Niedobór alfa-1-antytrypsyny — częsta genetyczna przyczyna wczesnej postaci rozedmy płuc i chorób wątroby, która pozostaje nierozpoznana średnio przez 7 lat od wystąpienia objawów.
Sekwencjonowanie całego genomu pozwala odczytać cały gen SERPINA1, identyfikując wszystkie allele Pi — w tym rzadkie kombinacje heterozygotyczne — w celu ustalenia pełnego genotypu i przewidzenia ryzyka wystąpienia chorób płuc i wątroby.
Niedobór alfa-1-antytrypsyny
Niedobór alfa-1-antytrypsyny (AATD) to autosomalna choroba kodominująca spowodowana patogennymi wariantami genu SERPINA1, kodującego alfa-1-antytrypsynę (AAT) — inhibitor proteazy serynowej wytwarzany głównie w komórkach wątroby, który chroni miąższ płuc przed zniszczeniem wywołanym przez elastazę neutrofilową. Szacuje się, że AATD dotyka 1 na 2500 osób pochodzenia europejskiego i około 3,4 miliona ludzi na całym świecie, co czyni ją jedną z najczęstszych poważnych chorób monogenicznych — jednak nadal jest ona chronicznie i poważnie niedodiagnozowana. Mediana czasu od wystąpienia pierwszych objawów oddechowych do postawienia diagnozy wynosi 7–8 lat, podczas których dochodzi do kumulacji nieodwracalnych uszkodzeń płuc.
Allele SERPINA1 są oznaczane zgodnie z nomenklaturą Pi (inhibitor proteazy). Allelem normalnym jest Pi*M. Najbardziej istotne klinicznie warianty to Pi*Z (p.Glu342Lys; rs28929474) oraz Pi*S (p.Glu264Val; rs17580). Homozygoty Pi*ZZ — genotyp o najcięższym przebiegu choroby — mają stężenie AAT w surowicy wynoszące około 15% normy, co wynika zarówno ze zmniejszonego wydzielania, jak i wewnątrzwątrobowej polimeryzacji nieprawidłowo sfałdowanego białka Z. Złożone heterozygoty Pi*SZ mają stężenie AAT wynoszące około 40% normy i są narażone na podwyższone, ale mniejsze ryzyko chorób płuc. Polimeryzujące białko Z gromadzi się w hepatocytach, powodując postępującą chorobę wątroby (marskość wątroby, rak wątrobowokomórkowy) u podgrupy osób z genotypem Pi*ZZ poprzez odrębny toksyczny mechanizm wzmocnienia funkcji, niezależny od szlaku choroby płuc.
Terapia wspomagająca polegająca na dożylnym podawaniu inhibitora proteazy alfa-1 (Prolastin, Zemaira, Aralast) spowalnia postęp rozedmy płuc u pacjentów z genotypem Pi*ZZ i rozpoznaną obturacją dróg oddechowych — jest to jedyna zatwierdzona metoda leczenia przeznaczona specjalnie dla tej choroby. Korzyści w zakresie przeżywalności są najbardziej widoczne, gdy terapię rozpoczyna się przed wystąpieniem znacznego uszkodzenia płuc. Palenie tytoniu dramatycznie przyspiesza rozwój choroby płuc w AATD; palacze z Pi*ZZ tracą funkcję płuc 3–4 razy szybciej niż osoby niepalące z AATD. Wczesna diagnoza umożliwia udzielenie porad dotyczących rzucenia palenia przed wystąpieniem nieodwracalnych uszkodzeń, unikanie narażenia zawodowego na pył i opary oraz rozpoczęcie terapii wspomagającej w optymalnym stadium choroby.
Opisano ponad 120 wariantów genu SERPINA1. Rzadkie allele (Pi*I, Pi*F, Pi*P, Pi*Null) powodują występowanie szerokiego spektrum fenotypów niedoboru AAT, od niedoboru pośredniego po całkowity brak białka wydzielanego.
W standardowych badaniach AATD sprawdza się wyłącznie allele Z i S. Pełne genotypowanie SERPINA1 wymaga ustalenia pełnej struktury allelicznej — w tym rzadkich alleli, które decydują o tym, czy u pacjenta występuje AATD, czy też jest on jedynie nosicielem jednego allela powodującego niedobór.
