Neurofibromatoza typu 1 — plamy typu café-au-lait, nerwiakowłókniaki oraz szereg powikłań związanych z wariantami genu NF1. Potwierdzenie genetyczne stanowi podstawę planu monitorowania przez całe życie.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala zidentyfikować warianty genu NF1, co umożliwia ustalenie korelacji między genotypem a fenotypem, określenie kwalifikacji do terapii oraz przewidzenie przebiegu stanu zdrowia w przyszłości dla Ciebie i Twojej rodziny.
Neurofibromatoza typu 1
Neurofibromatoza typu 1 jest spowodowana dziedzicznymi wariantami patogennymi w genie NF1, dużym genie (350 kb, 60 eksonów) kodującym neurofibrominę – regulator szlaku sygnałowego RAS. RAS kontroluje wzrost, proliferację i różnicowanie komórek. Neurofibromina zwykle działa jako hamulec sygnalizacji RAS; patogenne warianty genu NF1 eliminują ten hamulec, umożliwiając stałą aktywację RAS. Skutkiem tego jest rozległe powstawanie nowotworów, w tym plam café-au-lait, nerwiakowłókniaków skórnych i podskórnych, glejaków szlaków wzrokowych, nerwiakowłókniaków splotowatych oraz złośliwych guzów osłonki nerwów obwodowych (MPNST). Penetracja jest praktycznie całkowita — 100% nosicieli genu NF1 wykazuje pewne cechy kliniczne — jednak ekspresja jest bardzo zmienna, czasami nawet w obrębie tej samej rodziny.
Neurofibromatoza typu 1 dotyka około 1 na 3000 osób na całym świecie, co czyni ją jedną z najczęstszych autosomalnych dominujących chorób genetycznych. Około 50% przypadków to warianty de novo, bez historii rodzinnej. W genie NF1 skatalogowano ponad 3000 różnych wariantów patogennych, przy czym nie ma obszarów o zwiększonej częstotliwości mutacji — mutacje patogenne są rozmieszczone w całym regionie kodującym. Warianty NF1 obejmują wiele typów mutacji: mutacje punktowe, małe insercje/delecje, warianty miejsc splicingu, duże delecje (w tym mikrodelecje całego genu, które powodują cięższy fenotyp) oraz złożone rearanżacje. Ta ekstremalna heterogeniczność sprawia, że interpretacja wyników jest trudna bez dokładnej oceny genetycznej.
Określenie konkretnego wariantu NF1 ma bezpośrednie konsekwencje kliniczne. Delecje obejmujące cały gen wskazują na cięższy przebieg choroby, w tym większe ryzyko wystąpienia MPNST i niepełnosprawności intelektualnej — co pozwala na przyspieszenie monitorowania u nosicieli z grupy podwyższonego ryzyka. Potwierdzona diagnoza NF1 kwalifikuje pacjenta do terapii inhibitorem MEK (selumetinibem) — zatwierdzonym przez FDA specjalnie w przypadku nieoperacyjnych nerwiakowłókniaków splotowatych, który bezpośrednio zwalcza zaburzenia szlaku RAS spowodowane utratą NF1. Potwierdzenie genetyczne umożliwia przeprowadzenie badań kaskadowych u krewnych z grupy ryzyka oraz prenatalną/preimplantacyjną diagnostykę genetyczną w celu planowania rodziny.
Korelacja między genotypem a fenotypem w przypadku NF1 jest silna: delecje obejmujące cały gen wskazują na cięższy przebieg choroby i większe ryzyko wystąpienia MPNST, co wymaga intensywniejszej obserwacji w porównaniu z nosicielami mutacji punktowych.
Sekwencjonowanie genu NF1 jest znane z tego, że jest niezwykle trudne. Standardowe panele nie wykrywają delecji całego genu, złożonych rearanżacji oraz wariantów mozaikowych — które stanowią około 5% przypadków NF1.
Sekwencjonowanie NF1 utrudniają pseudogeny i warianty strukturalne
Gen NF1 jest wyjątkowo duży i trudny do dokładnego zsekwencjonowania. Zawiera liczne segmenty pseudogenów na innych chromosomach, co utrudnia standardowe sekwencjonowanie oparte na krótkich odczytach. Około 5% nosicieli genu NF1 ma delecje obejmujące cały gen – całkowitą utratę całego locus NF1 – co wymaga specjalistycznej analizy liczby kopii wykraczającej poza możliwości standardowego sekwencjonowania ukierunkowanego. Warianty mozaikowe genu NF1, występujące jedynie w niewielkiej części komórek krwi, nie są wykrywane przy standardowej głębokości sekwencjonowania. Sekwencjonowanie całego genomu zapewnia pełne pokrycie, w tym regiony podatne na pseudogeny, i wykrywa warianty strukturalne oraz warianty mozaikowe, które są pomijane przez panele ukierunkowane.
Typ NF1 decyduje o nasileniu choroby i kwalifikacji do leczenia
Potwierdzenie genetyczne NF1 umożliwia doradztwo w zakresie genotypu i fenotypu: nosiciele z delecjami obejmującymi cały gen powinni spodziewać się cięższego przebiegu choroby, większego ryzyka wystąpienia MPNST oraz potencjalnej niepełnosprawności intelektualnej — co wymaga bardziej intensywnej obserwacji nowotworowej. Wszyscy nosiciele NF1 z nieoperacyjnymi nerwiakowłókniakami splotowymi kwalifikują się obecnie do leczenia selumetinibem (Koselugo), zatwierdzonym przez FDA inhibitorem MEK, który bezpośrednio oddziałuje na szlak RAS, patologicznie aktywowany przez utratę NF1. Wynik badań genetycznych umożliwia przeprowadzenie kaskadowych badań rodzinnych, poradnictwo prenatalne oraz świadome planowanie przejścia do dorosłości.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się neurofibromatozą typu 1 oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy z dowolnego kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
