Czerniak rodzinny — utrata funkcji genu CDKN2A wiąże się z 60–90-procentowym ryzykiem zachorowania na czerniaka w ciągu całego życia oraz podwyższonym ryzykiem raka trzustki; schorzenie to często traktuje się jako skupisko przypadków nowotworów w rodzinie, zamiast uznawać je za zespół dziedziczny.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala odczytać cały gen CDKN2A — który koduje dwa odrębne geny supresorowe nowotworów (p16/INK4a i p14/ARF) poprzez alternatywne ramki odczytu — identyfikując wszystkie warianty, w tym rearanżacje, które umykają standardowemu sekwencjonowaniu panelowemu.
Czerniak rodzinny — CDKN2A
Rodzinny zespół atypowych znamion wielokrotnych i czerniaka (FAMMM) to autosomalny dominujący zespół predyspozycji do nowotworów, spowodowany najczęściej patogennymi wariantami genetycznymi w genie CDKN2A na chromosomie 9p21.3. Gen CDKN2A koduje dwa odrębne białka supresorowe nowotworów poprzez alternatywne ramki odczytu: p16/INK4a (kodowane przez eksony 1α, 2 i 3), które hamują CDK4/6 i zapobiegają progresji cyklu komórkowego, oraz p14/ARF (kodowane przez eksony 1β, 2 i 3), które stabilizują p53. Warianty patogeniczne w genie CDKN2A odpowiadają za około 20–40% rodzin z co najmniej 3 przypadkami czerniaka i występują u znacznej części osób z wieloma pierwotnymi czerniakami. Warianty patogeniczne CDK4 powodują niemal identyczny zespół kliniczny w niewielkiej mniejszości przypadków czerniaka rodzinnego.
Ryzyko zachorowania na czerniaka w ciągu całego życia u nosicieli patogennych wariantów genu CDKN2A waha się od około 28–67% w regionach o niskiej częstości występowania do 58–92% w regionach o wysokim nasileniu promieniowania UV (zwłaszcza w Australii). Mediana wieku przy pierwszym rozpoznaniu czerniaka u nosicieli genu CDKN2A jest znacznie niższa niż w populacji ogólnej, przy czym w ciągu całego życia nosicieli obserwuje się wysoki odsetek przypadków czerniaków pierwotnych wieloogniskowych. Nosiciele CDKN2A są również narażeni na znacznie podwyższone ryzyko raka trzustki — szacowane na 11–17% w ciągu całego życia — szczególnie w przypadku występowania raka trzustki w rodzinie. Nosiciele z wariantami specyficznymi dla p14/ARF (dotyczącymi wyłącznie eksonu 1β) mogą wykazywać izolowaną predyspozycję do raka trzustki bez ryzyka czerniaka.
Pomimo ogromnego ryzyka zachorowania na czerniaka w ciągu całego życia, czerniak rodzinny jest w znacznym stopniu niediagnozowany. W placówkach podstawowej opieki zdrowotnej i gabinetach dermatologicznych często spotyka się pacjentów, którzy mają wielu krewnych pierwszego stopnia z czerniakiem, a którym udziela się porad dotyczących „pecha rodzinnego” lub po prostu ogólnych wskazówek dotyczących ochrony przed słońcem, bez skierowania na badania genetyczne. Wytyczne NCCN dotyczące czerniaka zalecają ocenę genetyczną u osób, w których rodzinie występowały trzy lub więcej przypadków czerniaka inwazyjnego, u osób z wieloma pierwotnymi czerniakami lub w rodzinach, w których występował co najmniej jeden przypadek czerniaka oraz jeden przypadek raka trzustki. Osoby, u których potwierdzono obecność genu CDKN2A, wymagają corocznego badania skóry całego ciała, półrocznej dermatoskopii oraz monitorowania trzustki — jest to ustrukturyzowany protokół, którego wdrożenie wymaga potwierdzenia molekularnego.
Gen CDKN2A koduje dwa białka poprzez alternatywne ramki odczytu. Warianty eksonu 1β wpływają wyłącznie na białko p14/ARF, powodując predyspozycję do raka trzustki bez zwiększonego ryzyka czerniaka. Warianty eksonu 1α oraz eksonów 2–3 wpływają na białko p16/INK4a i zazwyczaj powodują zarówno zwiększone ryzyko czerniaka, jak i raka trzustki.
Standardowe panele do badania czerniaka wykorzystują ograniczone metody sekwencjonowania genu CDKN2A, które nie wykrywają rozległych rearanżacji ani wariantów z alternatywnymi ramkami odczytu. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala określić pełną strukturę genu CDKN2A, obejmującą zarówno ramki odczytu p16/INK4a, jak i p14/ARF.
Dwa białka, dwa ramki odczytu — standardowe sekwencjonowanie eksonów może nie pozwolić na prawidłową ocenę obu z nich
Gen CDKN2A wyróżnia się tym, że koduje dwa białka supresorowe nowotworów z jednego locus genomowego poprzez alternatywne pierwsze eksony: ekson 1α (dla p16/INK4a) i ekson 1β (dla p14/ARF). Standardowe panele do badań nad nowotworami dziedzicznymi zazwyczaj obejmują sekwencjonowanie eksonów kodujących CDKN2A w ramce odczytu p16/INK4a. Warianty, które wpływają konkretnie na ramkę odczytu p14/ARF — szczególnie w eksonie 1β — mogą zostać pominięte, jeśli projekt panelu nie obejmuje wyraźnie tego alternatywnego pierwszego eksonu. Takie warianty powodują predyspozycję do raka trzustki, która może zostać pominięta w projekcie panelu skupionym na czerniaku. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje kompletny locus CDKN2A 9p21, w tym zarówno alternatywne pierwsze eksony, jak i cały region regulacyjny.
Ryzyko zachorowania na raka trzustki w rodzinach z mutacją genu CDKN2A wymaga specjalistycznej obserwacji, której nie obejmuje standardowa opieka nad pacjentami z czerniakiem
Osoby będące nosicielami genu CDKN2A, zidentyfikowane w rodzinach, w których występował czerniak, mogą nie otrzymać informacji na temat współistniejącego ryzyka zachorowania na raka trzustki wynoszącego 11–17%, jeśli nie ma wyraźnej świadomości tego podwójnego fenotypu. Obecne wytyczne dla nosicieli CDKN2A z historią rodzinną wskazującą na ryzyko raka trzustki zalecają coroczną kontrolę trzustki, rozpoczynającą się w wieku 40–45 lat, za pomocą ultrasonografii endoskopowej lub MRI/MRCP — taką samą kontrolę zaleca się nosicielom genów BRCA2 i ATM obciążonym ryzykiem raka trzustki. Ten protokół kontroli trzustki jest uruchamiany tylko wtedy, gdy ustalono diagnozę CDKN2A, a zespół kliniczny jest świadomy podwójnego ryzyka nowotworowego. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala zidentyfikować warianty patogeniczne CDKN2A w kontekście kompleksowej oceny ryzyka nowotworowego.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się czerniakiem rodzinnym (CDKN2A) oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
