Zespół policystycznych nerek — najczęstsza choroba genetyczna zagrażająca życiu, dotykająca 1 na 400–1000 osób, w której konkretny genotyp PKD1 lub PKD2 pozwala przewidzieć czas do wystąpienia niewydolności nerek z dokładnością do dziesięcioleci oraz decyduje o kwalifikacji do leczenia tolvaptanem.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala na pełną identyfikację genu PKD1 – w tym dokładne określenie jego lokalizacji poprzez 6 pseudogenów, które utrudniają standardowe sekwencjonowanie – oraz genu PKD2, dostarczając genotyp pozwalający przewidzieć czas do wystąpienia schyłkowej niewydolności nerek (ESRD) oraz odpowiedź na leczenie.
Zespół policystycznych nerek
Autosomalna dominująca polikistyczna choroba nerek (ADPKD) jest najczęstszą dziedziczną chorobą nerek i jedną z najczęstszych zagrażających życiu chorób genetycznych, dotykającą około 1 na 400–1000 osób — szacunkowo 12,5 miliona osób na całym świecie. ADPKD jest spowodowana wariantami patogennymi w genach PKD1 (~78% przypadków, chromosom 16p13.3) lub PKD2 (~15%, chromosom 4q22.1), kodujących odpowiednio polikystynę-1 i polikystynę-2. Białka te tworzą kompleks kanałów przepuszczających wapń, który wykrywa przepływ płynów w pierwotnym rzęsku komórek nabłonkowych nerek. Postępujący rozwój obustronnych torbieli nerkowych prowadzi do znacznego powiększenia nerek i ostatecznie do schyłkowej niewydolności nerek.
ADPKD powoduje postępujący, obustronny wzrost torbieli nerkowych na przestrzeni dziesięcioleci, wywołując ból w okolicy lędźwiowej, krwiomocz, nadciśnienie tętnicze, infekcje dróg moczowych oraz kamicę nerkową. Torbiele wątroby rozwijają się u około 80% pacjentów i zazwyczaj przebiegają bezobjawowo, ale u niektórych kobiet mogą powodować znaczne powiększenie wątroby. Tętniaki śródczaszkowe występują u około 8% pacjentów z ADPKD (w porównaniu z 2–3% w populacji ogólnej) — ich pęknięcie powoduje krwotok podpajęczynówkowy o wysokiej śmiertelności. Zaburzenia te wiążą się z wypadaniem płatka zastawki mitralnej, uchyłkami okrężnicy i przepuklinami pachwinowymi. Średni wiek wystąpienia schyłkowej niewydolności nerek wynosi około 54 lat w przypadku PKD1 i 74 lat w przypadku PKD2 — różnica 20 lat wynika wyłącznie z genotypu.
Tolvaptan (Jynarque), antagonista receptora V2 wazopresyny, został zatwierdzony przez FDA w 2018 roku do stosowania w leczeniu ADPKD u osób dorosłych zagrożonych szybkim postępem choroby. Tolvaptan zmniejsza tempo wzrostu całkowitej objętości nerek i spowalnia spadek eGFR, opóźniając wystąpienie schyłkowej niewydolności nerek (ESRD). Wskazania FDA dotyczą konkretnie szybko postępującej postaci ADPKD — zazwyczaj wariantów skróconych genu PKD1, które powodują najszybszy postęp choroby. Klasyfikacja obrazowa Mayo (htTKV) w połączeniu z genotypem molekularnym zapewnia najdokładniejszą stratyfikację ryzyka przy podejmowaniu decyzji dotyczących leczenia tolvaptanem. Ponadto u pacjentów z ADPKD z historią rodzinną tętniaków lub krwotoków podpajęczynówkowych zaleca się badania przesiewowe w kierunku tętniaków śródczaszkowych (MRA mózgu).
Warianty skrócone genu PKD1 (powodujące przesunięcie ramki odczytu, nonsensowne, zakłócające splicing) prowadzą do schyłkowej niewydolności nerek (ESRD) około 12 lat wcześniej niż warianty nie skrócone (missense) genu PKD1. Konkretny typ wariantu pozwala na dokładniejsze określenie rokowania, wykraczając poza proste rozróżnienie między genami PKD1 a PKD2.
Gen PKD1 posiada 6 wysoce homologicznych pseudogenów na tym samym chromosomie, co utrudnia standardowe sekwencjonowanie. Sekwencjonowanie całego genomu oparte na długich odczytach pozwala na mapowanie regionu pseudogenów w celu zidentyfikowania prawdziwych wariantów patogennych genu PKD1.
Różnica między genami PKD1 a PKD2 determinuje 20-letnią różnicę w czasie wystąpienia schyłkowej niewydolności nerek — genotyp jest najsilniejszym czynnikiem prognostycznym w przypadku chorób nerek
Średni wiek wystąpienia schyłkowej niewydolności nerek (ESRD) wynosi około 54 lat w przypadku patogennych wariantów genu PKD1 i około 74 lat w przypadku patogennych wariantów genu PKD2 — co sprawia, że genotyp molekularny jest najsilniejszym czynnikiem prognostycznym w przypadku ADPKD, przewyższającym znaczeniem samą wyjściową objętość nerek, wiek lub nachylenie krzywej eGFR. Ponadto warianty PKD1 powodujące skrócenie łańcucha białkowego prowadzą do ESRD około 12 lat wcześniej niż warianty PKD1 niepowodujące skrócenia łańcucha, co dodatkowo precyzuje rokowanie. Informacja ta ma bezpośredni wpływ na podejmowanie decyzji klinicznych: moment rozpoczęcia leczenia tolvaptanem, docelowe wartości ciśnienia tętniczego, rozmowy dotyczące planowania rodziny oraz moment przeszczepu nerki od żywego dawcy zależą od przewidywanego harmonogramu rozwoju ESRD.
Kwalifikacja do leczenia tolvaptanem wymaga oceny szybkiego postępu choroby — genotyp stanowi kluczowy element modelu ryzyka
Zgodnie z ulotką FDA dotyczącą tolvaptanu (Jynarque) lek ten jest przeznaczony dla pacjentów z ADPKD, u których istnieje ryzyko szybkiego postępu choroby. Skala PROPKD, uwzględniająca genotyp molekularny (trunkcjonujące warianty PKD1 = najwyższy wynik) oraz czynniki kliniczne (płeć, moment wystąpienia nadciśnienia, zdarzenia urologiczne), pozwala przewidzieć szybki postęp choroby z potwierdzoną dokładnością. Pacjenci z niskim wynikiem PROPKD (zazwyczaj warianty PKD2 lub PKD1 bez skrócenia) mogą nie kwalifikować się do leczenia tolvaptanem — co pozwala uniknąć poważnych skutków ubocznych leku (wielomocz, polidypsja, monitorowanie hepatotoksyczności) u pacjentów, którzy prawdopodobnie nie odniosą korzyści. Sekwencjonowanie całego genomu dostarcza danych molekularnych do tego modelu stratyfikacji ryzyka.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się policystyczną chorobą nerek oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
