Dystrofia mięśniowa Duchenne’a — najczęstsza postać ciężkiej dystrofii mięśniowej występującej w dzieciństwie, w której konkretny wariant DMD decyduje o tym, do której z pojawiających się terapii opartych na pomijaniu eksonów dziecko kwalifikuje się.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala na odczytanie całego genu DMD — największego genu w ludzkim genomie, liczącego 2,4 miliona par zasad — i wykrycie wszystkich punktów przerwania delecji, duplikacji oraz głębokich wariantów intronowych, które mają decydujące znaczenie zarówno dla postawienia diagnozy, jak i kwalifikacji do leczenia.
Dystrofia mięśniowa Duchenne'a
Dystrofia mięśniowa Duchenne’a (DMD) to recesywna choroba nerwowo-mięśniowa dziedziczona wiązana z chromosomem X, spowodowana patogennymi wariantami genu DMD zlokalizowanego na chromosomie Xp21.2, który koduje dystrofinę – białko strukturalne niezbędne do zachowania integralności błony włókien mięśniowych. Niedobór dystrofiny prowadzi do postępującej degeneracji włókien mięśniowych, przewlekłego stanu zapalnego oraz zastąpienia tkanki mięśniowej tkanką włóknistą i tłuszczową. DMD jest najczęstszą ciężką postacią dystrofii mięśniowej u dzieci, dotykającą około 1 na 3500–5000 urodzonych chłopców na całym świecie. Objawy pojawiają się zazwyczaj w wieku 2–5 lat i obejmują osłabienie mięśni proksymalnych, objawiające się trudnościami w bieganiu, wchodzeniu po schodach i wstawaniu z podłogi (objaw Gowersa). Bez leczenia utrata zdolności chodzenia następuje w wieku 12–13 lat, a zgon z powodu niewydolności oddechowej lub sercowej występuje zazwyczaj w późnym okresie nastoletnim lub w wieku około dwudziestu pięciu lat.
Około 60–70% wariantów powodujących DMD to duże delecje obejmujące jeden lub więcej eksonów, skupione w dwóch regionach o wysokiej częstości występowania (eksony 2–20 oraz eksony 44–55). Duże duplikacje stanowią 5–15% wariantów, a pozostałe 20–30% to mutacje punktowe (nonsensowne, powodujące przesunięcie ramki odczytu oraz w miejscach splicingu). Zasada ramki odczytu odróżnia DMD od łagodniejszej postaci tej choroby, jaką jest dystrofia mięśniowa Beckera (BMD): warianty poza ramką, które eliminują produkcję funkcjonalnej dystrofiny, powodują DMD, podczas gdy warianty w ramce, które produkują skróconą, ale częściowo funkcjonalną dystrofinę, powodują BMD. Ta korelacja genotyp-fenotyp pomaga w prognozowaniu i coraz częściej kieruje wyborem leczenia.
Sytuacja w zakresie leczenia DMD uległa radykalnej zmianie dzięki precyzyjnym terapiom dostosowanym do konkretnego genotypu. Oligonukleotydy antysensowne pomijające eksony — eteplirsen (ekson 51, ~13% pacjentów z DMD), golodirsen/viltolarsen (ekson 53, ~8%) oraz casimersen (ekson 45, ~8%) — przywracają ramkę odczytu, umożliwiając produkcję skróconej, ale funkcjonalnej dystrofiny, co przekształca fenotyp DMD w BMD. Ataluren jest skierowany przeciwko wariantom nonsensownym (przedwczesny kodon stop), które stanowią około 10–15% przypadków. Terapia zastępcza genów (delandistrogene moxeparvovec, zatwierdzona w 2023 r.) wykorzystuje mikrodystrofinę dostarczaną za pośrednictwem wektora AAV. Każda z tych terapii wymaga ostatecznej charakterystyki wariantu DMD w celu określenia kwalifikowalności — co sprawia, że diagnoza genetyczna ma nie tylko charakter diagnostyczny, ale także bezpośrednio terapeutyczny.
Zasada ramki odczytu decyduje o tym, czy dany wariant genu DMD powoduje dystrofię mięśniową typu Duchenne’a (ciężką, z przesunięciem ramki odczytu) czy typu Beckera (łagodniejszą, bez przesunięcia ramki odczytu). Dokładna charakterystyka punktu pęknięcia pozwala określić kwalifikację do terapii pomijania eksonów — decyzja ta zależy od wiedzy na temat tego, które eksony uległy zmianie.
Standardowe badania pod kątem delecji i duplikacji pozwalają zidentyfikować zaangażowane eksony, ale nie wskazują dokładnych punktów przerwania w intronach. Warianty występujące głęboko w intronach, powodujące nieprawidłowe splicowanie, pozostają niewidoczne dla paneli skupiających się na eksonach. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz struktury wariantów.
Dokładne określenie punktów przerwania delecji decyduje o tym, czy można zastosować pominięcie eksonu — samo badanie na poziomie eksonów nie jest wystarczające
MLPA (multiplex ligation-dependent probe amplification) — standardowe badanie diagnostyczne pierwszego stopnia w przypadku DMD — pozwala zidentyfikować, które eksony uległy delecji lub duplikacji, ale nie pozwala określić lokalizacji punktów przełamania w intronach z dokładnością do pary zasad. W przypadku kwalifikacji do terapii pomijania eksonów to właśnie dokładna lokalizacja punktu przełamania decyduje o tym, czy terapeutyczne pominięcie eksonu może przywrócić ramkę odczytu. Ponadto złożone rearanżacje — inwersje, nieprzylegające delecje oraz delecje z insercjami — nie są wiarygodnie wykrywane przez MLPA. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala na mapowanie punktów przełamania delecji na poziomie nukleotydów we wszystkich 79 eksonach DMD oraz w pośrednich 2,2 milionach par zasad sekwencji intronowej.
20–30% wariantów DMD to mutacje punktowe, których wykrycie wymaga sekwencjonowania całego genu
U jednej trzeciej pacjentów z DMD występują mutacje punktowe — warianty nonsensowne, powodujące przesunięcie ramki odczytu lub dotyczące miejsc splicingu — a nie rozległe delecje czy duplikacje. Metoda MLPA nie wykrywa mutacji punktowych; u tych pacjentów konieczne jest przeprowadzenie pełnego sekwencjonowania genu DMD jako drugiego etapu diagnostyki. Spośród pacjentów z mutacjami punktowymi osoby z wariantami zawierającymi przedwczesny kodon stopu (warianty nonsensowne) mogą kwalifikować się do terapii preparatem ataluren. Głębokie warianty intronowe, które tworzą kryptyczne miejsca splicingu, stanowią dodatkową kategorię wykrywalną wyłącznie poprzez sekwencjonowanie wykraczające poza eksony kodujące. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala wykryć delecje, duplikacje, mutacje punktowe i głębokie warianty intronowe w ramach jednego badania — eliminując konieczność przeprowadzania kolejnych badań diagnostycznych.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się dystrofią mięśniową Duchenne’a oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
