Dziedziczny rozlany rak żołądka — utrata funkcji genu CDH1 wiąże się z ryzykiem zachorowania na raka żołądka sięgającym nawet 70% w ciągu całego życia; nowotwór rozwija się pod błoną śluzową żołądka i pozostaje niewidoczny w badaniu endoskopowym, dopóki nie stanie się niemożliwy do usunięcia chirurgicznie.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala zidentyfikować wszystkie warianty genu CDH1 — w tym rozległe delecje i mutacje mozaikowe — co umożliwia postawienie diagnozy uzasadniającej zalecenie profilaktycznej całkowitej gastrektomii, zanim nowotwór niewidoczny w badaniu endoskopowym osiągnie zaawansowane stadium.
Dziedziczny rozlany rak żołądka
Dziedziczny rozlany rak żołądka (HDGC) to autosomalny dominujący zespół predyspozycji nowotworowych spowodowany patogennymi wariantami genu CDH1 (E-kadheryna) zlokalizowanego na chromosomie 16q22.1. Gen CDH1 koduje białko odpowiedzialne za adhezję międzykomórkową, które ma kluczowe znaczenie dla integralności nabłonka; utrata jego funkcji prowadzi do słabo spójnego, naciekającego wzorca wzrostu, charakterystycznego dla rozlanego raka żołądka (raka z komórkami pierścieniowymi). HDGC został po raz pierwszy zdefiniowany w 1998 r. w dużej rodzinie Maorysów z Nowej Zelandii i pozostaje jednym z najbardziej śmiertelnych zespołów nowotworowych o podłożu dziedzicznym — ryzyko zachorowania na raka żołądka w ciągu całego życia u nosicieli patogenicznych wariantów genu CDH1 szacuje się na 40–70% u mężczyzn i 45–70% u kobiet. Mediana wieku wystąpienia choroby w przypadkach rodzinnych wynosi 38 lat, ale odnotowano przypadki u pacjentów w wieku 20 lat.
Wyzwaniem klinicznym związanym z HDGC jest to, że rozlany rak żołądka rozwija się w postaci pojedynczych komórek pierścieniowatych naciekających błonę podśluzową — jest to wzorzec wzrostu, który nie tworzy widocznej masy i nie może być wiarygodnie wykryty za pomocą standardowej endoskopii. Nadzór endoskopowy, nawet przy zastosowaniu systematycznych protokołów biopsyjnych, nie pozwala wykryć większości wczesnych zmian HDGC. Każda całkowita gastrektomia wykonywana profilaktycznie u nosicieli wariantów patogennych CDH1 ujawnia w badaniu patologicznym utajone ogniska komórek pierścieniowych — co oznacza, że nawet „normalnie” wyglądające żołądki u praktycznie wszystkich nosicieli skrywają mikroskopijnego raka. Ten pojedynczy fakt biologiczny stanowi podstawę zalecenia profilaktycznej całkowitej gastrektomii dla nosicieli CDH1 w wieku 18–40 lat, zamiast nadzoru.
Kobiety będące nosicielkami genu CDH1 są również narażone na znacznie podwyższone ryzyko zachorowania na raka zrazikowego piersi — szacowane na 42–56% w ciągu całego życia. Rak zrazikowy piersi, podobnie jak rozlany rak żołądka, rozwija się w postaci naciekającej, jednorzędowej struktury, której standardowa mammografia może nie wykryć, co sprawia, że rezonans magnetyczny piersi stanowi niezbędny element badań kontrolnych. Gen CDH1 znajduje się na liście wyników dodatkowych ACMG SF v3.2, co odzwierciedla konsensus, że identyfikacja nosicieli CDH1 przed rozwojem nowotworu jest zarówno klinicznie uzasadniona, jak i ratuje życie. Około 40% rodzin spełniających kliniczne kryteria HDGC jest CDH1-ujemnych; niektóre z tych rodzin mają warianty w genie CTNNA1 (alfa-E-katenina) lub innych genach, co wskazuje na konieczność zastosowania kompleksowego podejścia genomowego.
Standardowe panele genetyczne dotyczące nowotworów dziedzicznych nie wykrywają rozległych delecji genu CDH1 ani wariantów mozaikowych. W przypadku zespołu, w którym decyzja o zabiegu profilaktycznym zależy od potwierdzenia molekularnego, niekompletny wynik badania genetycznego ma bezpośrednie konsekwencje chirurgiczne.
Duże delecje genu CDH1 stanowią 10–15% przypadków raka żołądka wywołanego genetycznie (HDGC) i nie są wykrywane przez panele do sekwencjonowania eksonów
Około 10–15% patogennych wariantów genu CDH1 w rodzinach dotkniętych rakiem piersi u kobiet (HDGC) to rozległe delecje genomowe obejmujące jeden lub więcej eksonów. Panele do sekwencjonowania eksonów, które nie obejmują analizy delecji/duplikacji metodą MLPA ani wykrywania wariantów liczby kopii, nie wykryją tych wariantów. Ponadto w niektórych rodzinach odnotowano mozaikowość somatyczną — w której wariant CDH1 występuje tylko w części komórek pacjenta — która może zostać pominięta przy standardowej głębokości sekwencjonowania. Sekwencjonowanie całego genomu zapewnia jednoczesne wykrywanie mutacji punktowych i analizę wariantów liczby kopii w całym genie CDH1, umożliwiając wykrycie zarówno powszechnych wariantów wewnątrzgenowych, jak i rearanżacji strukturalnych w ramach jednego badania.
Gastrektomia profilaktyczna wymaga potwierdzenia molekularnego — ujemny wynik panelu nie oznacza, że wynik jest rzeczywiście ujemny
Całkowita gastrektomia to poważny zabieg chirurgiczny, który ma istotny wpływ na długoterminową jakość życia. Zaleca się ją u nosicieli genu CDH1, ponieważ rozlany rak żołądka we wczesnym stadium jest niewidoczny w badaniu endoskopowym, a obserwacja profilaktyczna nie zapobiegła zgonom w rodzinach, w których stwierdzono obecność nosicieli. Zalecenie to ma zastosowanie wyłącznie w przypadku potwierdzenia molekularnego obecności patogennej mutacji w genie CDH1. Niekompletny panel, który nie obejmował oceny dużych delecji ani kompleksowej analizy CDH1, daje fałszywe poczucie bezpieczeństwa rodzinie, w której wariant patogenny może nadal występować, ale po prostu nie został wykryty w wyniku ograniczonych badań. Sekwencjonowanie całego genomu eliminuje tę niejasność.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się dziedzicznym rozlanym rakiem żołądka oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