W przypadku heterozygot złożonych Pi*SZ często dochodzi do pominięcia wyników w dwuskładnikowych testach Z/S
Testy przesiewowe w kierunku AATD wykonywane w punktach opieki oraz w standardowych laboratoriach są zoptymalizowane pod kątem wykrywania allelu Z (Pi*Z) i wskazują genotypy Pi*MZ lub Pi*ZZ. Złożona heterozygotyczność Pi*SZ — która wiąże się ze znacznym ryzykiem wystąpienia chorób płuc i występuje u około 1 na 625 osób pochodzenia europejskiego — wymaga jednoczesnej charakterystyki zarówno allelu Z, jak i S. Rzadkie warianty SERPINA1, które nie są uwzględnione w ograniczonych panelach, powodują poziomy AAT równoważne Pi*MZ lub Pi*ZZ u pacjentów, którzy uzyskują wynik „normalny” w badaniach przesiewowych obejmujących wyłącznie allel Z. Pełne genotypowanie SERPINA1 poprzez sekwencjonowanie całego genomu pozwala na jednoczesną identyfikację wszystkich alleli, w tym rzadkich kombinacji heterozygotycznych, które w badaniach binarnych wydają się normalne.
Rozróżnienie między typami Pi*MZ a Pi*ZZ pozwala określić, czy pacjent kwalifikuje się do terapii wspomagającej
Wytyczne NICE, ERS i ATS zalecają terapię wspomagającą z użyciem AAT u pacjentów z genotypem Pi*ZZ i Pi*null, u których rozpoznano obturacyjną chorobę płuc — nie dotyczy to nosicieli genotypu Pi*MZ. Kliniczne i finansowe konsekwencje tego rozróżnienia genotypowego są znaczące: terapia wspomagająca kosztuje około 50 000–100 000 dolarów rocznie. Dokładne genotypowanie pozwala odróżnić pacjentów kwalifikujących się do terapii wspomagającej od nosicieli, którzy wymagają jedynie obserwacji i poradnictwa w zakresie czynników ryzyka. Bez pełnego genotypowania SERPINA1 pacjent z genotypem Pi*SZ i bardzo niskim stężeniem AAT może zostać błędnie sklasyfikowany jako Pi*MZ i pozbawiony odpowiedniego leczenia — lub odwrotnie, nosicielowi genotypu Pi*MZ z współistniejącą POChP może zostać przepisana terapia wspomagająca, której wytyczne dotyczące AATD nie popierają.
Cały Twój genom (a nie tylko jego fragment)
Tradycyjne badania genetyczne ograniczają się do niewielkich zestawów genów, pomijając większość genomu. My sekwencjonujemy cały genom — każdy gen i każdy region między genami.
Kompleksowe analizy i specjalistyczne raporty
Przejrzysta i zawierająca wskazówki, na podstawie których Ty i Twój lekarz możecie podjąć odpowiednie działania. To nie jest dokument wymagający interpretacji — ponad 200 raportów klinicznych, uporządkowanych według kategorii.
Z roku na rok Twoje badanie zyskuje na wartości
Twoje DNA pozostaje niezmienne, ale nauka o genomie rozwija się w zawrotnym tempie. Co miesiąc odkrywane są nowe powiązania między wariantami genetycznymi a chorobami. Weryfikujemy te wyniki i automatycznie aktualizujemy Twoje raporty. Twoje badanie z roku na rok zyskuje na wartości.
Wyniki, które lekarze osiągają w najtrudniejszych przypadkach.
Czterdzieści lat niepewności. Jeden test.
Pacjent spędził dziesiątki lat w brytyjskiej służbie zdrowia bez postawionej diagnozy. Dane z serwisu Dante, przyjęte przez zespoły kliniczne NHS w Queen Elizabeth University Hospital w Glasgow, pozwoliły zidentyfikować zespół Noonana oraz wariant genu RUNX1 związany z białaczką, który dotychczas pozostawał niewykryty. Po 40 latach w końcu otrzymali odpowiedź.
Pełna lektura pozwala uzyskać pełny obraz sytuacji.
