Zespół Retta — ciężka choroba neurorozwojowa spowodowana utratą funkcji genu MECP2, dla której dostępne jest obecnie zatwierdzone przez FDA leczenie, dzięki czemu ostateczna diagnoza molekularna pozwala bezpośrednio zastosować terapię.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala na odczytanie pełnego genu MECP2 i zidentyfikowanie wszystkich typów wariantów — w tym rozległych delecji i złożonych rearanżacji, które wyjaśniają 5–10% klinicznie zdiagnozowanych przypadków zespołu Retta, u których wyniki badań standardowych paneli genetycznych dla genu MECP2 były ujemne.
Zespół Retta
Zespół Retta (RTT) to ciężkie zaburzenie neurorozwojowe o dziedziczeniu dominującym sprzężonym z chromosomem X, spowodowane de novo patogennymi wariantami genu MECP2 (białko wiążące metyl-CpG 2) zlokalizowanego na chromosomie Xq28. Klasyczny RTT występuje niemal wyłącznie u kobiet i dotyka około 1 na 10 000–15 000 żywych noworodków płci żeńskiej. Po okresie pozornie prawidłowego rozwoju w ciągu pierwszych 6–18 miesięcy życia dziewczynki dotknięte chorobą przechodzą charakterystyczną fazę regresji, w której dochodzi do utraty nabytych umiejętności manualnych i mowy, pojawienia się stereotypowych ruchów rąk (wyciskanie, klaskanie, stukanie), zaburzeń chodu oraz nabytej mikrocefalii. Po fazie regresji następuje przedłużona faza stabilizacji, podczas której niektóre umiejętności mogą ulec częściowemu przywróceniu.
Gen MECP2 koduje białko związane z chromatyną, które pełni funkcję regulatora transkrypcji, wiążąc metylowane dinukleotydy CpG i modulując ekspresję genów w całym genomie. Patogeniczne warianty genu MECP2 zaburzają tę globalną regulację transkrypcji, wpływając na dojrzewanie neuronów i funkcjonowanie synaps. Ponad 95% klasycznych przypadków zespołu Retta jest spowodowanych de novo patogennymi wariantami MECP2 — osiem powtarzających się wariantów (R106W, R133C, T158M, R168X, R255X, R270X, R294X, R306C) stanowi około 65–70% wszystkich przypadków. Duże delecje obejmujące jeden lub więcej eksonów stanowią około 8–10% przypadków i wymagają analizy wariantów liczby kopii w celu wykrycia. Około 3–5% pacjentów spełniających zrewidowane kryteria kliniczne RTT jest MECP2-ujemnych, co może odzwierciedlać warianty w innych genach (CDKL5, FOXG1) lub warianty MECP2 w regionach nieobjętych standardowym sekwencjonowaniem.
Sytuacja terapeutyczna w przypadku zespołu Retta uległa radykalnej zmianie wraz z zatwierdzeniem przez FDA w 2023 r. trofinetidu (Daybue) — pierwszego leku zatwierdzonego specjalnie do stosowania w RTT. Trofinetid jest analogiem tripeptydu IGF-1 (glicyna-prolina-glutaminian, GPE), który działa na procesy neurozapalne i zaburzenia synaptyczne. Dodatkowe terapie w fazie badań klinicznych obejmują terapię zastępczą genów z wykorzystaniem wektorów AAV, metody reaktywacji MECP2 na nieaktywnym chromosomie X u kobiet oraz modulatory szlaków niższego rzędu. Każda z tych strategii terapeutycznych wymaga potwierdzonej diagnozy molekularnej MECP2 — co sprawia, że ostateczne genotypowanie ma nie tylko znaczenie diagnostyczne, ale bezpośrednio umożliwia leczenie.
Warianty atypowego zespołu Retta — w tym wariant z zachowaną mową, wariant z wczesnymi napadami (CDKL5) oraz wariant wrodzony (FOXG1) — poszerzają spektrum objawów klinicznych. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala na jednoczesną ocenę genów MECP2, CDKL5 i FOXG1.
Standardowe sekwencjonowanie genu MECP2 pozwala wykryć mutacje punktowe w eksonach kodujących. Wykrycie rozległych delecji, złożonych rearanżacji i głębokich wariantów intronowych wymaga analizy na poziomie genomu — stanowią one 10–15% przypadków zespołu Rett (RTT) potwierdzonych genetycznie.
Duże delecje genu MECP2 stanowią 8–10% przypadków zespołu Retta i wymagają specjalistycznej analizy liczby kopii
Około 8–10% pacjentów z klasycznym zespołem Retta ma duże delecje genu MECP2 — obejmujące od fragmentu jednego eksonu po cały gen — zamiast mutacji punktowych. Standardowe sekwencjonowanie metodą Sangera kodujących eksonów genu MECP2, wciąż stosowane jako badanie pierwszego rzutu w niektórych placówkach, nie pozwala na wykrycie delecji. Nawet panele genowe oparte na technologii NGS mogą wykazywać ograniczoną czułość w przypadku dużych delecji, w zależności od stosowanego procesu analitycznego. Sekwencjonowanie całego genomu zapewnia jednoczesne wykrywanie mutacji punktowych i analizę wariantów liczby kopii w całym locus MECP2, umożliwiając wykrycie zarówno powszechnych mutacji powtarzających się, jak i dużych wariantów strukturalnych w ramach jednego badania.
Pierwsza zatwierdzona metoda leczenia sprawia, że diagnostyka molekularna ma charakter bezpośrednio terapeutyczny — a nie tylko informacyjny
Przed zatwierdzeniem trofinetidu przez FDA w 2023 roku genotypowanie genu MECP2 służyło przede wszystkim celom diagnostycznym i prognostycznym. Obecnie potwierdzony patogenny wariant genu MECP2 stanowi warunek konieczny do rozpoczęcia jedynego leczenia zatwierdzonego przez FDA specjalnie w przypadku zespołu Retta. Zmienia to kliniczne znaczenie badań molekularnych: ujemny wynik badania MECP2 w standardowym panelu — zwłaszcza takim, który nie obejmował oceny dużych delecji lub głębokich wariantów intronowych — nie jest już tylko punktem końcowym diagnostyki, ale potencjalną przeszkodą w dostępie do leczenia. Kompleksowa analiza MECP2, która pozwala zidentyfikować wszystkie typy wariantów, gwarantuje, że żadnemu pacjentowi z uleczalną diagnozą molekularną nie odmówi się terapii z powodu luki w badaniach.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się zespołem Retta oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
