Choroby mitochondrialne — dotykają 1 na 5 000 osób i są spowodowane mutacjami w genomie mitochondrialnym lub jądrowym; sekwencjonowanie całego genomu jest jedynym badaniem, które pozwala jednocześnie zbadać oba genomy.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala odczytać kompletny genom mitochondrialny (37 genów) oraz wszystkie ponad 300 genów jądrowych kodujących białka mitochondrialne — rozwiązując tym samym problem diagnostyczny związany z obecnością dwóch genomów, który sprawia, że choroby mitochondrialne należą do najtrudniejszych przypadków diagnostyki molekularnej w medycynie.
Choroby mitochondrialne
Choroby mitochondrialne stanowią zróżnicowaną grupę zaburzeń spowodowanych upośledzeniem fosforylacji oksydacyjnej (OXPHOS) — mitochondrialnego szlaku wytwarzania energii, który generuje około 90% komórkowego ATP. Zaburzenia te są wyjątkowe pod względem genetycznym, ponieważ funkcja mitochondriów zależy od dwóch genomów: genomu mitochondrialnego (mtDNA, 37 genów kodujących 13 podjednostek OXPHOS, 22 tRNA i 2 rRNA) oraz genomu jądrowego (kodującego około 1500 białek kierowanych do mitochondriów, w tym czynniki montażu OXPHOS, enzymy utrzymania mtDNA oraz enzymy metaboliczne). Łączna częstość występowania wynosi około 1 na 5 000 — co sprawia, że choroby mitochondrialne należą do najczęstszych dziedzicznych zaburzeń metabolicznych.
Obraz kliniczny odzwierciedla zapotrzebowanie tkanek na energię: schorzenie dotyka przede wszystkim narządy o wysokim tempie metabolizmu. Do typowych objawów należą postępująca zewnętrzna porażenie nerwów okoruchowych (CPEO), opadanie powiek, miopatia, kardiomiopatia, utrata słuchu typu czuciowo-nerwowego, cukrzyca, drgawki, epizody przypominające udar, ataksja, neuropatia obwodowa, zwyrodnienie siatkówki oraz kwasica mleczanowa. Do dobrze zdefiniowanych zespołów mitochondrialnych należą MELAS (encefalopatia mitochondrialna, kwasica mleczanowa, epizody podobne do udaru mózgu — typowo m.3243A>G w MT-TL1), MERRF (padaczka miokloniczna z postrzępionymi włóknami czerwonymi — m.8344A>G w MT-TK), zespół Kearns-Sayre'a (CPEO, retinopatia pigmentowa, zaburzenia przewodzenia sercowego — duże delecje mtDNA) oraz zespół Leigha (postępująca neurodegeneracja pnia mózgu i zwojów podstawy mózgu — wiele przyczyn genetycznych).
Złożoność genetyczna chorób mitochondrialnych stwarza wyjątkowe wyzwania diagnostyczne. Warianty mtDNA dziedziczone są po matce, przy czym występuje zmienna heteroplazmia (stosunek mtDNA z mutacją do mtDNA typu dzikiego w każdej tkance, co determinuje nasilenie objawów klinicznych). Warianty genów jądrowych dziedziczone są zgodnie z zasadami dziedziczenia mendlowskiego. Ten sam zespół kliniczny może być spowodowany zarówno przez warianty mtDNA, jak i warianty jądrowe (np. zespół Leigha ma ponad 90 przyczyn genetycznych). Sekwencyjne badanie najpierw samego mtDNA, a następnie paneli jądrowych opóźnia diagnozę o miesiące, a nawet lata. WGS ocenia oba genomy jednocześnie — jest to jedyne dostępne klinicznie badanie, które to umożliwia.
Heteroplazmia mtDNA — czyli stosunek genomów mitochondrialnych typu mutacyjnego do genomów typu dzikiego — decyduje o nasileniu objawów klinicznych. Sekwencjonowanie całego genomu (WGS) pozwala określić poziom heteroplazmii, dostarczając informacji prognostycznych, które mogą zostać pominięte w przypadku ukierunkowanych badań mtDNA przy niskim poziomie heteroplazmii.
Choroby mitochondrialne są spowodowane mutacjami w dwóch odrębnych genomach. Badanie jednego genomu na raz opóźnia postawienie diagnozy o kilka miesięcy. WGS pozwala na jednoczesną analizę zarówno mtDNA, jak i DNA jądrowego — jest to jedyne badanie, które to umożliwia.
Ocena dwóch genomów w ramach jednego badania — sekwencjonowanie całego genomu (WGS) pozwala na jednoczesną analizę zarówno mtDNA, jak i wszystkich ponad 300 genów jądrowych związanych z mitochondriami
Tradycyjna diagnostyka chorób mitochondrialnych obejmuje badania przeprowadzane kolejno: najpierw sekwencjonowanie mtDNA, następnie (w przypadku wyniku negatywnego) panele genów jądrowych, a potem (jeśli wynik nadal jest negatywny) sekwencjonowanie całego eksomu DNA jądrowego. Każdy etap trwa od tygodni do miesięcy, a wielu pacjentów przechodzi wieloletnią diagnostyczną odyseję. WGS pozwala na ocenę całego genomu mitochondrialnego (w tym kwantyfikację heteroplazmii) oraz wszystkich genów mitochondrialnych kodowanych w jądrze komórkowym w ramach jednego badania przeprowadzanego na jednej próbce krwi. Ta równoległa ocena pozwala na jednoczesną identyfikację zarówno wariantów mtDNA, jak i wariantów jądrowych, eliminując opóźnienia związane z sekwencyjnym przeprowadzaniem badań.
Duże delecje mtDNA powodują zespół Kearnsa-Sayre'a i CPEO — nie są one wykrywane przez panele mutacji punktowych mtDNA
Pojedyncze delecje mtDNA o dużym zasięgu (zazwyczaj „częsta delecja” o długości 4 977 pz lub inne unikalne delecje o długości od 1 do 10 kb) powodują zespół Kearnsa-Sayre’a, przewlekłą postępującą oftalmoplegię zewnętrzną oraz zespół Pearsona. Standardowe panele mutacji punktowych mtDNA (które badają określone pozycje nukleotydów) nie wykrywają tych delecji — wymagają one zastosowania metody Southern blot, PCR o dalekim zasięgu lub sekwencjonowania całego genomu mitochondrialnego. Sekwencjonowanie całego genomu mitochondrialnego (WGS) obejmuje cały genom mitochondrialny, wykrywając zarówno warianty punktowe, jak i rearanżacje strukturalne, w tym delecje, duplikacje i rearanżacje.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się chorobami mitochondrialnymi oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
