Choroba Pompe’a — postępująca choroba spichrzania glikogenu w mięśniach, w przypadku której stosuje się skuteczną terapię enzymatyczną; u dorosłych średnio 7-letnie opóźnienie w rozpoznaniu powoduje, że przed rozpoczęciem leczenia dochodzi do nieodwracalnych uszkodzeń mięśni oddechowych i ruchowych.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala odczytać pełną sekwencję genu GAA, umożliwiając identyfikację wszystkich typów wariantów, w tym powszechnego allela pseudoniedoboru intronowego, który utrudnia wykrywanie nosicieli oraz badania przesiewowe noworodków w chorobie Pompego oparte na testach enzymatycznych.
Choroba Pompe'a
Choroba Pompego (choroba spichrzania glikogenu typu II, GSDII, niedobór kwaśnej maltazy) to autosomalna recesywna choroba spichrzania lizosomalnego spowodowana patogennymi wariantami genu GAA (kwaśna alfa-glukozydaza) zlokalizowanego na chromosomie 17q25.3. Gen GAA koduje enzym odpowiedzialny za degradację glikogenu w lizosomach; jego niedobór prowadzi do postępującego gromadzenia się glikogenu w komórkach mięśniowych, powodując osłabienie mięśni szkieletowych, niewydolność oddechową i zajęcie serca. Choroba Pompego ma szerokie spektrum kliniczne, od klasycznej postaci choroby Pompego o początku niemowlęcym (IOPD) — charakteryzującej się szybko postępującą kardiomiopatią przerostową, głębokim niedonapięciem mięśniowym i niewydolnością oddechową w pierwszych miesiącach życia — po postać o późnym początku (LOPD), występującą od wczesnego dzieciństwa do ósmej dekady życia, z postępującym osłabieniem mięśni proksymalnych i niewydolnością oddechową bez zajęcia serca.
Genetyka molekularna choroby Pompego jest złożona. Odnotowano ponad 900 wariantów genu GAA. Najczęstszym wariantem powodującym chorobę u osób pochodzenia europejskiego jest c.-32-13T>G (IVS1) – wariant z nieszczelnym miejscem splicingu, który pozwala na produkcję około 10–20% normalnego mRNA GAA i wiąże się z późnym początkiem choroby. Najczęstszym wariantem patogennym u pacjentów pochodzenia afrykańskiego jest p.Arg854X. Kluczową złożonością molekularną jest allel pseudoniedoboru GAA (c.1726G>A; p.Gly576Ser i c.2065G>A; p.Glu689Lys, zwykle w układzie cis tworzącym haplotyp c.[1726G>A;2065G>A]), który zmniejsza aktywność enzymu GAA w testach biochemicznych, nie powodując jednak choroby. Ten allel pseudoniedoboru utrudnia programy badań przesiewowych noworodków i testy nosicielstwa, powodując wyniki fałszywie dodatnie, które wymagają potwierdzenia molekularnego w celu rozstrzygnięcia.
Alfa-glukozydaza (Myozyme/Lumizyme) stanowi od 2006 roku standardową terapię enzymatyczną (ERT) w leczeniu choroby Pompego i znacznie spowalnia postęp choroby, zwłaszcza u pacjentów z LOPD leczonych przed wystąpieniem nieodwracalnej utraty masy mięśniowej. W 2022 r. alfa-cipaglukozydaza (Pombiliti) w połączeniu z miglustatem (farmakologicznym chaperonem) otrzymała zatwierdzenie FDA, wykazując w badaniu PROPEL przewagę nad standardową alfa-alglukozydazą w LOPD. Metody terapii genowej wykorzystujące wektory AAV są obecnie w fazie badań klinicznych. Okres maksymalnej korzyści z leczenia w przypadku LOPD przypada na wczesny etap choroby — przed rozwojem zwłóknienia mięśni przepony i mięśni obręczy kończyn — co sprawia, że wczesna diagnostyka molekularna ma kluczowe znaczenie.
Klasyczna postać choroby Pompe’a u niemowląt i postać o późnym początku różnią się pod względem fenotypowym. Wariant IVS1 (c.-32-13T>G) pozwala na pewną resztkową ekspresję GAA i jest silnie powiązany z postacią o późnym początku. Osoby będące heterozygotami złożonymi pod względem genu IVS1 oraz allela zerowego wykazują zróżnicowane objawy, które jednak zazwyczaj pojawiają się w późniejszym wieku.
Allel powodujący rzekomy niedobór GAA prowadzi do wyników fałszywie dodatnich w testach enzymatycznych i badaniach przesiewowych noworodków. Jedynie genotypowanie molekularne pozwala odróżnić prawdziwą chorobę Pompego od rzekomego niedoboru — a pełny genotyp GAA decyduje o tym, który protokół ERT jest optymalny.
Allele powodujące pozorny niedobór prowadzą do fałszywie dodatnich wyników badań przesiewowych w kierunku choroby Pompego, co można wyjaśnić jedynie za pomocą badań molekularnych
Programy badań przesiewowych noworodków, które wykrywają niską aktywność enzymu alfa-glukozydazy (GAA) w próbkach krwi z wysuszonych plamek, dają wyniki fałszywie dodatnie u niemowląt będących nosicielami jednego lub dwóch alleli pseudoniedoboru GAA — alleli, które obniżają aktywność enzymu w badaniu, nie powodując jednak choroby. Allel pseudoniedoboru (c.[1726G>A;2065G>A]) występuje u około 3–4% ogółu populacji i jest szczególnie powszechny w grupach pochodzenia azjatyckiego. Odróżnienie noworodka z prawdziwą chorobą Pompego od noworodka z wynikiem pozytywnym na pseudoniedobór wymaga molekularnego genotypowania GAA. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala zidentyfikować wszystkie warianty GAA, w tym haplotyp pseudoniedoboru, co pozwala rozstrzygnąć niejednoznaczne wyniki badań przesiewowych noworodków i zapobiega zarówno nadmiernemu leczeniu nosicieli pseudoniedoboru, jak i niedostatecznemu leczeniu przypadków prawdziwej choroby Pompego.
Kombinacja cipaglukozydazy alfa i miglustatu wykazuje specyficzne dla poszczególnych wariantów cechy odpowiedzi
Cipaglukozydaza alfa (Pombiliti) to rekombinowana GAA nowej generacji, charakteryzująca się lepszym wchłanianiem za pośrednictwem receptora mannozo-6-fosforanowego oraz lepszym dostarczaniem do mięśni w porównaniu ze standardową alglukozydazą alfa. Jednoczesne podawanie miglustatu stabilizuje enzym podczas krążenia krwi. Dane z badania klinicznego PROPEL wykazały ogólną przewagę nad standardową ERT, przy czym największe korzyści odnotowano u pacjentów, którzy wcześniej nie byli leczeni ERT, oraz u pacjentów z wyższymi mianami przeciwciał przeciwko lekowi. Genotyp GAA — w szczególności to, czy u pacjenta występuje resztkowa produkcja mRNA GAA (np. heterozygoty złożone IVS1/null) — wpływa na ryzyko rozwoju przeciwciał przeciwko lekowi, co jest kluczowym czynnikiem determinującym odpowiedź na ERT. Pełna charakterystyka GAA pozwala przewidzieć ryzyko tej odpowiedzi immunologicznej.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się chorobą Pompego oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy z dowolnego kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
