Niedobór G6PD — najczęstsza enzymopatia u ludzi, dotykająca 500 milionów osób i powodująca ostre kryzysy hemolityczne wywołane przez powszechnie stosowane leki, w tym leki przeciwmalaryczne, antybiotyki i środki stosowane w chemioterapii.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala określić pełny genotyp G6PD — w tym klasę aktywności charakterystyczną dla danego wariantu, niezbędną do odróżnienia klasy I (ciężka, przewlekła hemoliza) od klas II–III (hemoliza wywołana czynnikami zewnętrznymi) oraz klasy IV (normalna aktywność) — co umożliwia bezpieczne przepisywanie leków utleniających.
Niedobór G6PD
Niedobór dehydrogenazy glukozo-6-fosforanowej (G6PD) jest najczęstszą enzymopatią u ludzi, dotykającą szacunkowo 400–500 milionów osób na całym świecie. Gen kodujący G6PD znajduje się na chromosomie X (Xq28), a enzym ten stanowi czynnik ograniczający szybkość szlaku pentozowo-fosforanowego, w ramach którego wytwarzany jest NADPH — niezbędny do regeneracji zredukowanego glutationu oraz ochrony czerwonych krwinek przed uszkodzeniami oksydacyjnymi. Czerwone krwinki z niedoborem G6PD są bardzo podatne na stres oksydacyjny, co prowadzi do ostrych epizodów hemolitycznych wywołanych przez leki utleniające, infekcje lub spożycie bobu (fawizm). Najpoważniejszym skutkiem w okresie noworodkowym jest hiperbilirubinemia noworodkowa.
Over 200 G6PD variants have been characterized, classified by WHO into functional activity classes: Class I (severely deficient, <10% activity, associated with chronic non-spherocytic hemolytic anemia); Class II (severely deficient, <10% activity, acute hemolysis on oxidant exposure); Class III (moderately deficient, 10-60% activity, hemolysis only with strong oxidant triggers); Class IV (normal activity, 60-150%); Class V (increased activity). The most common Class II variants are G6PD Mediterranean (c.563C>T, most common in Mediterranean, Middle Eastern, and Indian populations), G6PD A- (c.202G>A + c.376A>G, most common in African ancestry), and G6PD Canton (c.1376G>T, common in Southeast Asian populations). G6PD A- causes Class III disease; G6PD Mediterranean causes Class II disease with more severe hemolytic episodes.
Do klinicznie istotnych interakcji lekowych należą: primaquina i tafenoquina (profilaktyka malarii — według FDA wymagany jest status G6PD klasy B (normalny lub z łagodnym niedoborem)), rasburikaza (przeciwwskazana w przypadku niedoboru G6PD — powoduje ostrą, zagrażającą życiu hemolizę), dapson, nitrofurantoina, błękit metylenowy (ważny jako antidotum na methemoglobinemię — nie można go stosować w przypadku niedoboru G6PD) oraz kilka środków chemioterapeutycznych (adriamycyna, doksorubicyna w dużych dawkach). Istnieją wytyczne CPIC poziomu A dotyczące rasburikazy i G6PD. FDA wymaga wykonania badania G6PD przed przepisaniem tafenoquiny (KrintafelL) w leczeniu malarii.
G6PD jest genem sprzężonym z chromosomem X. Mężczyźni hemizygotyczni wykazują pełny fenotyp G6PD wynikający z obecności jednego allela. Kobiety heterozygotyczne posiadają dwa chromosomy X – jeden prawidłowy, a drugi z niedoborem G6PD – a nierównomierna inaktywacja chromosomu X powoduje u nich występowanie fenotypów o zróżnicowanym nasileniu, od prawidłowego do całkowitego niedoboru G6PD.
Testy aktywności enzymatycznej pozwalają zmierzyć aktywność G6PD, ale nie określają konkretnego wariantu ani klasy aktywności według klasyfikacji WHO. Do określenia klasy aktywności, przewidywania nasilenia hemolizy oraz sformułowania zaleceń dotyczących unikania niektórych leków niezbędne są dane na poziomie wariantów uzyskane w wyniku sekwencjonowania całego genomu.
Badania aktywności enzymów dają wyniki pozornie prawidłowe u kobiet oraz w trakcie epizodów hemolitycznych
Badania aktywności enzymu G6PD — standardowe testy G6PD wykonywane przy łóżku pacjenta — mają w praktyce klinicznej dwa główne ograniczenia. Po pierwsze, u kobiet heterozygotycznych, u których inaktywacja chromosomu X faworyzuje allel normalny, zmierzona aktywność enzymu jest w normie, mimo obecności allelu z niedoborem G6PD, który mógłby spowodować znaczną hemolizę, gdyby inaktywacja chromosomu X uległa zmianie w wyniku choroby lub przyjmowania leków. Po drugie, podczas ostrego epizodu hemolitycznego najsilniej niedoborowe pod względem G6PD czerwone krwinki są selektywnie niszczone — pozostała populacja czerwonych krwinek jest wzbogacona o młodsze, mniej niedoborowe komórki, a zmierzona aktywność enzymu może być fałszywie podwyższona (fałszywa norma). Genotypowanie molekularne oparte na sekwencjonowaniu całego genomu pozwala zidentyfikować konkretny wariant G6PD niezależnie od zmierzonej aktywności enzymu — zapewniając prawidłową klasyfikację nawet wtedy, gdy testy enzymatyczne dają mylące wyniki.
To konkretny wariant genu G6PD decyduje o tym, które leki są bezpieczne — nie wszystkie przypadki niedoboru G6PD są takie same
Wariant G6PD A- (klasa III, powszechny wśród osób pochodzenia afrykańskiego) powoduje umiarkowany niedobór enzymu, przy czym hemoliza występuje wyłącznie w wyniku działania silnych czynników utleniających, takich jak duże dawki primaquiny — większość osób dotkniętych tym schorzeniem toleruje dawki profilaktyczne przeciwmalaryczne przy starannym monitorowaniu. Wariant G6PD śródziemnomorski (klasa II) powoduje ciężki niedobór enzymu, przy czym hemoliza występuje już przy mniejszym stresie oksydacyjnym, w tym przy dawkach terapeutycznych leków, które byłyby tolerowane przez pacjentów z wariantem G6PD A-. Rasburikaza (stosowana w leczeniu zespołu rozpadu nowotworowego) jest absolutnie przeciwwskazana u wszystkich pacjentów z niedoborem G6PD ze względu na wytwarzanie nadtlenku wodoru. Te specyficzne dla wariantów różnice kliniczne wymagają genotypowania molekularnego — wynik aktywności enzymatycznej nie pozwala określić, który wariant G6PD występuje ani do której kategorii ryzyka należy pacjent.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się niedoborem G6PD oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
