Rodzinna polipowatość gruczolakowata — od setek do tysięcy polipów jelita grubego spowodowanych utratą funkcji genu APC, prowadząca niemal na pewno do przekształcenia nowotworowego w przypadku braku interwencji chirurgicznej.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala odczytać pełną sekwencję genu APC — w tym głębokie regiony intronowe, duże delecje oraz warianty mozaikowe, których standardowe panele do wykrywania nowotworów dziedzicznych systematycznie nie wykrywają.
Rodzinna polipowatość gruczolakowata
Rodzinna polipowatość gruczolakowata (FAP) to autosomalny dominujący zespół nowotworowy jelita grubego spowodowany patogennymi wariantami genu supresorowego nowotworów APC (adenomatous polyposis coli) zlokalizowanego na chromosomie 5q22.2. Klasyczna postać FAP charakteryzuje się rozwojem od setek do tysięcy polipów gruczolakowatych w całym jelicie grubym, pojawiających się zazwyczaj w drugiej dekadzie życia. Bez interwencji chirurgicznej rak jelita grubego jest praktycznie nieunikniony przed piątą dekadą życia — ryzyko zachorowania na raka jelita grubego w ciągu całego życia sięga 100% w przypadku nieleczonego klasycznego FAP. FAP stanowi około 0,5–1% wszystkich nowotworów jelita grubego i szacuje się, że dotyka 1 na 5000 do 1 na 10 000 osób.
Łagodna postać FAP (AFAP) to łagodniejsza odmiana fenotypowa spowodowana mutacjami w określonych regionach genu APC (koniec 5', ekson 9 lub koniec 3') i charakteryzuje się mniejszą liczbą polipów (10–100), późniejszym wystąpieniem polipowatości, niższym, ale wciąż znacznie podwyższonym ryzykiem raka jelita grubego oraz bardziej zróżnicowanym przebiegiem. Korelacje genotypowo-fenotypowe w FAP są dobrze znane: warianty w kodonach 1250–1464 (szczególnie w kodonie 1309) są związane z gęstą polipozą i wcześniejszym rakiem jelita grubego; warianty w kodonach 1310–1330 i 1445–1580 są związane z wyższym ryzykiem guzów desmoidalnych; a warianty na końcu 5' są związane z AFAP. Objawy pozakolonowe — w tym gruczolaki dwunastnicy (100% ryzyko w ciągu całego życia), rak tarczycy, hepatoblastoma (u dzieci), guzy desmoidalne, wrodzony przerost barwnikowego nabłonka siatkówki (CHRPE) oraz osteomy — różnią się w zależności od lokalizacji wariantu genu APC.
Około 20–30% przypadków klasycznego FAP wynika z de novo wariantów genu APC bez rodzinnej historii polipowatości. Dodatkowe 7–10% pacjentów spełniających kryteria kliniczne FAP nie wykazuje wykrywalnych wariantów genu APC w standardowym sekwencjonowaniu — grupa ta może charakteryzować się głębokimi intronowymi wariantami splicingu, dużymi rearanżacjami genomowymi (delecjami, duplikacjami) lub mozaikowością somatyczną, których standardowe badania panelowe genów nie są w stanie wykryć. Polipowatość związana z genem MUTYH (MAP), spowodowana biallelicznymi wariantami genu MUTYH, może dawać fenotyp nie do odróżnienia od atenuowanej postaci FAP i wymaga równoczesnego genotypowania genu MUTYH u pacjentów z polipowatością bez mutacji w genie APC.
Klasyczna polipowatość FAP, polipowatość FAP o łagodniejszym przebiegu (AFAP) oraz polipowatość związana z genem MUTYH (MAP) charakteryzują się pokrywającymi się obrazami klinicznymi, choć mają różne przyczyny genetyczne i implikacje chirurgiczne. Lokalizacja wariantu genu APC decyduje o ryzyku wystąpienia objawów poza okrężnicą.
Standardowe panele do wykrywania nowotworów dziedzicznych obejmują eksony kodujące genu APC. Nie uwzględniają one głębokich wariantów intronowych, rozległych rearanżacji oraz mutacji mozaikowych — czyli wariantów, które wyjaśniają negatywne wyniki paneli w rodzinach dotkniętych chorobą.
Aż u 30% pacjentów z klinicznie rozpoznanym FAP wyniki badań standardowych paneli są ujemne pod względem APC
Standardowe panele do badań nad nowotworami dziedzicznymi obejmują sekwencjonowanie regionu kodującego genu APC oraz miejsc splicingu. Nie wykrywają one jednak w sposób wiarygodny dużych delecji lub duplikacji genomowych obejmujących wiele eksonów, głębokich wariantów intronowych powodujących powstawanie nieprawidłowych miejsc splicingu ani mozaikowości somatycznej — w której wariant genu APC występuje jedynie w niewielkiej części komórek. Badania wykazały, że 7–10% pacjentów z klasycznym FAP bez zidentyfikowanego wariantu kodującego APC nosi głębokie warianty intronowe lub warianty rearanżacji strukturalnej wykrywalne wyłącznie poprzez kompleksową analizę genomową. Dodatkowa podgrupa nosi somatyczne mozaikowe mutacje APC, gdzie frakcje alleli wariantowych wynoszące 10–20% mogą zostać pominięte przy standardowej głębokości sekwencjonowania panelowego. Sekwencjonowanie całego genomu przy pokryciu 30X wraz z analizą wariantów liczby kopii rozwiązuje wszystkie te problemy.
Lokalizacja wariantu APC determinuje strategię chirurgiczną i intensywność monitorowania
Postępowanie chirurgiczne w przypadku nowotworów jelita grubego u pacjentów z FAP nie jest uniwersalne. Pacjenci z wariantami genetycznymi w kodonach 1250–1464 i gęstą polipozą zazwyczaj wymagają resekcji odtworzeniowej odbytnicy i jelita grubego z zespoleniem woreczka jelita krętego z odbytem. Pacjenci z AFAP lub rzadką polipozą mogą być leczeni za pomocą segmentowej resekcji jelita grubego z zespoleniem jelita krętego z odbytem oraz nadzorem endoskopowym. Stratyfikacja ryzyka wystąpienia guza desmoidalnego — kluczowa dla planowania leczenia chirurgicznego u pacjentów z ryzykiem wystąpienia guza desmoidalnego w obrębie jamy brzusznej — zależy od lokalizacji wariantu genu APC w kodonach 1310–1580. Żadna z tych stratyfikacji genotypowo-fenotypowych nie jest możliwa bez pełnego genotypu APC, co wymaga sekwencjonowania całego genu, w tym regionów regulacyjnych i intronowych.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się rodzinnym polipowatością gruczolakowatą oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
