Choroby zapalne jelit — choroba Leśniowskiego-Crohna i wrzodziejące zapalenie jelita grubego wiążą się z ponad 200 genetycznymi loci podatności. Zrozumienie profilu ryzyka genetycznego pomaga w doborze leczenia i przewidywaniu przebiegu choroby.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala poznać pełny obraz genetycznej podatności na choroby zapalne jelit, umożliwiając identyfikację wariantów genów NOD2 i IL23R, które pozwalają przewidzieć ciężkość przebiegu choroby oraz odpowiedź na leczenie.
Choroba zapalna jelit (choroba Leśniowskiego-Crohna)
Choroby zapalne jelit (IBD), w tym choroba Leśniowskiego-Crohna (CD) i wrzodziejące zapalenie jelita grubego, charakteryzują się przewlekłym stanem zapalnym jelit, prowadzącym do bólu brzucha, biegunki, krwi w stolcu, utraty masy ciała oraz potencjalnych powikłań, takich jak zwężenia, przetoki i rak jelita grubego. Częstość występowania choroby Leśniowskiego-Crohna wynosi około 1 na 1000 osób w krajach rozwiniętych, przy czym zachorowalność jest wyższa wśród młodszych pacjentów (szczyt zachorowań przypada na wiek 15–35 lat). Znaczący jest wpływ czynników genetycznych: szacowana dziedziczność wynosi 50–80%, a w tej dziedzinie zidentyfikowano ponad 200 loci GWAS związanych z IBD. Pierwszym zidentyfikowanym genem podatności na chorobę Leśniowskiego-Crohna był NOD2/CARD15 w 2001 r., co stanowiło przełomowe odkrycie, które otworzyło drogę do zrozumienia dysfunkcji układu odpornościowego w CD. NOD2 koduje wewnątrzkomórkowy receptor rozpoznający wzorce, który wykrywa bakteryjny dipeptyd muramylowy (MDP), wyzwalając sygnalizację NF-κB i odpowiedź zapalną. Trzy powszechne warianty NOD2 (R702W, G908R, 1007fs) odpowiadają za około 15–20% ryzyka przypisywanego populacji u pacjentów z chorobą Leśniowskiego-Crohna o pochodzeniu europejskim.
Homozygotyczne lub złożone heterozygotyczne warianty genu NOD2 wiążą się z około 20–40-krotnym wzrostem ryzyka zachorowania na chorobę Leśniowskiego-Crohna w porównaniu z osobami, które nie są nosicielami tych wariantów. Warianty genu NOD2 powodujące utratę funkcji upośledzają wykrywanie cząsteczek MDP i osłabiają reakcje zapalne na bakterie, paradoksalnie zwiększając ryzyko choroby poprzez nieprawidłowe powstrzymywanie bakterii i dysbiotyczną ekspansję flory patogennej. Ten sprzeczny z intuicją mechanizm – dlaczego osłabiona odpowiedź immunologiczna miałaby powodować stan zapalny? – jest obecnie rozumiany w kontekście dysbiozy i dysfunkcji bariery. Gen IL23R koduje receptor interleukiny-23, biorący udział w różnicowaniu komórek z linii Th17; wariant ochronny rs11209026 (R381Q) faktycznie zmniejsza polaryzację Th17, co sugeruje, że nadaktywacja osi IL-23/Th17 napędza IBD. Odkrycie to doprowadziło bezpośrednio do rozwoju terapii: inhibitory szlaku IL-23 (ustekinumab, risankizumab, guselkumab) są obecnie zatwierdzone do stosowania w leczeniu CD i UC, wywołując spektakularne odpowiedzi kliniczne w podgrupach pacjentów.
Genotypowanie genu NOD2 dostarcza informacji prognostycznych dotyczących przebiegu choroby: u nosicieli homozygotycznych genu NOD2 choroba zazwyczaj pojawia się wcześniej, obejmuje większy obszar jelita grubego i wiąże się z wyższym odsetkiem powikłań, w tym zwężeń i przetok. Nosiciele wariantów ochronnych genu IL23R wykazują lepszą odpowiedź na inhibitory IL-23, co sugeruje, że w przyszłości prognozy farmakogenomiczne mogłyby pomóc w wyborze terapii. Zrozumienie genetycznych podstaw IBD miało zasadniczy wpływ na rozwój leków, a nie na zmianę indywidualnego postępowania z pacjentem; przełomowe odkrycie, że warianty IL23R mają działanie ochronne, doprowadziło bezpośrednio do powstania ustekinumabu, risankizumabu i guselkumabu — obecnie zatwierdzonych terapii, z których korzysta szersza populacja pacjentów z IBD. Zrozumienie genetycznych podstaw IBD zmienia perspektywę kliniczną z postrzegania tej choroby przede wszystkim jako zaburzenia żołądkowo-jelitowego na uznanie jej głębokich immunologicznych podstaw.
Badania genetyczne nie są standardową metodą diagnostyczną w przypadku chorób zapalnych jelit. Test Genome Test obejmuje ponad 200 loci z badań GWAS, umożliwiając kompleksową ocenę ryzyka genetycznego.
W chorobach zapalnych jelit bierze udział ponad 200 loci genetycznych, z których każde ma niewielki indywidualny wpływ
Wkład genetyczny w rozwój chorób zapalnych jelit rozkłada się na ponad 200 loci zidentyfikowanych w badaniach GWAS, z których każde ma niewielki indywidualny wpływ. Standardowe panele genetyczne nie uwzględniają tej poligenicznej struktury. Genotypowanie genu NOD2 jest czasami wykonywane w celu oceny rokowań, ale nie stanowi rutynowej procedury w diagnostyce chorób zapalnych jelit, która opiera się na endoskopii, badaniu histologicznym i radiografii. Badania genetyczne nie zastępują diagnozy klinicznej. Jednak sekwencjonowanie całego genomu dostarcza kompleksowych danych dotyczących wariantów GWAS niezbędnych do przyszłego obliczania poligenicznej oceny ryzyka — umożliwiając zindywidualizowaną ocenę ryzyka genetycznego, która może ostatecznie pomóc w ustaleniu intensywności terapii, przewidywaniu ciężkości choroby oraz stanowić podstawę do badań przesiewowych w rodzinie.
Warianty genu NOD2 pozwalają przewidzieć przebieg choroby i możliwości terapeutyczne
Genotypowanie genu NOD2 pozwala zidentyfikować pacjentów z grupy wysokiego ryzyka, u których przewiduje się wczesny początek rozległej postaci choroby z powikłaniami. Pacjenci ci odnoszą korzyści z bardziej agresywnego leczenia od samego początku oraz ściślejszej obserwacji pod kątem powstawania zwężeń i przetok. Warianty genetyczne receptora IL23R pozwalają zidentyfikować pacjentów, którzy prawdopodobnie będą reagować na inhibitory IL-23 — leki takie jak ustekinumab, risankizumab i guselkumab są obecnie zatwierdzone do stosowania w leczeniu choroby Leśniowskiego-Crohna i wywołują spektakularną odpowiedź terapeutyczną w genetycznie podatnych podgrupach. Kompleksowa ocena genetyczna przeprowadzona za pomocą testu genomowego stanowi punkt odniesienia dla przyszłych zastosowań klinicznych: w miarę jak modele ryzyka poligenicznego dojrzewają i są weryfikowane klinicznie, pacjenci posiadający dane genetyczne w dokumentacji mogą skorzystać z nowych zaleceń terapeutycznych opartych na ich indywidualnym profilu genetycznym.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się chorobami zapalnymi jelit (chorobą Leśniowskiego-Crohna) oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
