Gen
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000149311↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 472↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 11q22.3
- Współrzędne
- Chromosom 11: 108 223 067–108 369 102 (GRCh38)
- Eksony
- 63 eksonów na odcinku 146 kb
- Białko
- 3056 aminokwasów, 350,7 kDa
- Znany również jako
- TEL1, TELO1
- Poprzednie symbole
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Typ locus
- Kodujące białko
Share this page
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atm.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj ATM oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Ataksja-teleangiektazja
- Autosomalne recesywne
Postępująca ataksja móżdżkowa, teleangiektazje, niedobór odporności i predyspozycja do nowotworów wywołane dwuallelicznymi zmianami w genie ATM.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 8 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Rozpoznanie pozwala ukierunkować profilaktykę zakażeń i substytucję immunoglobulinami, ograniczenie narażenia na promieniowanie jonizujące, monitorowanie pod kątem nowotworów i płuc oraz badanie nosicielstwa u krewnych.
Niepłodność kobiet
Zmniejszona lub całkowicie utracona zdolność kobiety do zajścia w ciążę.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 8 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Geny raka piersi i jajnika inne niż BRCA1/2
- Predyspozycja do nowotworów związana z ATMAutosomalne dominujące
Pojedynczy wariant w ATM umiarkowanie zwiększa ryzyko raka piersi i wiąże się z rakiem trzustki i prostaty.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 1 podmiot w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Zazwyczaj zaleca się rozszerzone badania przesiewowe piersi; nosiciele, których partner również ma wariant ATM, mogą chcieć poznać ryzyko ataksji-teleangiektazji u swoich dzieci.
- Dziedziczny rak piersiAutosomalne dominujące
Dziedziczna podatność na raka piersi spowodowana wariantami w jednym z kilku genów.
- 2 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
W zależności od genu może być zalecane wcześniejsze i bardziej intensywne badanie przesiewowe piersi, w tym badanie MRI.
Szersze grupy
Inne wrodzone błędy odporności
- Niedobór odporności
Jeden z 170 powiązanych z nim genów
Choroba, w której dochodzi do niedoboru lub wady mechanizmów odporności, komórkowej lub humoralnej.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 8 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
HSCT w przypadku SCID i ciężkich pierwotnych niedoborów odporności; substytucja immunoglobulinami (IVIG/SCIG) w przypadku niedoborów przeciwciał; leniolisib (Joenja, FDA 2023) w APDS; terapia genowa w ADA-SCID; abatacept w niedoborze CTLA4/LRBA; profilaktyczne antybiotyki; G-CSF w CGD
Dziedziczne choroby neurodegeneracyjne
- Choroba neurodegeneracyjna związana z genem KIF5AAutosomalne dominujące
Jeden z 372 powiązanych z nim genów
Wywoływana przez zmiany w jednej kopii genu KIF5A, który koduje białko motoryczne z końcówką wiążącą ładunek. Różne rodzaje zmian prowadzą do różnych schorzeń: dziedzicznego porażenia spastycznego typu 10, aksonalnej postaci choroby Charcota-Mariego-Tootha oraz stwardnienia zanikowego bocznego (ALS).
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 8 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Leczenie ma charakter objawowy i zależy od obrazu klinicznego; obejmuje fizjoterapię, leki przeciwspastyczne oraz wielospecjalistyczną opiekę w przypadku ALS. Każde dziecko osoby chorej ma 1 szansę na 2 odziedziczenia zmiany; poradnictwo genetyczne pomaga rodzinom zrozumieć to ryzyko.
Budowa genu ATM
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 12,9 kb z 146 kb genu; 9171 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie ATM
2Łatwo
Jak trudno zsekwencjonować ATM krótkimi odczytami, w skali do 100
0 · Łatwo100 · Trudno
Niemal wszystkie eksony ATM znajdują się w miejscach, które krótkie odczyty mapują bez problemu.