Pacjent zgłosił się do Dante w celu zbadania przypadków okresowego porażenia. Analiza całego genomu pozwoliła wykryć współistniejące dziedziczne schorzenie serca – zespół Brugady – co lekarz potwierdził za pomocą EKG. Wynik ten wyjaśnił również niejasną historię chorób serca u jednego z członków rodziny. Jedno badanie. Wszystkie odpowiedzi w jednym miejscu.
Sekwencjonowanie przeprowadzono w 2019 roku. Dane przetworzono w 2021 roku.
Jennifer zleciła sekwencjonowanie swojego genomu w firmie Dante dwa lata przed rozpoznaniem raka piersi. Kiedy rozpoczęto leczenie, dane farmakogenomiczne firmy Dante wykazały, że przepisana jej chemioterapia spowoduje poważne skutki uboczne. Jej lekarz wybrał alternatywne rozwiązanie — dzięki czemu mogła rozpocząć skuteczne leczenie już od pierwszego dnia.
Każde pytanie dotyczące genetyki zasługuje na wyczerpującą odpowiedź.
Niezależnie od tego, czy szukasz odpowiedzi już dziś, czy też chcesz zadbać o swoje zdrowie na przyszłość, kompletny zapis całego genomu to jedyny punkt wyjścia.
To rodzinne. Teraz możesz sprawdzić, czy masz to w genach.
Twój genom zawiera odziedziczone warianty związane z chorobami, takimi jak schorzenia serca, nowotwory i choroby neurologiczne. Analizujemy je wszystkie — z uwzględnieniem aspektów klinicznych, aby nadać wynikom odpowiedni kontekst.
Dowiedz się więcej →Kiedy wyniki standardowych badań laboratoryjnych wskazują, że wszystko jest w porządku, a Ty wiesz, że tak nie jest.
Standardowe testy diagnostyczne sprawdzają z góry określony zestaw wyników. My sekwencjonujemy cały Twój genom — w tym fragmenty, których żaden test nie został zaprojektowany do badania. Jeśli odpowiedź znajduje się w Twoim genomie, pomożemy Ci ją znaleźć.
Dowiedz się więcej →Twoja diagnoza może być słuszna. Twój plan leczenia może być niekompletny.
To Twoje geny decydują o tym, które metody leczenia mają największe szanse powodzenia, a które nie. Dostarczamy Twojemu lekarzowi narzędzia i informacje niezbędne do opracowania planu leczenia.
Dowiedz się więcej →Chcesz to wiedzieć, zanim coś zmusi cię do zadania tego pytania.
Niektórzy nie czekają na diagnozę ani na wyniki badań dotyczących historii chorób w rodzinie, aby podjąć działania. Sekwencjonowanie całego genomu pozwala uzyskać pełny obraz genetyczny już teraz — dzięki czemu Ty i Twój lekarz możecie podjąć świadomą decyzję, zanim sytuacja stanie się pilna.
Dowiedz się więcej →Zrobiłeś już test DNA. Oto, czego nie udało mu się ustalić.
Większość testów DNA dostępnych na rynku analizuje mniej niż 0,1% Twojego genomu. My analizujemy go w całości.
Dowiedz się więcej →Wyniki na poziomie klinicznym. Wybierane przez pacjentów, cieszące się zaufaniem lekarzy w najbardziej skomplikowanych przypadkach.
Test Dante Genome pomógł specjalistom z brytyjskiego szpitala ostrych przypadków w rozpoznaniu zespołu Noonana oraz rzadkiego wariantu genetycznego związanego z białaczką, który wcześniej pozostawał niewykryty. Wynik ten wpłynął na zmianę sposobu leczenia pacjenta.
Akredytowane przez i opublikowane w
Najczęściej zadawane pytania dotyczące sekwencjonowania całego genomu.
Jaka jest różnica między sekwencjonowaniem całego genomu a ukierunkowanym badaniem genetycznym?
Ukierunkowane badania genetyczne — w tym standardowe panele nowotworów dziedzicznych — analizują z góry określoną listę znanych wariantów w konkretnym zestawie genów. Są one zaprojektowane tak, aby wykrywać to, czego już się szuka. Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje cały genom: wszystkie 6 miliardów par zasad, każdy gen oraz każdy odcinek między genami. Badanie Mayo Clinic opublikowane w czasopiśmie JAMA Oncology wykazało, że standardowe wytyczne dotyczące badań pomijały ponad połowę pacjentów z dziedzicznymi mutacjami nowotworowymi. Test genomowy nie posiada ustalonej listy.
