Homocystynuria — w której genotyp CBS decyduje o tym, czy u pacjenta terapia witaminą B6 przynosi niemal normalne wyniki, czy też konieczne jest stosowanie przez całe życie diety o ograniczonej zawartości metioniny oraz suplementacji betainą.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala zidentyfikować konkretny wariant CBS — odróżniając homocystynurię reagującą na pirydoksynę (witaminę B6) od tej, która na nią nie reaguje — co stanowi najważniejszy czynnik pozwalający na rozróżnienie pod względem rokowań i leczenia w przypadku tej choroby.
Homocystynuria
Klasyczna homocystynuria jest autosomalną recesywną chorobą metabolizmu metioniny spowodowaną niedoborem cystationiny β-syntazy (CBS, chromosom 21q22.3). Enzym CBS katalizuje kondensację homocysteiny z seryną, w wyniku której powstaje cystationina — jest to pierwszy etap szlaku transsulfuracji. Niedobór CBS powoduje gromadzenie się homocysteiny i metioniny we krwi i tkankach. Homocystynuria dotyka około 1 na 200 000–300 000 urodzeń na całym świecie, przy czym częstość występowania jest wyższa w Irlandii (~1 na 65 000) i Katarze (~1 na 1800). Pirydoksyna (witamina B6) jest kofaktorem dla CBS, a około 50% pacjentów ma postacie reagujące na B6, które zachowują częściową aktywność CBS.
Nieleczona homocystynuria powoduje charakterystyczny zespół objawów klinicznych: ektopię soczewki (przemieszczenie soczewki – typowo w dół, co odróżnia ją od zespołu Marfana, w którym soczewki przemieszczają się w górę), cechy szkieletowe typowe dla zespołu Marfana (wysoki wzrost, długie kończyny, deformacja klatki piersiowej, skolioza), chorobę zakrzepowo-zatorową (główną przyczynę śmiertelności — podwyższony poziom homocysteiny sprzyja uszkodzeniom śródbłonka i aktywacji krzepnięcia) oraz niepełnosprawność intelektualną (o zmiennym nasileniu, od normalnej inteligencji po poważne upośledzenie). Ryzyko tromboembolii utrzymuje się przez całe życie: udar mózgu, zatorowość płucna i zakrzepica żył głębokich powodują znaczną zachorowalność i śmiertelność, szczególnie podczas operacji, ciąży lub unieruchomienia.
Leczenie zależy zasadniczo od wrażliwości na witaminę B6. Pacjenci reagujący na witaminę B6 (około 50%) są leczeni wysokimi dawkami pirydoksyny (100–500 mg/dobę), co zwiększa resztkową aktywność enzymu CBS i normalizuje lub niemal normalizuje poziom homocysteiny w osoczu — pacjenci ci osiągają znacznie lepsze wyniki, w tym zachowują sprawność umysłową, mają zmniejszone ryzyko zakrzepowo-zatorowe i często nie wymagają ograniczenia spożycia metioniny w diecie. Pacjenci niewrażliwi na witaminę B6 wymagają dożywotniej diety o ograniczonej zawartości metioniny, suplementacji betainą (która zapewnia alternatywną drogę remetylacji homocysteiny), kwasu foliowego i witaminy B12. Rozróżnienie między formami wrażliwymi i niewrażliwymi ma kluczowe znaczenie dla decyzji terapeutycznej i jest determinowane przez konkretny genotyp CBS.
W przypadku homocystynurii przemieszczenie soczewki następuje zazwyczaj w kierunku dolnym (do przodu i w dół), natomiast w zespole Marfana – w kierunku górnym (do tyłu i na bok). U każdego pacjenta z przemieszczeniem soczewki należy wykonać badanie stężenia homocysteiny w osoczu – to jedno badanie laboratoryjne pozwala odróżnić te dwa schorzenia.
Reakcja na witaminę B6 determinuje całe podejście terapeutyczne oraz długoterminowe rokowania. Genotyp CBS pozwala z dużą dokładnością przewidzieć reakcję na leczenie, co umożliwia natychmiastową optymalizację terapii zamiast wielomiesięcznych prób empirycznych.
Warianty CBS reagujące na witaminę B6 pozwalają przewidzieć wyniki zbliżone do normy — warianty niereagujące wskazują na konieczność stosowania restrykcji dietetycznych przez całe życie
Warianty CBS p.Ile278Thr i p.Ala114Val są związane z homocystynurią reagującą na witaminę B6 i zachowują znaczącą resztkową aktywność enzymatyczną. Pacjenci homozygotyczni lub heterozygotyczni złożeni pod względem tych wariantów zazwyczaj osiągają normalizację parametrów biochemicznych wyłącznie dzięki terapii pirydoksyną, uzyskując doskonałe długoterminowe wyniki w zakresie funkcji intelektualnych i stanu układu naczyniowego. Natomiast p.Gly307Ser (najczęstszy wariant irlandzki/europejski) nie reaguje na witaminę B6 i wymaga dożywotniej diety o ograniczonej zawartości metioniny oraz betainy. Genotypowanie molekularne pozwala na natychmiastową stratyfikację leczenia — zamiast 6-8-tygodniowej empirycznej próby z witaminą B6, która opóźnia ostateczne postępowanie.
W przypadku niezdiagnozowanej homocystynurii ryzyko związane z zabiegiem chirurgicznym i znieczuleniem jest znacznie podwyższone — diagnostyka molekularna pozwala zapobiec powikłaniom okołooperacyjnym
Podwyższony poziom homocysteiny znacznie zwiększa ryzyko wystąpienia zdarzeń zakrzepowo-zatorowych w okresie okołooperacyjnym. Pacjenci z nierozpoznaną homocystynurią poddawani zabiegom chirurgicznym – zwłaszcza zabiegom ortopedycznym, które wiążą się z unieruchomieniem – są narażeni na bardzo wysokie ryzyko wystąpienia udaru śródoperacyjnego lub pooperacyjnego, zatorowości płucnej lub zakrzepicy żył głębokich. W kilku opisach przypadków odnotowano zgony okołooperacyjne u pacjentów z wcześniej nierozpoznaną homocystynurią. Diagnostyka molekularna umożliwia zastosowanie odpowiedniej przedoperacyjnej terapii obniżającej poziom homocysteiny, okołooperacyjnej antykoagulacji oraz unikanie znieczulenia podtlenkiem azotu (który hamuje syntazę metioninową i gwałtownie pogarsza poziom homocysteiny).
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się homocystynurią oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
