Zespół Peutz-Jeghersa — dziedziczny zespół hamartomatyczny, wiążący się z ponad 85-procentowym skumulowanym ryzykiem zachorowania na nowotwór w sześciu układach narządów, wymagający wprowadzenia protokołów obserwacji już w dzieciństwie.
Gen STK11 znajduje się na liście wyników dodatkowych ACMG SF w wersji 3.2. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala na pełną charakterystykę genu STK11, w tym rozpoznanie rozległych delecji genomowych, które stanowią około 30% przypadków zespołu PJS i nie są wiarygodnie wykrywane przez standardowe panele sekwencjonowania.
Zespół Peutz-Jeghersa
Zespół Peutz-Jeghersa (PJS) to autosomalnie dominująca dziedziczna polipowatość przewodu pokarmowego i zespół predyspozycji do nowotworów, spowodowany patogennymi wariantami genetycznymi w genie STK11 (kinaza serynowo-treoninowa 11, znana również jako LKB1) na chromosomie 19p13.3. Gen STK11 koduje kinazę o działaniu supresorowym nowotworów, która aktywuje AMPK oraz reguluje polaryzację komórek i metabolizm energetyczny. PJS charakteryzuje się rozwojem charakterystycznych polipów hamartomatycznych w całym przewodzie pokarmowym (przede wszystkim w jelicie cienkim), charakterystyczną pigmentacją błon śluzowych i skóry (plamy melaniny na wargach, błonie śluzowej jamy ustnej, palcach i okolicy odbytu) oraz znacznie podwyższonym ryzykiem nowotworów w wielu narządach. Częstość występowania PJS wynosi około 1 na 50 000–200 000 osób.
Łączne ryzyko zachorowania na nowotwór w ciągu całego życia w przypadku zespołu Polypowatości Jarmię-Jelit (PJS) jest niezwykle wysokie — szacuje się je na ponad 85% do 70. roku życia w odniesieniu do dowolnego nowotworu. Indywidualne ryzyko zachorowania na nowotwór w ciągu całego życia obejmuje: nowotwory przewodu pokarmowego (jelita cienkiego ~13%, jelita grubego ~40%, żołądka ~29%), raka trzustki (~36%), raka piersi (~54% u kobiet), nowotworów ginekologicznych (gruczolakorak szyjki macicy ~10%, macicy ~9%, guz strun płciowych jajnika z kanalikami pierścieniowymi ~21%) oraz raka płuc (~15%). Nadzór należy rozpocząć w dzieciństwie i musi on obejmować jednocześnie wiele układów narządów. Polipy jelita cienkiego powodują nawracające wgłobienia w dzieciństwie, często wymagające operacji ratunkowej — można temu zapobiec poprzez regularną obserwację jelita cienkiego i profilaktyczną polipektomię w przypadku wykrycia dużych polipów.
Około 94–96% przypadków zespołu Peutz-Jeghersa (PJS) spełniających kryteria diagnostyczne zespołu charakteryzuje się wykrywalną patogenną mutacją genu STK11. Duże delecje lub duplikacje wykrywalne metodą MLPA lub analizą wariantów liczby kopii stanowią około 30% patogennych wariantów genu STK11 — nie są one wykrywane przez standardowe panele oparte wyłącznie na sekwencjonowaniu eksonów. Pozostałe ~4–6% klinicznych przypadków PJS bez wykrywalnych wariantów STK11 może stanowić mozaikowość somatyczną, głębokie warianty intronowe lub heterogenność genetyczną. Gen STK11 znajduje się na liście wyników dodatkowych ACMG SF v3.2, co odzwierciedla dostępność skutecznych interwencji nadzorczych, które znacznie zmniejszają śmiertelność z powodu nowotworów u potwierdzonych nosicieli.
30% patogennych wariantów genu STK11 to rozległe delecje, które nie są wykrywane przez standardowe panele sekwencjonowania. W przypadku zespołu, w którym monitorowanie nowotworowe należy rozpocząć już w dzieciństwie, pominięcie diagnozy ma konsekwencje na całe życie.
Jedna trzecia wariantów genu STK11 powodujących zespół PJS to delecje — standardowe panele sekwencjonowania ich nie wykrywają
Około 30% potwierdzonych wariantów patogennych genu STK11 to rozległe delecje genomowe obejmujące jeden lub więcej eksonów. Standardowe panele sekwencjonowania nowej generacji, które sekwencjonują eksony kodujące genu STK11, nie wykrywają w sposób wiarygodny rozległych delecji bez przeprowadzenia specjalistycznej analizy wariantów liczby kopii. W kilku opublikowanych przypadkach rodzin z PJS o kompletnym fenotypie klinicznym — pigmentacją błon śluzowych i skóry, licznymi polipami hamartomatycznymi oraz charakterystycznym wywiadem rodzinnym — stwierdzono delecje STK11, które poprzedzały ujemne wyniki paneli o miesiące lub lata. W przypadku zespołu, w którym pediatryczna obserwacja jelita cienkiego rozpoczyna się w wieku 8 lat (zalecenie NCCN), a obserwacja trzustki w wieku 35 lat, opóźnienie diagnostyczne tej wielkości ma bezpośrednie konsekwencje dla profilaktyki nowotworowej.
Program monitorowania PJS obejmuje jednocześnie sześć różnych rodzajów nowotworów — co oznacza, że do rozpoczęcia pełnego protokołu wystarczy jedna ostateczna diagnoza
Ustalenie diagnozy molekularnej STK11 powoduje uruchomienie protokołu nadzoru wielonarządowego, który znacznie różni się od standardowych zaleceń dotyczących badań przesiewowych w kierunku nowotworów. Wytyczne NCCN PJS zalecają: endoskopię górnego odcinka przewodu pokarmowego i kolonoskopię od 8. do 10. roku życia; endoskopię jelita cienkiego/endoskopię kapsułkową od 8. do 10. roku życia; coroczne badanie MRI piersi od 25. roku życia oraz mammografię od 30. roku życia; coroczne badanie ultrasonograficzne miednicy lub ocenę endometrium od 18. roku życia; monitorowanie trzustki od 35. roku życia (ultrasonografia endoskopowa/MRI); oraz badanie jąder u mężczyzn od urodzenia (ryzyko SCTAT). Żaden standardowy program badań przesiewowych w kierunku nowotworów nie obejmuje wszystkich tych badań — potwierdzona diagnoza molekularna PJS jest warunkiem wstępnym rozpoczęcia kompleksowego protokołu, który sprawia, że monitorowanie ma sens.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się zespołem Peutz-Jeghersa oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
