Zespół Draveta — utrata funkcji genu SCN1A powodująca ciężką padaczkę o wczesnym początku, w której najczęściej przepisywane leki przeciwpadaczkowe pogarszają stan pacjenta.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala odczytać pełną sekwencję genu SCN1A, wykrywając warianty mozaikowe i głębokie warianty intronowe odpowiedzialne za zespół Draveta u pacjentów, u których nie ustalono przyczyny genetycznej choroby — a także pozwala zidentyfikować przeciwwskazania farmakogenomiczne, które decydują o tym, które leki można bezpiecznie stosować, a których nie.
Zespół Draveta
Zespół Draveta (DS) — dawniej określany jako ciężka padaczka miokloniczna niemowląt (SMEI) — to ciężka encefalopatia rozwojowo-padaczkowa, której objawy pojawiają się w pierwszym roku życia, zazwyczaj u wcześniej zdrowego niemowlęcia. Schorzenie charakteryzuje się przedłużającymi się napadami z gorączką i bez gorączki (często klonicznymi lub hemiklonicznymi), następującymi po nich polimorficznymi typami napadów (mioklonicznymi, nieświadomości, ogniskowymi) oraz postępującym spowolnieniem rozwoju rozpoczynającym się w drugim roku życia. Częstość występowania zespołu Draveta w populacji wynosi około 1 na 15 000–22 000 urodzeń i stanowi około 3–8% przypadków padaczki, której początek przypada na pierwsze trzy lata życia.
Warianty genetyczne SCN1A o charakterze patogennym lub prawdopodobnie patogennym wykrywa się u około 70–85% pacjentów spełniających kliniczne kryteria diagnostyczne zespołu Draveta. Gen SCN1A koduje podjednostkę alfa Nav1.1 kanałów sodowych zależnych od napięcia, która ma kluczowe znaczenie dla funkcjonowania neuronów hamujących. Utrata funkcji tego genu zaburza aktywność neuronów GABA-ergicznych, powodując odhamowanie kory mózgowej i nadpobudliwość. Około 95% patogennych wariantów SCN1A w zespole Draveta to warianty de novo (nieodziedziczone po rodzicach). Rodzaje wariantów patogennych obejmują warianty skracające (nonsense, przesunięcie ramki odczytu — około 40%), warianty w miejscach splicingu oraz warianty missense (około 40%); duże delecje lub duplikacje stanowią około 2–3% i wymagają analizy wariantów liczby kopii w celu wykrycia.
Genotyp SCN1A ma bezpośrednie, kluczowe dla życia konsekwencje farmakogenomiczne. Leki przeciwpadaczkowe blokujące kanały sodowe — w tym lamotrygina, karbamazepina, okskarbazepina, fenytoina i wigabatrina — pogarszają kontrolę napadów i mogą wywołać encefalopatię padaczkową u pacjentów z genotypem SCN1A poprzez dalsze osłabienie funkcji Nav1.1 w interneuronach hamujących. To przeciwwskazanie ma zastosowanie niezależnie od konkretnego typu wariantu. Leczenie o potwierdzonej skuteczności w zespole Draveta obejmuje walproinian, klobazam, topiramat, stiripentol oraz (u kwalifikujących się pacjentów) fenfluraminę i kanabidiol (Epidiolex). Nierozstrzygnięta lub błędnie przypisana diagnoza oznacza, że w krytycznym okresie, kiedy wybór leku ma największy wpływ na długoterminowe wyniki rozwojowe, mogą zostać przepisane niewłaściwe leki.
Około 15–30% pacjentów, u których klinicznie rozpoznano zespół Draveta, uzyskuje wynik negatywny pod względem genu SCN1A w standardowych badaniach panelowych. Część z nich jest nosicielami głębokich intronowych, mozaikowych lub strukturalnych wariantów genu SCN1A, które można wykryć za pomocą sekwencjonowania całego genomu.
Standardowe panele do badań nad padaczką wykrywają warianty genetyczne SCN1A powodujące zmiany w kodującej sekwencji. Nie wykrywają one jednak mutacji mozaikowych, głębokich wariantów splicingu intronowego oraz rozległych rearanżacji strukturalnych, które stanowią klinicznie istotną część przypadków zespołu Draveta bez mutacji w genie SCN1A.
Warianty genu SCN1A wymagają takiego zakresu i głębokości sekwencjonowania, jakiego panele nie są w stanie zapewnić
Mozaikowość somatyczna — w której patogenny wariant genu SCN1A występuje jedynie w podgrupie komórek — wyjaśnia część klinicznych przypadków zespołu Draveta, w których wyniki panelowego badania genetycznego są ujemne. Warianty mozaikowe o częstotliwości alleli wynoszącej 10–30% mogą zostać pominięte w standardowym sekwencjonowaniu panelowym, którego czułość kliniczna jest zoptymalizowana pod kątem heterozygotycznych wariantów linii germinalnej o frakcji alleli wynoszącej około 50%. Badania z wykorzystaniem głębokiego sekwencjonowania całego genomu pozwoliły zidentyfikować mozaikowe warianty SCN1A u 4–8% pacjentów z zespołem Draveta, u których wyniki panelu były ujemne. Głębokie intronowe warianty SCN1A, które tworzą ukryte miejsca splicingu, stanowią dodatkową kategorię wariantów patogennych niewidocznych w panelu. Oba wymagają szerokiego i głębokiego sekwencjonowania całego genomu w celu wiarygodnego wykrycia.
Wynik badania SCN1A decyduje o tym, które leki przeciwpadaczkowe można bezpiecznie przepisać
W przypadku zespołu Draveta wybór klasy leków nie jest kwestią optymalizacji — jest to kwestia bezpieczeństwa. Blokery kanałów sodowych są przeciwwskazane w przypadku utraty funkcji genu SCN1A, a udokumentowano, że wywołują one nasilenie napadów, stan padaczkowy, a w niektórych przypadkach ostre pogorszenie stanu encefalopatycznego. W wielu seriach przypadków odnotowano pacjentów z zespołem Draveta, u których nastąpiło znaczne pogorszenie stanu po rozpoczęciu stosowania lamotryginy lub karbamazepiny przed ustaleniem diagnozy genetycznej. Potwierdzenie obecności wariantu patogennego genu SCN1A stanowi praktyczną podstawę genetyczną do unikania blokerów kanałów sodowych i rozpoczęcia terapii opartych na dowodach naukowych, specyficznych dla zespołu Draveta — decyzja ta ma bezpośredni wpływ na nasilenie napadów i przebieg rozwoju.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się zespołem Draveta oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
