Retinoblastoma — najczęstszy nowotwór wewnątrzgałkowy występujący u dzieci, w przypadku którego status genu RB1 w linii germinalnej decyduje o konieczności prowadzenia badań przesiewowych w kierunku innych nowotworów przez resztę życia osoby, która przeżyła chorobę.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala zidentyfikować wszystkie typy wariantów genu RB1 — w tym mutacje mozaikowe, które mogą zostać pominięte w standardowych badaniach krwi — oraz rozstrzyga kwestię różnicy między mutacjami germinalnymi a somatycznymi, od której zależy konieczność prowadzenia przez całe życie badań przesiewowych w kierunku nowotworów.
Retinoblastoma
Retinoblastoma (Rb) jest najczęstszym nowotworem złośliwym wewnątrzgałkowym występującym w dzieciństwie; dotyka około 1 na 15 000–20 000 żywych urodzeń, a każdego roku na całym świecie diagnozuje się około 8 000 nowych przypadków. Powstaje z retinoblastów, niedojrzałych komórek prekursorowych siatkówki, w wyniku biallelicznej inaktywacji genu supresorowego nowotworów RB1 na chromosomie 13q14.2 — pierwszego genu supresorowego nowotworów scharakteryzowanego na poziomie molekularnym. Retinoblastoma objawia się leukokorią (białym odbiciem źrenicy), zezem i utratą wzroku, zwykle u dzieci poniżej 5 roku życia. Przy obecnym leczeniu całkowite przeżycie przekracza 95% w krajach o wysokim dochodzie, choć wyniki różnią się znacznie w zależności od stadium choroby i dostępności zasobów.
Około 40% przypadków siatkówczaka ma charakter dziedziczny — jest spowodowanych patogenną mutacją w genie RB1 występującą w linii germinalnej (konstytucjonalną). Dziedziczny siatkówczak ma zazwyczaj charakter obustronny (75–80%) lub wieloogniskowy, a mediana wieku w momencie rozpoznania jest niższa niż w przypadku przypadków sporadycznych. Pozostałe ~60% przypadków ma charakter sporadyczny (nie dziedziczny) i jest spowodowanych dwoma somatycznymi mutacjami genu RB1 w pojedynczej komórce siatkówki. Retinoblastoma jednostronna może być dziedziczna lub sporadyczna — około 15% przypadków jednostronnych charakteryzuje się wariantami genetycznymi RB1 w linii germinalnej, a odsetek ten wzrasta do prawie 100% w przypadkach obustronnych. Około 10–15% przypadków retinoblastomy jednostronnej bez wykrywalnej mutacji germinalnej charakteryzuje się somatycznymi mozaikowymi mutacjami genu RB1, wykrywalnymi wyłącznie w guzie lub w sekwencjonowaniu głębokim krwi.
Kluczowa różnica między retinoblastomą dziedziczną a niedziedziczną nie polega na rokowaniu dotyczącym nowotworu oka, lecz na ryzyku wystąpienia drugiego nowotworu w ciągu całego życia. Szacuje się, że nosiciele dziedzicznej mutacji RB1 mają 50-procentowe skumulowane ryzyko wystąpienia drugiego nowotworu pierwotnego przed ukończeniem 50. roku życia; są to głównie osteosarcomy związane z polem napromieniowania, mięsaki tkanek miękkich oraz czerniak. Ryzyko to znacznie wzrasta w wyniku radioterapii, której w miarę możliwości unika się u nosicieli dziedzicznej mutacji RB1. Przeżycie dziedzicznego siatkówczaka wymaga wdrożenia protokołu dożywotniej obserwacji: regularnych badań obrazowych w kierunku nowotworów tkanek miękkich i kości, unikania promieniowania UV oraz kaskadowych badań genetycznych potomstwa połączonych z badaniem okulistycznym w okresie niemowlęcym. Trwają badania nad terapią genową i ukierunkowanymi metodami działania na szlak RB1.
Mutacje mozaikowe RB1 — w których wariant germinalny występuje jedynie w niewielkiej części komórek — występują w około 10–12% przypadków dziedzicznego siatkówczaka i mogą zostać pominięte podczas standardowego sekwencjonowania próbek krwi. Sekwencjonowanie głębokie oraz analiza tkanki nowotworowej zwiększają skuteczność wykrywania.
Określenie statusu mozaikowego genu RB1 w linii germinalnej i somatycznej wymaga analizy zarówno krwi, jak i tkanki nowotworowej przy głębokości sekwencjonowania, której standardowe panele mogą nie osiągnąć. Konwencjonalne badania nie wykrywają wariantów mozaikowych we krwi o frakcji alleli wynoszącej 5–20%.
Warianty mozaikowe RB1 nie są wykrywane w standardowych badaniach linii germinalnej — co ma konsekwencje kliniczne dla całej rodziny
Mozaikowość somatyczna w retinoblastomie — w której patogenny wariant genu RB1 powstał po zygocie i występuje jedynie w części komórek — dotyczy około 10–12% przypadków dziedzicznych. Rodzice pacjenta indeksowego z mozaikowym RB1 mogą sami wykazywać mozaikowość przy bardzo niskich frakcjach alleli wariantowych. Standardowe sekwencjonowanie eksomu i panelowe jest skalibrowane dla heterozygotycznych wariantów linii germinalnej przy frakcji alleli wynoszącej około 50%; warianty mozaikowe występujące w 10–20% mogą znajdować się poniżej progu wykrywalności wariantów. Głębokie sekwencjonowanie całego genomu o zwiększonej czułości na warianty o niskiej frakcji alleli poprawia wykrywalność mozaikowości. Pominięcie mozaikowego wariantu RB1 w linii germinalnej u rodzica doprowadziłoby do błędnego doradztwa w zakresie ryzyka nawrotu — przedstawiając kolejną ciążę jako pozbawioną ryzyka, podczas gdy w rzeczywistości rodzic może przekazać ten wariant.
Stan genu RB1 w komórkach płciowych ma decydujący wpływ na wybór radioterapii w trakcie leczenia nowotworu
Radioterapia wiązką zewnętrzną stosowana w leczeniu siatkówczaka znacznie zwiększa ryzyko wystąpienia nowotworu pierwotnego u nosicieli genetycznej mutacji RB1 w obszarze napromieniowanym — zwłaszcza osteosarcoma w okolicy oczodołu. Z tego powodu w obecnym postępowaniu w przypadku dziedzicznego siatkówczaka zdecydowanie preferuje się metody niefizjologiczne (chemioterapia dotętnicza, do-szklistkowa podawanie melfalanu, zabiegi ogniskowe), o ile jest to możliwe, właśnie w celu uniknięcia ryzyka wystąpienia nowotworu wtórnego związanego z napromieniowaniem. Podjęcie decyzji dotyczącej leczenia wymaga znajomości statusu genu RB1 w linii germinalnej w momencie rozpoczęcia leczenia — a nie wiele lat później, gdy rozwinie się nowotwór wtórny. Sekwencjonowanie całego genomu zapewnia kompletny genotyp RB1, w tym wykrywanie mozaiki genetycznej, co pozwala na planowanie leczenia od pierwszego dnia.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się retinoblastomą oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
