HBS1L-MYB (rs28384513) oraz w locus HBB w miejscu Xmn1. Współdziedziczona talasemia alfa (delecje genów HBA1/HBA2) dodatkowo moduluje nasilenie choroby. Żadne z tych loci modyfikujących nie jest uwzględnione w standardowych badaniach przesiewowych nosicieli dwóch alleli ani w panelach hemoglobinopatii. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uchwycić je wszystkie jednocześnie wraz z pierwotnym genotypem HBB.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się anemią sierpowatokrwinkową oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