Co otrzymam, gdy wyniki będą gotowe?
Usługa Dante Genome zapewnia ponad 200 gotowych do wykorzystania przez lekarzy raportów pogrupowanych według kategorii klinicznych — nowotwory dziedziczne, choroby serca, choroby rzadkie, farmakogenomika, status nosicielstwa i inne. Raporty są przesyłane do Twojego bezpiecznego konta Genome Manager i mają format umożliwiający bezpośrednie wykorzystanie w praktyce klinicznej. Twoje dane genomowe są przechowywane na stałe i automatycznie poddawane ponownej analizie w miarę postępu nauki.
Co się stanie, jeśli wykryje się wariant o znaczeniu klinicznym?
W przypadku wykrycia wariantu patogennego lub potencjalnie patogennego zostanie on wyraźnie zaznaczony w raporcie przeznaczonym dla lekarza, zawierającym kontekst kliniczny, opublikowane dane naukowe oraz zalecane dalsze działania. Zalecamy przekazanie wszelkich istotnych klinicznie wyników lekarzowi lub doradcy genetycznemu, którzy mogą pomóc w podjęciu decyzji dotyczących monitorowania, ograniczania ryzyka lub badań kaskadowych u członków rodziny.
Czym różni się to od testów DNA dla konsumentów, takich jak 23andMe czy AncestryDNA?
W testach DNA dla konsumentów wykorzystuje się chipy do genotypowania, które odczytują mniej niż 0,1% genomu – niewielki, wstępnie wybrany zestaw powszechnych wariantów. Są one zoptymalizowane pod kątem pochodzenia i cech populacyjnych, a nie klinicznych wyników genetycznych. Test Dante Genome sekwencjonuje 100% genomu pacjenta z 30-krotnym pokryciem, co stanowi ten sam standard, jaki stosuje się w diagnostyce klinicznej. Oba testy nie są porównywalne pod względem zakresu, metodologii ani przydatności klinicznej.
Jak długo trzeba czekać na wyniki i w jaki sposób są one przekazywane?
Zestaw do pobrania próbek zostanie wysłany w ciągu 48 godzin od złożenia zamówienia. Po dostarczeniu próbki do naszego laboratorium posiadającego certyfikat CLIA sekwencjonowanie i analiza trwają od 6 do 8 tygodni. Wyniki są bezpiecznie przekazywane do Twojego konta Genome Manager, gdzie możesz przeglądać raporty, udostępniać je swojemu lekarzowi oraz otrzymywać automatyczne powiadomienia o nowych odkryciach, które zostały zweryfikowane w odniesieniu do Twojego genomu.
Współpracujemy z organizacjami wspierającymi pacjentów na całym świecie.
Dante Labs współpracuje z grupami wsparcia pacjentów każdej wielkości — zajmującymi się niedoborem alfa-1-antytrypsyny oraz innymi schorzeniami, zarówno rzadkimi, jak i powszechnymi. Wspieramy grupy w każdym kraju, w tym wirtualne grupy wsparcia pacjentów.
Oferujemy spersonalizowane raporty, zniżki grupowe oraz pakiety dostosowane do potrzeb Państwa członków. Prosimy o kontakt za pośrednictwem formularza, a my odezwiemy się w ciągu dwóch dni roboczych.
- Indywidualne raporty genomowe dla Państwa członków
- Zniżki grupowe i pakiety dostosowane do indywidualnych potrzeb
- Każdy kraj — w tym grupy wirtualne
- Obejmuje zarówno rzadkie, jak i powszechne schorzenia
Otrzymałem wiadomość.
Skontaktujemy się z Państwem w ciągu 2 dni roboczych. Aby skontaktować się z nami bezpośrednio: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpowiedzi na całe życie.
Jeden zestaw, dostarczony prosto do Twojego domu. Sekwencjonowanie całego genomu zgodnie ze standardami klinicznymi stosowanymi przy podejmowaniu decyzji diagnostycznych. Ponad 200 raportów gotowych do wykorzystania przez lekarzy, dostarczanych do Twojego menedżera genomu w ciągu 6–8 tygodni — na stałe i aktualizowanych wraz z postępem nauki.
Wysyłka w ciągu 48 godzin · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
