Osteogenesis imperfecta — „choroba kruchych kości”, obejmująca szerokie spektrum nasilenia objawów, od sporadycznych złamań po śmiertelność okołoporodową, w której konkretny wariant kolagenu typu I determinuje rokowanie, sposób leczenia oraz ryzyko nawrotu choroby w przyszłych ciążach.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala zbadać geny COL1A1, COL1A2 oraz ponad 20 innych genów związanych z osteogenesisis imperfecta (OI) — zapewniając diagnozę molekularną, która pozwala określić typ OI, rokowanie co do stopnia zaawansowania choroby oraz sposób dziedziczenia na potrzeby poradnictwa genetycznego.
Niedoskonała osteogeneza
Osteogenesis imperfecta (OI) to grupa dziedzicznych zaburzeń tkanki łącznej spowodowanych głównie przez warianty patogeniczne w genach COL1A1 (chromosom 17q21.33) lub COL1A2 (chromosom 7q21.3), kodujących odpowiednio łańcuchy α1 i α2 kolagenu typu I. Kolagen typu I jest najliczniejszym białkiem strukturalnym w kościach, skórze, ścięgnach i twardówkach. OI dzieli się na typy I–V (klasyfikacja Sillence'a) w oparciu o nasilenie objawów klinicznych, z dodatkowymi podtypami molekularnymi (typy VI–XX) zdefiniowanymi przez warianty w genach niekolagenowych zaangażowanych w przetwarzanie kolagenu, mineralizację kości i funkcję osteoblastów. Ogólna częstość występowania wynosi około 1 na 10 000–20 000.
OI typu I (łagodny, ilościowy niedobór kolagenu spowodowany obecnością alleli zerowych genu COL1A1) powoduje łamliwość kości, niebieskie twardówki, niemal normalny wzrost oraz złamania, których liczba zmniejsza się po okresie dojrzewania. Typ II (śmiertelny w okresie okołoporodowym) powoduje liczne złamania wewnątrzmaciczne, poważne deformacje szkieletu oraz śmierć w okresie okołoporodowym. Typ III (postępująca deformacja) powoduje poważną kruchość kości, postępujące deformacje szkieletu, bardzo niski wzrost i konieczność poruszania się na wózku inwalidzkim. Typ IV (umiarkowany) plasuje się pomiędzy typami I i III. Konkretny wariant COL1A1/COL1A2 — a w szczególności to, czy powoduje on niedobór ilościowy (haploinsufficiency, zazwyczaj łagodniejszy) czy też defekt strukturalny (substytucja glicyny w potrójnej helisie kolagenu, zazwyczaj cięższy) — jest głównym czynnikiem determinującym ciężkość choroby.
Leczenie obejmuje cykliczne podawanie dożylne bisfosfonianów (pamidronian, zoledronian – standardowe postępowanie w przypadku umiarkowanej i ciężkiej postaci OI, zwiększające gęstość kości i zmniejszające częstość złamań), postępowanie ortopedyczne, w tym wszczepianie prętów śródszpikowych do kości długich, fizjoterapię oraz badania słuchu (postępująca utrata słuchu występuje u około 50% dorosłych z OI). Nowsze terapie w fazie rozwoju obejmują przeciwciała przeciwko sklerostynie (romosozumab), terapię anty-RANKL (denosumab, wykazujący korzyści w badaniach dotyczących pediatrycznej postaci OI) oraz metody terapii genowej ukierunkowane na dominująco-negatywne allele COL1A1/COL1A2.
Recesywna postać osteogenesis imperfecta (typy VI–XX) jest spowodowana mutacjami w genach niekodujących kolagenu, takich jak SERPINF1, CRTAP, P3H1, PPIB, BMP1, IFITM5 i inne — nie są one wykrywane w badaniach ograniczających się wyłącznie do genów COL1A1/COL1A2.
Geny COL1A1 i COL1A2 odpowiadają za około 85–90% przypadków osteogenesis imperfecta (OI), ale ponad 20 innych genów powoduje postacie recesywne i atypowe tej choroby. Badania pojedynczych genów nie pozwalają wykryć recesywnej postaci OI. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala ocenić pełny obraz molekularny.
Konkretny wariant kolagenu – haploinsufficiency a substytucja glicyny – decyduje o rokowaniu dotyczącym stopnia zaawansowania choroby
Allele zerowe COL1A1 (warianty powodujące przesunięcie ramki odczytu, warianty nonsensowne oraz warianty w miejscach splicingu, które generują przedwczesne kodony stopu) powodują ilościowy niedobór kolagenu — zazwyczaj łagodną postać OI typu I z niebieskimi twardówkami i zmniejszonym ryzykiem złamań po okresie dojrzewania. Natomiast substytucje glicyny w powtórzeniu Gly-X-Y potrójnej helisy kolagenu (szczególnie w regionie C-końcowym łańcucha α1) powodują strukturalne defekty kolagenu, które prowadzą do umiarkowanej lub ciężkiej postaci OI (typy II–IV). Ta korelacja między genotypem a stopniem ciężkości choroby umożliwia udzielenie porad prognostycznych w momencie diagnozy molekularnej — informacji, która nie jest dostępna na podstawie samej oceny klinicznej u noworodka lub płodu z złamaniem prenatalnym.
Złamania wykrywane w badaniu ultrasonograficznym przed urodzeniem mogą należeć do typu II (śmiertelnego) lub typu III (nie zagrażającego życiu) choroby Osteogenesis imperfecta — rozróżnia je diagnostyka molekularna
Badanie ultrasonograficzne w okresie prenatalnym może wykryć liczne złamania, skrócenie kończyn lub niedorozwój klatki piersiowej w drugim trymestrze ciąży. Kluczową kwestią kliniczną jest ustalenie, czy mamy do czynienia z OI typu II (śmiertelnym w okresie okołoporodowym, spowodowanym zazwyczaj dominującymi mutacjami de novo polegającymi na zastąpieniu glicyny w genach COL1A1/COL1A2) czy z OI typu III (ciężkim, ale dającym szansę na przeżycie, również spowodowanym defektami strukturalnymi kolagenu). Rozróżnienie to ma ogromne znaczenie dla poradnictwa dotyczącego postępowania. Diagnostyka molekularna na podstawie amniopunkcji lub biopsji kosmówki pozwala zidentyfikować konkretny wariant i — w oparciu o opublikowane dane dotyczące genotypu i fenotypu — zapewnić oparte na dowodach naukowych przewidywanie stopnia ciężkości choroby, czego nie zapewnia samo badanie ultrasonograficzne.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się niedoskonałością kostną oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
