Ataksja Friedreicha — najczęstsza dziedziczna postać ataksji, dla której po dziesięcioleciach leczenia objawowego pojawiła się pierwsza terapia zatwierdzona przez FDA; w tej chorobie rozmiar powtórzeń determinuje przebieg choroby, a długość powtórzeń stanowi podstawę decyzji terapeutycznych.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala precyzyjnie określić długość powtórzeń sekwencji GAA w obu allelach genu FXN — umożliwiając wykrycie przypadków heterozygotyczności złożonej (powtórzenie GAA + wariant punktowy), których standardowe testy oparte na metodzie PCR nigdy nie wykrywają, oraz dostarczając informacje o wyjściowej długości powtórzenia, które mają znaczenie dla rokowania.
Ataksja Friedreicha
Ataksja Friedreicha (FRDA) jest najczęstszą dziedziczną ataksją wśród osób pochodzenia europejskiego, dotykającą około 1 na 50 000 osób, przy częstotliwości występowania nosicielstwa wynoszącej około 1 na 100. Jest ona spowodowana autosomalną recesywną utratą funkcji frataxiny (kodowanej przez gen FXN na chromosomie 9q21.11), białka mitochondrialnego biorącego udział w tworzeniu klastrów żelazo-siarka. Niedobór frataxiny prowadzi do gromadzenia się żelaza w mitochondriach, stresu oksydacyjnego i postępującej neurodegeneracji. FRDA charakteryzuje się postępującym ataksją móżdżkową i czuciową, kardiomiopatią (występującą w >90% przypadków i będącą główną przyczyną zgonów), cukrzycą (rozwijającą się u około 10–20%) oraz deformacjami szkieletu (skolioza, stopa wydrążona).
Molekularna przyczyna FRDA ma nietypowy charakter: około 96–98% alleli patogennych to ekspansje powtórzeń trójnukleotydowych GAA w intronie 1 genu FXN. Allele normalne zawierają od 5 do 33 powtórzeń GAA; allele o pełnej ekspansji zawierają od 66 do ponad 1000 powtórzeń, przy czym allele premutacyjne w zakresie 34–65 powtórzeń wiążą się z ryzykiem stabilizacji, ale przy tej wielkości nie powodują choroby. Długość powtórzeń ma istotny wpływ na fenotyp kliniczny: większe powtórzenia w krótszym allelu wiążą się z wcześniejszym wystąpieniem choroby i cięższym przebiegiem kardiomiopatii. Około 2–4% przypadków FRDA to przypadki heterozygotyczne złożone — jeden allel z ekspansją GAA i jedna konwencjonalna mutacja punktowa (missense, nonsense, miejsce splicingu) w drugim allelu. Te przypadki heterozygotyczne złożone są całkowicie pomijane przez testy oparte na PCR, które wykrywają jedynie długość ekspansji GAA.
W lutym 2023 r. FDA zatwierdziła pierwszą terapię modyfikującą przebieg choroby w przypadku FRDA: omaveloksolon (Skyclarys), aktywator Nrf2, który poprawia funkcjonowanie mitochondriów i zmniejsza stres oksydacyjny. Zatwierdzenie to stanowi historyczny kamień milowy po dziesięcioleciach, w których leczenie miało charakter wyłącznie objawowy. Dzięki dostępności zatwierdzonego leczenia wczesna diagnoza i precyzyjna charakterystyka molekularna — w tym określenie rozmiaru ekspansji i wykrywanie heterozygotyczności złożonej — stają się bezpośrednio terapeutyczne w określaniu kwalifikacji do leczenia i monitorowaniu odpowiedzi na leczenie.
W 2–4% przypadków FRDA występuje heterozygotyczność złożona: jedno powielenie sekwencji GAA + jedna mutacja punktowa w drugim allelu. W takich przypadkach standardowe testy GAA-PCR uznają krótszy allel za „normalny”, co prowadzi do uzyskania wyniku fałszywie ujemnego i uniemożliwia rozpoznanie choroby u pacjentów.
Standardowe badanie ekspansji GAA metodą PCR wykrywa ekspansję homozygotyczną – co jest najczęstszym przypadkiem – ale nie wykrywa złożonej postaci heterozygotycznej FRDA (ekspansja + mutacja punktowa). Sekwencjonowanie całego genomu pozwala zidentyfikować oba mechanizmy jednocześnie.
Złożona heterozygotyczna postać FRDA pozostaje niewykrywalna w standardowym teście PCR, co powoduje, że u 2–4% pacjentów choroba pozostaje nierozpoznana
Badanie powtórzeń GAA metodą PCR — standardowe badanie diagnostyczne pierwszej linii w przypadku FRDA — mierzy długość powtórzeń GAA w obu allelach. U pacjentów z heterozygotycznością złożoną (jeden allel z powtórzeniem + jeden allel z mutacją punktową) standardowy test PCR wykrywa powtórzenie w jednym allelu, ale dla drugiego allelu wskazuje prawidłową liczbę powtórzeń. Powoduje to wynik, który wydaje się wskazywać na heterozygotyczną ekspansję GAA — często interpretowaną jako „nosicielstwo” zamiast „choroba” — i prowadzi do błędnej lub opóźnionej diagnozy. Sekwencjonowanie genu FXN musi zostać przeprowadzone we wszystkich przypadkach wyników wskazujących na „heterozygotyczną ekspansję”, aby wykluczyć heterozygotyczność złożoną. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala na wykonanie zarówno pomiaru ekspansji powtórzeń, jak i pełnego sekwencjonowania genu FXN w ramach jednej analizy.
Dokładne określenie stopnia rozszerzenia GAA pozwala ustalić rokowanie i stanowi podstawę do podejmowania decyzji dotyczących leczenia omaveloksolonem
Długość powtórzeń sekwencji GAA w krótszej ekspansji (allele 1) jest najsilniejszym czynnikiem prognostycznym wieku wystąpienia objawów w FRDA — każde dodatkowe 100 powtórzeń GAA wiąże się z przyspieszeniem wystąpienia objawów o około jeden rok. Pacjenci z krótszymi allelami w zakresie 66–400 powtórzeń mają zazwyczaj późniejszy początek choroby (w wieku nastoletnim lub dorosłym) i wolniejszy postęp objawów neurologicznych, ale nadal mogą cierpieć na znaczącą kardiomiopatię. Pacjenci z ekspansjami allelu 1 powyżej 700 powtórzeń mają zazwyczaj wcześniejszy początek choroby i cięższy przebieg. Informacje o wielkości ekspansji pomagają w doradztwie prognostycznym, ustalaniu intensywności monitorowania kardiologicznego oraz — po zatwierdzeniu omaveloksolonu — w dyskusji na temat korzyści i ryzyka rozpoczęcia terapii na różnych etapach choroby.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się ataksją Friedreicha oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