Co na to wpływa: udział eksonów ATM w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćOdcinki, w których odczytów 100 lub 250 bp nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 100.0,5%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o zgodności 90% lub więcej. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 60.0%
- Wspólne z chrYRegiony pseudoautosomalne i region X-transpozycji, w których chrX i chrY mają tę samą lub niemal tę samą sekwencję, dlatego odczyt z jednego może zostać przypisany do drugiego. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 60.0%
- Pokrycie sekwencji referencyjnejLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, w których nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 50.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i ciągi jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 30.2,1%
- Zawartość GCOkna z poniżej 25% lub powyżej 65% G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 20.5,4%
Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów ATM w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w żadnym z nich, 100, gdy każda zasada leży tam, gdzie odczytów nie da się jednoznacznie umieścić.
2935
pozycje w ATM, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
11 z nich (0,4%) przypada na regiony, z którymi krótkie odczyty mają trudności.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (11 miejsc)
Genom w całości obejmuje wszystkie 146 kb genu ATM, łącznie z intronami, a nie tylko 12,9 kb eksonów.
Warianty z podstroną (811)
Warianty ATM z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Ekson 18 | 108 268 501 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.2T>C | Ekson 2 | 108 227 626 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.332-1G>A | Intron 4 | 108 235 669 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.496+5G>A | Intron 5 | 108 235 839 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.1122_1123del | Ekson 9 | 108 248 987 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.1607+1G>T | Intron 10 | 108 251 073 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.2251-2A>T | Intron 14 | 108 257 479 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.2251-4A>G | Intron 14 | 108 257 477 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.2466+5G>C | Intron 16 | 108 259 080 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.2639-23_2639-21del | Intron 17 | 108 268 386 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Patogenne warianty ClinVar (3833)
Warianty ATM, które ClinVar klasyfikuje jako patogenne lub prawdopodobnie patogenne w odniesieniu do dowolnej choroby, zweryfikowane przez co najmniej jednego zgłaszającego według kryteriów, oraz te spośród nich, które zostały najczęściej zweryfikowane. Jest to publiczny zapis ClinVar dotyczący genu, a nie wynik badania.
- Patogenny 2826
- Patogenny/prawdopodobnie patogenny 278
- Prawdopodobnie patogenny 729
| Wariant | Choroby | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|
| NM_000051.4(ATM):c.2T>C (p.Met1Thr) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.67C>T (p.Arg23Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.217_218del (p.Glu73fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.332-1G>A | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.387del (p.Asp130fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.467G>A (p.Trp156Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.480_484del (p.Gln161fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.496+5G>A | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.748C>T (p.Arg250Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.790del (p.Tyr264fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.824del (p.Ser274_Leu275insTer) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.1122_1123del (p.Glu376fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.1158del (p.Lys387fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.1355del (p.Thr452fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.1396C>T (p.Gln466Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.1402_1403del (p.Lys468fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.1442T>G (p.Leu481Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.1564_1565del (p.Glu522fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.1607+1G>T | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.1782del (p.Val595fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.2152dup (p.Cys718fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.2251-2A>T | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.2284_2285del (p.Leu762fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.2413C>T (p.Arg805Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000051.4(ATM):c.2508dup (p.Ser837fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Zobacz wszystkie 3833 razem z każdym innym wariantem ATM w ClinVar → (otwiera się w nowej karcie)
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- FMR1fragile X messenger ribonucleoprotein 1Wspólnych schorzeń: 2
- TWNKtwinkle mtDNA helicaseWspólnych schorzeń: 2
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Wspólne schorzenie: 1
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialWspólne schorzenie: 1
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 7Wspólne schorzenie: 1
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Wspólne schorzenie: 1
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseWspólne schorzenie: 1
- ACER3alkaline ceramidase 3Wspólne schorzenie: 1
- ACO2aconitase 2Wspólne schorzenie: 1
- ADAadenosine deaminaseWspólne schorzenie: 1
- ADARadenosine deaminase RNA specificWspólne schorzenie: 1
- ADPRSADP-ribosylserine hydrolaseWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem ATM
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać ATM. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
Pokaż jeszcze 29 cech
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
Pokaż jeszcze 3 cech
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
Pokaż jeszcze 1 cechę
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-21: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.21-c791e85a.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen ATM: ATM serine/threonine kinase. Pobrano 23 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/atm
Dante Labs. Gen ATM: ATM serine/threonine kinase [Internet]. [cytowano 23 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/atm
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni