Celiakia — choroba autoimmunologiczna wywołana przez gluten, silnie powiązana genetycznie z genami HLA-DQ2 i HLA-DQ8. Badania genetyczne pozwalają niemal z całą pewnością wykluczyć celiakię lub potwierdzić genetyczną podatność na tę chorobę.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala zidentyfikować warianty genów HLA-DQ2 i HLA-DQ8, które decydują o podatności na gluten, co ułatwia postawienie diagnozy i wykluczenie celiakii u osób z grupy ryzyka.
Celiakia
Celiakia to choroba autoimmunologiczna wywoływana przez spożycie glutenu u osób genetycznie predysponowanych. Częstość występowania wynosi około 1% na całym świecie, przy czym jest wyższa w populacjach o europejskim pochodzeniu. Obraz kliniczny jest bardzo zróżnicowany: klasyczne objawy obejmują zaburzenia wchłaniania (biegunka, steatorrhea, utrata masy ciała), bóle brzucha i zaburzenia wzrostu u dzieci; opryszczkowe zapalenie skóry (swędzące zmiany skórne) występuje u 15–25% pacjentów z celiakią; natomiast objawy nieklasyczne obejmują izolowane podwyższone stężenie enzymów wątrobowych, niedokrwistość, osteoporozę lub objawy neurologiczne. Diagnozę stawia się na podstawie badań serologicznych (przeciwciała IgA przeciwko transglutaminazie tkankowej, przeciwciała przeciwko endomysium) oraz biopsji jelita cienkiego wykazującej zanik kosmków. Co ciekawe, około 98,4% pacjentów z celiakią jest nosicielami genotypów HLA-DQ2 lub HLA-DQ8, co sprawia, że genotypowanie HLA jest potężnym narzędziem diagnostycznym.
HLA-DQ2 i HLA-DQ8 to cząsteczki MHC klasy II, heterodimery łańcuchów α i β kodowane przez ściśle powiązane geny w regionie HLA. HLA-DQ2 składa się z łańcuchów HLA-DQA1*05 i HLA-DQB1*02; HLA-DQ8 składa się z łańcuchów HLA-DQA1*03 i HLA-DQB1*03:02. Cząsteczki te posiadają kieszenie wiążące peptydy o specyficznych wymaganiach dotyczących reszt kotwiczących, które uzupełniają sekwencje peptydów glutenowych. Mechanizm patogeniczny jest mediowany przez komórki T: peptydy glutenowe są deamidowane przez transglutaminazę tkankową, tworząc silne ligandy MHC dla cząsteczek HLA-DQ2 lub HLA-DQ8. Autoreaktywne komórki T rozpoznają te epitopy pochodzące z glutenu prezentowane przez DQ2/DQ8, wyzwalając odpowiedzi Th1 i Th17, które powodują zapalenie jelit i zanik kosmków. Około 30–40% ogółu populacji jest nosicielami DQ2 lub DQ8, ale tylko u 3–5% rozwija się celiakia, co wskazuje, że konieczne są dodatkowe czynniki genetyczne i środowiskowe.
Badanie HLA-DQ2/DQ8 jest szczególnie przydatne w celu wykluczenia choroby: brak DQ2 i DQ8 zasadniczo wyklucza celiakię, wykazując bardzo wysoką wartość predykcyjną ujemną (~100%). Ujemny wynik u pacjenta z objawami serologicznymi sugerującymi celiakię powinien skłonić do ponownego rozważenia diagnozy. Wyniki dodatnie potwierdzają obecność ryzyka HLA, ale nie pozwalają na rozpoznanie celiakii; konieczne są dodatkowe badania (serologiczne i endoskopowe). Badania HLA są szczególnie cenne u pacjentów już stosujących dietę bezglutenową (badania serologiczne mogą dawać fałszywie ujemne wyniki), dzieci poniżej 2 roku życia (badania serologiczne są mniej wiarygodne) oraz krewnych pierwszego stopnia pacjentów z celiakią (ryzyko populacyjne 10–15%). U bezobjawowych członków rodziny z grupy ryzyka brak DQ2/DQ8 pozwala w sposób wiarygodny wykluczyć konieczność badań endoskopowych.
Określenie typów HLA-DQ2/DQ8 jest przydatne w diagnostyce i wykluczaniu chorób w grupach ryzyka. Standardowe zestawy testów mogą mieć ograniczone możliwości w zakresie typowania HLA.
Badanie HLA stanowi skuteczne narzędzie do wykluczenia celiakii
Brak genów HLA-DQ2 i HLA-DQ8 praktycznie wyklucza celiakię, wykazując bardzo wysoką wartość predykcyjną ujemną (~100%). Standardowe badania genetyczne mogą nie obejmować kompleksowego typowania genów HLA-DQA1 i HLA-DQB1. Badania HLA mają jednak swoje ograniczenia: wyniki dodatnie potwierdzają jedynie predyspozycje genetyczne, a nie obecność choroby, ponieważ 30–40% ogółu populacji jest nosicielami DQ2/DQ8, ale tylko u 3–5% rozwija się celiakia. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala na uzyskanie danych dotyczących wariantów HLA, umożliwiając ostateczną ocenę ryzyka HLA-DQ2/DQ8 w celu wsparcia diagnostyki, badań przesiewowych w rodzinie oraz wykluczenia celiakii w sytuacjach diagnostycznych dylematów.
Genotyp HLA decyduje o ryzyku wystąpienia celiakii i stanowi podstawę do przeprowadzania badań przesiewowych w rodzinie
Pacjenci będący nosicielami genów HLA-DQ2 lub HLA-DQ8 są genetycznie narażeni na celiakię; osoby z wynikiem ujemnym dla DQ2/DQ8 mogą być spokojne, ponieważ prawdopodobieństwo wystąpienia celiakii jest u nich niezwykle niskie. W rodzinach, w których występuje znany przypadek celiakii, badanie HLA-DQ2/DQ8 u krewnych pierwszego stopnia pozwala ustalić, kto jest narażony genetycznie (i powinien przejść badania serologiczne), a kto nie (i może uniknąć niepotrzebnej obserwacji). W przypadku pacjentów stosujących już dietę bezglutenową badanie HLA pomaga potwierdzić podejrzenie celiakii, gdy wyniki serologiczne są ujemne z powodu unikania glutenu w diecie. Odnotowany w dokumentacji medycznej genotyp HLA pozwala uniknąć niepotrzebnych ograniczeń dietetycznych u osób niebędących nosicielami i skupić nadzór na nosicielach, u których istnieje rzeczywiste ryzyko genetyczne.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się celiakią oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
