Zespół Cowdena — utrata funkcji genu PTEN powodująca jedno z najwyższych w skali całego życia ryzyk zachorowania na raka piersi spośród wszystkich zespołów dziedzicznych, a także podwyższone ryzyko raka endometrium, tarczycy, jelita grubego i nerki.
Gen PTEN znajduje się na liście ACMG SF v3.2 obejmującej geny, w przypadku których konieczne jest zgłaszanie wyników dodatkowych w ramach klinicznego sekwencjonowania genomu. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala scharakteryzować cały locus PTEN — w tym warianty regionu promotora oraz rozległe delecje, które rutynowo pomijane są w standardowych panelach nowotworowych.
Zespół Cowdena — zespół nowotworów hamartomatycznych PTEN
Zespół Cowdena (CS) — najczęstszy spośród zespołów nowotworowych związanych z hamartomami PTEN (PHTS) — jest autosomalnym dominującym zespołem predyspozycji do nowotworów, spowodowanym patogennymi wariantami genetycznymi w genie PTEN (homolog fosfatazy i tensyny) na chromosomie 10q23.31. PTEN jest genem supresorowym nowotworów, który reguluje szlak sygnałowy PI3K/AKT/mTOR; utrata funkcji PTEN prowadzi do niekontrolowanej proliferacji komórek i powstawania nowotworów. Zespół Cowdena charakteryzuje się zmianami śluzówkowo-skórnymi (trichilemmomy, grudki brodawkowate i rogowacenie akralne), makrocefalią, łagodnymi hamartomami w wielu narządach oraz znacznie podwyższonym ryzykiem wystąpienia wielu nowotworów złośliwych. Szacowana częstość występowania wynosi 1 na 200 000, choć diagnozy molekularne wskazują na znacznie wyższą częstotliwość.
Ryzyko zachorowania na nowotwór w ciągu całego życia u nosicieli patogenicznych wariantów genu PTEN należy do najwyższych odnotowanych w przypadku jakiegokolwiek genu odpowiedzialnego za nowotwory dziedziczne: ryzyko raka piersi sięga 67–85% (w porównaniu z ~12% średniej populacyjnej); ryzyko raka endometrium wynosi 28–44%; ryzyko raka tarczycy (głównie pęcherzykowego) sięga 21–38%; ryzyko raka jelita grubego jest podwyższone (9–18%); a ryzyko raka nerkowokomórkowego wynosi około 34%. Mężczyźni będący nosicielami mają podwyższone ryzyko raka piersi, a także są narażeni na zwiększone ryzyko raka tarczycy i jelita grubego. Zespół Bannayana-Rileya-Ruvalcaby (BRR) i zespół Proteusa (PS) to zaburzenia związane z allelami PTEN o nakładających się, ale odrębnych cechach klinicznych, wszystkie spowodowane wariantami patogennymi genu PTEN.
Około 25% osób spełniających kliniczne kryteria diagnostyczne zespołu Cowdena nie wykazuje możliwych do zidentyfikowania wariantów sekwencji kodującej gen PTEN — w tej grupie mogą występować warianty regionu promotora genu PTEN, głębokie warianty intronowe, rozległe rearanżacje genomowe lub warianty patogeniczne w innych genach związanych z zespołem Cowdena (SDHB, SDHD, KLLN). Wytyczne NCCN zalecają kompleksową analizę PTEN, w tym badanie pod kątem delecji/duplikacji, jako część pełnej oceny PHTS. Postępowanie u potwierdzonych nosicieli PTEN obejmuje coroczne badania MRI piersi od 30. roku życia, coroczne mammografie od 30. do 35. roku życia, rozważenie mastektomii zmniejszającej ryzyko, coroczne pobieranie próbek endometrium od 30. do 35. roku życia oraz coroczne badanie ultrasonograficzne tarczycy.
Zespoły nowotworowe związane z hamartomami PTEN obejmują zespół Cowdena, zespół Bannayana-Rileya-Ruvalcaby, zespół Proteusa oraz zespół podobny do Proteusa — są to schorzenia allele o nakładających się, ale klinicznie rozróżnialnych objawach, spowodowane przez patogeniczne warianty genu PTEN.
Warianty promotora genu PTEN oraz rozległe rearanżacje genomowe stanowią nawet 25% przypadków zespołu PHTS — są to warianty, które standardowe panele do wykrywania nowotworów dziedzicznych, obejmujące sekwencjonowanie wyłącznie eksonów kodujących genu PTEN, systematycznie pomijają.
Warianty regionu promotora genu PTEN są pomijane w większości zestawów testów onkologicznych
U pacjentów z zespołem Cowdena, u których wyniki standardowych paneli sekwencjonowania eksonów genu PTEN są ujemne, zidentyfikowano patogeniczne warianty germinalne w regionie promotora genu PTEN — w szczególności powtarzający się wariant c.-1019_-1018dupTA. Warianty te ograniczają transkrypcję genu PTEN, powodując funkcjonalną haploinsufficję bez zmiany sekwencji kodującej. Standardowe panele nowotworowe sekwencjonują jedynie 9 eksonów kodujących gen PTEN oraz kanoniczne miejsca splicingu; nie obejmują one regionu promotora ani międzygenowych elementów regulacyjnych. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje kompletny locus PTEN, w tym promotor, wszystkie introny oraz 3' UTR — regiony, w których znajdują się regulacyjne warianty patogeniczne.
Zarządzanie ryzykiem wystąpienia wielu nowotworów wymaga ustalenia statusu genu PTEN w jak najwcześniejszym wieku
Ryzyko zachorowania na nowotwory związane z genem PTEN należy do najwyższych spośród wszystkich zespołów dziedzicznych, dlatego badania kontrolne należy rozpocząć już w trzeciej dekadzie życia — zanim większość nowotworów piersi i endometrium w tej populacji będzie można wykryć klinicznie. NCCN zaleca coroczne badania MRI piersi i mammografię od 30. roku życia, a badania kontrolne endometrium od 30. do 35. roku życia. Ten intensywny harmonogram badań uzasadniają dane dotyczące ryzyka w ciągu całego życia, ale jego wdrożenie wymaga potwierdzenia obecności patogennej mutacji genu PTEN. Negatywny wynik niekompletnego panelu — takiego, który nie obejmował oceny promotora PTEN ani rearanżacji strukturalnych — może dawać fałszywe poczucie bezpieczeństwa, co opóźnia niezbędne badania kontrolne o lata.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Learn more →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się zespołem Cowdena — zespołem hamartomaty PTEN oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
