Ryzyko dziedzicznego raka związane z genem ATM — gen odpowiedzialny za naprawę uszkodzeń DNA, znajdujący się na liście dodatkowych wyników ACMG, który wiąże się ze zwiększonym ryzykiem raka piersi, trzustki i prostaty oraz ma bezpośredni wpływ na wrażliwość na inhibitory PARP i chemioterapię opartą na platynie.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala na jednoczesne odczytanie wszystkich 66 eksonów genu ATM — jest to jedyny sposób na niezawodne wykrycie pełnego spektrum wariantów genu ATM, w tym dużych delecji i głębokich wariantów intronowych, które standardowe panele nowotworowe systematycznie pomijają.
Ryzyko raka dziedzicznego związane z genem ATM
Gen ATM (ataxia-telangiectasia mutated) koduje kinazę białkową serynowo-treoninową, która pełni rolę głównego regulatora odpowiedzi na pęknięcia dwuniciowe DNA. Bialleliczne warianty patogeniczne ATM powodują ataksję-teleangiektazję (AT), rzadkie, ciężkie zaburzenie wieloukładowe charakteryzujące się ataksją móżdżkową, apraksją ruchów gałkowych, niedoborem odporności, teleangiektazjami oraz znacznie podwyższonym ryzykiem zachorowania na nowotwory — zwłaszcza nowotwory limfatyczne. Heterozygotyczne warianty patogeniczne ATM, występujące u około 0,5–1% ogółu populacji, są związane z mniej ciężkim, ale klinicznie istotnym zespołem predyspozycji do nowotworów, który został precyzyjnie scharakteryzowany dopiero w ostatnich latach dzięki szeroko zakrojonym badaniom genomiki populacyjnej.
Osoby będące heterozygotycznymi nosicielami genu ATM mają szacowane ryzyko zachorowania na raka piersi w ciągu całego życia wynoszące 20–25% (w porównaniu z około 12% średniej populacyjnej), a wytyczne NCCN zalecają wzmożoną kontrolę w kierunku raka piersi (coroczne badanie MRI piersi od 40. roku życia) dla osób z tym genem. Nosiciele genu ATM są również narażeni na podwyższone ryzyko raka trzustki (około 5–7% w ciągu całego życia, w porównaniu z ~1,5% średniej populacyjnej), podwyższone ryzyko raka prostaty u mężczyzn (szczególnie nowotworów o wysokim stopniu złośliwości) oraz potencjalnie podwyższone ryzyko raka jelita grubego i jajnika. Gen ATM został obecnie uwzględniony na liście wyników ubocznych ACMG SF v3.2, co odzwierciedla konsensus co do tego, że w przypadku zidentyfikowanych nosicieli uzasadnione są zmiany w postępowaniu klinicznym.
Gen ATM ma bezpośrednie znaczenie wykraczające poza stratyfikację ryzyka nowotworowego — jest to biomarker teranostyczny. Nowotwory występujące u pacjentów z niedoborem ATM mogą wykazywać szczególną wrażliwość na leki wykorzystujące defekty szlaków naprawy DNA: inhibitory PARP, chemioterapię opartą na platynie oraz inhibitory kinazy ATM, które są obecnie przedmiotem badań klinicznych. Status ATM w linii germinalnej ma obecnie wpływ na decyzje dotyczące leczenia nowotworów — olaparib został zatwierdzony przez FDA do stosowania w leczeniu przerzutowego raka prostaty opornego na kastrację u pacjentów z patogennymi wariantami ATM, a w badaniach klinicznych ocenia się kombinacje inhibitorów PARP w leczeniu raka trzustki u nosicieli ATM. Ta podwójna rola — zarządzanie ryzykiem nowotworów dziedzicznych i wybór leczenia — sprawia, że kompletne genotypowanie ATM staje się coraz pilniejsze.
Gen ATM składa się z 66 eksonów i ma ponad 3000 udokumentowanych wariantów. Wiele z tych wariantów ma niejasne znaczenie — aby je właściwie zinterpretować, konieczne jest przeprowadzenie pełnego sekwencjonowania genu w kontekście funkcjonalnym.
Gen ATM składa się z 66 eksonów i zawiera tysiące wariantów — w ograniczonych panelach często pomija się rzadkie allele patogenne
Gen ATM jest jednym z największych genów predysponujących do nowotworów; zajmuje obszar 150 kilobaz i zawiera 66 eksonów kodujących. Udokumentowano ponad 3000 wariantów sekwencji genu ATM, z których większość to warianty missense o nieokreślonym znaczeniu. Warianty powodujące skrócenie łańcucha (nonsense, przesunięcie ramki odczytu, warianty w kluczowych miejscach splicingu) są jednoznacznie klasyfikowane jako patogenne w momencie ich wykrycia. Duże delecje ATM — wykrywalne wyłącznie poprzez analizę wariantów liczby kopii — stanowią znaczącą część wariantów patogenicznych ATM w przypadkach nowotworów rodzinnych i nie są niezawodnie wykrywane przez standardowe sekwencjonowanie panelowe. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 66 eksonów wraz z jednoczesną analizą wariantów liczby kopii, co pozwala na rozpoznanie pełnego spektrum wariantów ATM.
Stan genu ATM w linii germinalnej decyduje obecnie o kwalifikacji do leczenia inhibitorami PARP w przypadku raka prostaty
FDA zatwierdziła stosowanie olaparibu (Lynparza) i rucaparibu (Rubraca) w leczeniu przerzutowego raka prostaty opornego na kastrację u pacjentów z patogennymi wariantami genu ATM, występującymi równolegle z wariantami genów BRCA1/2. Dzięki temu zatwierdzeniu badania genetyczne ATM w linii germinalnej bezpośrednio umożliwiają podjęcie leczenia u pacjentów z rakiem prostaty — pacjent, u którego pełna analiza genetyczna wykaże obecność wariantu ATM, może kwalifikować się do monoterapii inhibitorem PARP zamiast chemioterapii. W badaniach klinicznych ocenia się również inhibitory PARP szczególnie w przypadku raka trzustki z dodatnim wynikiem genetycznym ATM w linii germinalnej (schorzenie, w przypadku którego istnieje bardzo niewiele zatwierdzonych opcji leczenia). Do dokładnego określenia statusu somatycznego w porównaniu z linią germinalną oraz oceny kwalifikacji do leczenia wymagane jest pełne genotypowanie ATM — a nie częściowy panel, który może pominąć rzadkie warianty skracające lub strukturalne.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się ryzykiem dziedzicznego raka związanego z genem ATM oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
