Choroba Krabbe’a — śmiertelna leukodystrofia, w przypadku której 30-dniowe okno terapeutyczne po urodzeniu decyduje o tym, czy przedobjawowy przeszczep komórek macierzystych pozwoli zachować funkcje neurologiczne, czy też szansa ta zostanie utracona na zawsze.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala zidentyfikować wszystkie warianty genu GALC — w tym delecję o długości 30 kb, powszechną w populacjach europejskich — umożliwiając badania przesiewowe nosicieli, diagnostykę prenatalną oraz kluczową wczesną identyfikację, która pozwala na przeprowadzenie przedobjawowego przeszczepu komórek macierzystych krwiotwórczych (HSCT).
Choroba Krabbe'a
Choroba Krabbe'a (leukodystrofia z komórkami globoidowymi) to autosomalna recesywna choroba spichrzeniowa lizosomalna spowodowana patogennymi wariantami genu GALC (galaktozyloceramidaza) zlokalizowanego na chromosomie 14q31.3. Niedobór GALC prowadzi do gromadzenia się psychozyny (galaktozylosfingozyny), która jest bezpośrednio toksyczna dla oligodendrocytów i komórek Schwanna — komórek produkujących mielinę w ośrodkowym i obwodowym układzie nerwowym. Postępująca demielinizacja powoduje wyniszczający fenotyp kliniczny. Dziecięca postać choroby Krabbe'a dotyka około 1 na 100 000 noworodków, a częstość występowania jest wyższa w populacjach skandynawskich.
Dziecięca postać choroby Krabbe'a objawia się w wieku 3–6 miesięcy drażliwością, postępującym spastycznością, regresją rozwoju, zanikiem nerwu wzrokowego oraz neuropatią obwodową. Nieleczona choroba ma szybki i niezmiennie śmiertelny przebieg — większość dotkniętych nią dzieci umiera przed ukończeniem 2. roku życia. Postacie o późnym początku (młodzieńcze i dorosłe) objawiają się postępującym spastycznym niedowładem kończyn dolnych, neuropatią obwodową i pogorszeniem funkcji poznawczych i mogą być błędnie rozpoznane jako stwardnienie rozsiane, dziedziczna spastyczna paraplegia lub inne schorzenia demielinizacyjne.
Przeszczep komórek macierzystych układu krwiotwórczego (HSCT) w fazie przedobjawowej — wykonywany przed upływem 30 dni życia w przypadku dziecięcej postaci choroby Krabbe’a — może znacząco zmienić przebieg choroby, pozwalając zachować funkcje poznawcze i przedłużając życie o lata, a nawet dziesięciolecia. To wąskie okno terapeutyczne wymaga jednak zidentyfikowania chorych noworodków przed wystąpieniem objawów. W 2006 r. stan Nowy Jork wprowadził powszechne badania przesiewowe noworodków w kierunku choroby Krabbe'a, a od tego czasu kilka innych stanów dołączyło do tej inicjatywy. W populacjach, w których nie ma powszechnych badań przesiewowych noworodków, jedyną drogą do rozpoznania przedobjawowego jest badanie nosicielstwa i diagnostyka prenatalna poprzez molekularne genotypowanie GALC.
Delecja o długości 30 kb w genie GALC (c.1161+6532_polyA del) stanowi około 40–50% alleli chorobotwórczych w populacjach europejskich. Standardowe panele do sekwencjonowania eksonów mogą pominąć tę dużą delecję — sekwencjonowanie całego genomu pozwala ją wykryć bezpośrednio.
Badania enzymatyczne pozwalają wykryć niską aktywność enzymu GALC, ale nie pozwalają odróżnić postaci dziecięcej od postaci o późnym początku. Genotyp GALC decyduje o nasileniu choroby i kwalifikacji do przeszczepu komórek macierzystych krwiotwórczych — są to informacje, których sama aktywność enzymatyczna nie dostarcza.
Delecja GALC o długości 30 kb nie jest wykrywana przez panele do sekwencjonowania eksonów — sekwencjonowanie całego genomu pozwala ją bezpośrednio zidentyfikować
Najczęstszym allelem patogennym genu GALC w populacjach europejskich jest delecja genomowa o długości około 30 kb (c.1161+6532_polyA del), która usuwa eksony 11–17 i rozciąga się na region flankujący 3'. Tej dużej wariacji strukturalnej nie da się wykryć za pomocą standardowych paneli do sekwencjonowania eksonów ani sekwencjonowania metodą Sangera poszczególnych eksonów — wymaga ona albo analizy delecji/duplikacji (MLPA), albo sekwencjonowania całego genomu, które odczytuje bezpośrednio w punktach złamania delecji. Pacjent z jedną mutacją punktową GALC i jedną delecją o długości 30 kb będzie wykazywał heterozygotyczność (będzie nosicielem) w przypadku samego sekwencjonowania eksonów, co może opóźnić rozpoznanie u dotkniętego chorobą niemowlęcia w krytycznym oknie terapeutycznym.
Wykrycie nosicielstwa przed ciążą pozwala na zaplanowanie porodu w ośrodkach dysponujących możliwością przeprowadzenia HSCT — 30-dniowy termin jest niepodważalny
Aby osiągnąć optymalne wyniki, przedobjawowy przeszczep komórek macierzystych krwiotwórczych (HSCT) w przypadku dziecięcej postaci choroby Krabbe’a należy przeprowadzić przed upływem około 30 dni życia. Oznacza to, że ciążę z grupy ryzyka należy zidentyfikować jeszcze przed porodem, poród musi odbyć się w ośrodku zdolnym do natychmiastowego przeprowadzenia badań kwalifikacyjnych do HSCT lub w jego pobliżu, a poszukiwanie dawcy musi rozpocząć się jeszcze przed narodzinami dziecka. Nie jest to możliwe, jeśli pierwszym sygnałem choroby Krabbe'a jest wynik badań przesiewowych noworodków — co w wielu stanach zajmuje 5–7 dni, a po tym następują badania potwierdzające. Badania przesiewowe nosicieli poprzez sekwencjonowanie całego genomu pozwalają zidentyfikować pary z grupy ryzyka jeszcze przed poczęciem, dając im cały okres ciąży na zaplanowanie porodu i przeszczepu.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Some people don't wait for a diagnosis or a family history to act. Whole genome sequencing gives you the complete genetic picture now — so you and your doctor can make informed decisions before anything becomes urgent.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się chorobą Krabbe'a oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
